More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_00740 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_00740  transcription elongation factor GreA  100 
 
 		 161 aa  320  6e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000778945  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0809  transcription elongation factor GreA  61.78 
 
 		 157 aa  195  3e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000158219  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2897  transcription elongation factor GreA  60.39 
 
 		 159 aa  187  5e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2782  transcription elongation factor GreA  55.26 
 
 		 158 aa  181  3e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2468  transcription elongation factor GreA  55.26 
 
 		 158 aa  181  3e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0162  transcription elongation factor GreA  64.47 
 
 		 156 aa  179  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  7.34558e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0658  transcription elongation factor GreA  57.62 
 
 		 162 aa  177  4.999999999999999e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211465  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0151  GreA/GreB family elongation factor  58.44 
 
 		 160 aa  177  8e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000044733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0250  transcription elongation factor GreA  60.53 
 
 		 158 aa  176  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000127535  normal  0.353375 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0395  transcription elongation factor GreA  56.41 
 
 		 158 aa  176  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0174  transcription elongation factor GreA  60.53 
 
 		 158 aa  175  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153177  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0208  transcription elongation factor GreA  60.39 
 
 		 158 aa  173  9e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000182043  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0130  transcription elongation factor GreA  53.55 
 
 		 163 aa  172  9.999999999999999e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000129551  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0737  transcription elongation factor GreA  53.69 
 
 		 175 aa  164  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.718576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0972  transcription elongation factor GreA  54.14 
 
 		 158 aa  164  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4499  transcription elongation factor GreA  53.69 
 
 		 175 aa  164  5e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2481  transcription elongation factor GreA  53.5 
 
 		 159 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