163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_00900 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_00900  transcriptional regulator, CarD family  100 
 
 
176 aa  346  1e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  8.92061e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0185  CarD family transcriptional regulator  64.33 
 
 
158 aa  218  5e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164199  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0164  transcriptional regulator, CarD family  59.87 
 
 
161 aa  203  8e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.475576  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0259  transcriptional regulator, CarD family  59.87 
 
 
158 aa  201  3e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  1.16082e-07  normal  0.0229238 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2489  CarD family transcriptional regulator  57.32 
 
 
158 aa  199  2e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00883814  normal  0.0681247 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0399  transcriptional regulator, CarD family  59.49 
 
 
159 aa  195  3e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00433509  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0184  CarD family transcriptional regulator  57.32 
 
 
158 aa  194  5e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  4.61905e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2940  CarD family transcriptional regulator  57.14 
 
 
158 aa  186  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0340  transcriptional regulator, CarD family  58.67 
 
 
159 aa  186  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.18012  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0173  transcriptional regulator, CarD family  57.14 
 
 
159 aa  183  9e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0392  transcriptional regulator, CarD family  53.5 
 
 
158 aa  182  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  3.62697e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1901  transcriptional regulator, CarD family  49.36 
 
 
159 aa  173  9e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.488949  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13616  transcription factor  49.04 
 
 
162 aa  172  3e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.392977 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2907  CarD family transcriptional regulator  50.64 
 
 
160 aa  171  5e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1444  CarD family transcriptional regulator  48.41 
 
 
162 aa  169  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.250117 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5340  CarD family transcriptional regulator  48.41 
 
 
162 aa  169  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0703  transcriptional regulator, CarD family  50.64 
 
 
160 aa  169  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0540347  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4319  transcriptional regulator, CarD family  48.72 
 
 
160 aa  167  9e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0364  transcriptional regulator, CarD family  49.04 
 
 
162 aa  165  3e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.376987  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5126  CarD family transcriptional regulator  47.13 
 
 
162 aa  165  4e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.593452 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4826  CarD family transcriptional regulator  47.13 
 
 
162 aa  165  4e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.652741  normal  0.999363 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4740  CarD family transcriptional regulator  47.13 
 
 
162 aa  165  4e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35090  transcriptional regulator, CarD family  48.1 
 
 
163 aa  163  1e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.86286 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0501  CarD family transcriptional regulator  48.72 
 
 
163 aa  163  1e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2959  transcriptional regulator, CarD family  48.08 
 
 
160 aa  162  2e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0601  transcriptional regulator, CarD family  46.5 
 
 
162 aa  162  3e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.251005  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0963  CarD family transcriptional regulator  47.44 
 
 
160 aa  160  8e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0866  transcriptional regulator, CarD family  47.13 
 
 
160 aa  159  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.795809 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4255  CarD family transcriptional regulator  48.08 
 
 
160 aa  160  1e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0362  CarD family transcriptional regulator  48.08 
 
 
160 aa  160  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0755625  hitchhiker  0.00187432 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03770  transcriptional regulator, CarD family  48.1 
 
 
160 aa  159  2e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0832449  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0852  transcriptional regulator, CarD family  47.13 
 
 
160 aa  159  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0726  CarD family transcriptional regulator  47.13 
 
 
160 aa  159  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31820  transcriptional regulator, CarD family  46.79 
 
 
160 aa  159  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0651  transcriptional regulator, CarD family  46.79 
 
 
160 aa  157  5e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.058243  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0898  transcriptional regulator, CarD family  46.15 
 
 
160 aa  157  6e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00538334 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09270  transcriptional regulator, CarD family  46.79 
 
 
160 aa  157  9e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0773  transcriptional regulator, CarD family  46.79 
 
 
160 aa  156  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.164526  normal  0.216229 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2077  transcriptional regulator, CarD family  45.28 
 
 
161 aa  156  1e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.90671  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1687  transcriptional regulator, CarD family  52.86 
 
 
171 aa  156  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.613225  normal  0.385121 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0970  transcription factor CarD  45.51 
 
 
162 aa  155  3e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0421613  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0078  CarD family transcriptional regulator  48.72 
 
 
160 aa  153  1e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.805764 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4262  transcription factor CarD  45.28 
 
 
161 aa  152  3e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.102192 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4692  CarD family transcriptional regulator  45.28 
 
 
161 aa  152  3e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.372756  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0663  transcriptional regulator, CarD family  47.44 
 
 
160 aa  151  6e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.471723  hitchhiker  0.000789071 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03720  transcriptional regulator, CarD family  43.59 
 
 
160 aa  150  1e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1245  transcriptional regulator, CarD family  47.24 
 
 
168 aa  149  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  6.22315e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4040  CarD family transcriptional regulator  44.59 
 
 
161 aa  149  3e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8145  transcriptional regulator, CarD family  47.44 
 
 
160 aa  147  9e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1271  CarD family transcriptional regulator  41.92 
 
 
171 aa  144  6e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0355661  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2592  transcriptional regulator, CarD family  41.92 
 
 
171 aa  144  6e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0112448  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2685  transcriptional regulator, CarD family  41.92 
 
 
171 aa  144  6e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.000114953  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0142  transcriptional regulator, CarD family  43.04 
 
 
161 aa  144  6e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.432895  normal  0.208842 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3388  CarD family transcriptional regulator  42.04 
 
 
159 aa  144  8e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3655  CarD family transcriptional regulator  45.96 
 
 
159 aa  142  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  5.63805e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2498  CarD family transcriptional regulator  43.31 
 
 
171 aa  141  4e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.860997  hitchhiker  0.00028149 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4857  CarD family transcriptional regulator  38.12 
 
 
164 aa  135  3e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4851  transcriptional regulator, CarD family  38.12 
 
 
164 aa  135  3e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.906261  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4447  CarD family transcriptional regulator  38.12 
 
 
164 aa  134  6e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.948938  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4833  transcriptional regulator, CarD family  38.12 
 
 
164 aa  134  6e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4465  CarD family transcriptional regulator  38.12 
 
 
164 aa  134  6e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3244  CarD family transcriptional regulator  42.31 
 
 
155 aa  129  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4522  transcriptional regulator, CarD family  38.85 
 
 
162 aa  128  4e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.76792  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0409  transcriptional regulator, CarD family  39.38 
 
 
164 aa  128  4e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4827  transcriptional regulator, CarD family  38.75 
 
 
164 aa  128  4e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0104  putative transcriptional regulator  40 
 
 
161 aa  127  6e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2821  CarD family transcriptional regulator  39.26 
 
 
188 aa  127  8e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  9.11518e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4546  CarD family transcriptional regulator  40.13 
 
 
159 aa  127  9e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1065  CarD family transcriptional regulator  41.18 
 
 
153 aa  127  1e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0695746  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0598  CarD-like protein  41.29 
 
 
198 aa  127  1e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.80876 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3335  CarD family transcriptional regulator  39.74 
 
 
158 aa  125  4e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.512684  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0751  transcriptional_regulator  40.65 
 
 
197 aa  124  5e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.024387  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0553  CarD family transcriptional regulator  37.34 
 
 
186 aa  124  9e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.106892 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2164  transcriptional regulator, CarD family  39.87 
 
 
153 aa  122  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4611  CarD family transcriptional regulator  39.86 
 
 
153 aa  122  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4967  CarD family transcriptional regulator  41.48 
 
 
148 aa  122  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0352786  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3676  CarD family transcriptional regulator  38.46 
 
 
158 aa  120  1e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2880  CarD family transcriptional regulator  37.82 
 
 
158 aa  118  4e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3201  transcriptional regulator, CarD family  38.89 
 
 
174 aa  116  1e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2124  transcriptional regulator, CarD family  39.62 
 
 
161 aa  116  2e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0696719  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3438  CarD family transcriptional regulator  37.18 
 
 
158 aa  115  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.270269  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3350  CarD family transcriptional regulator  37.18 
 
 
158 aa  115  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3658  transcriptional regulator, CarD family  37.18 
 
 
158 aa  115  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3708  CarD family transcriptional regulator  37.18 
 
 
158 aa  115  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.672649  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1560  transcriptional regulator, CarD family  36.54 
 
 
158 aa  115  4e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.879343  normal  0.22005 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3756  transcriptional regulator, CarD family  36.54 
 
 
158 aa  114  5e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3681  transcriptional regulator, CarD family  36.54 
 
 
158 aa  113  1e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0786327  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3401  CarD family transcriptional regulator  36.54 
 
 
158 aa  113  1e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2290  transcriptional regulator, putative  37.25 
 
 
208 aa  109  2e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0842  transcriptional regulator, CarD family  35.63 
 
 
174 aa  102  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  5.02927e-07  normal  0.471539 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1561  CarD family transcriptional regulator  33.13 
 
 
171 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0294353  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0676  transcriptional regulator, CarD family  34.78 
 
 
176 aa  99.8  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  2.6469e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1516  transcriptional regulator, CarD family  30.63 
 
 
191 aa  98.2  5e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2129  CarD family transcriptional regulator  33.33 
 
 
171 aa  97.8  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  4.17327e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0490  transcriptional regulator, CarD family  32.52 
 
 
171 aa  96.7  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00257809 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1455  transcriptional regulator, CarD family  34.75 
 
 
171 aa  94  9e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000871292  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4352  transcriptional regulator CarD family  28.12 
 
 
223 aa  87.4  8e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3379  CarD family transcriptional regulator  28.57 
 
 
190 aa  87.8  8e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  8.18177e-08  n/a   
 
 
 
NC_009511  Swit_3537  CarD family transcriptional regulator  30.13 
 
 
172 aa  85.9  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.92305  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0124  CarD family transcriptional regulator  32.41 
 
 
174 aa  85.1  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>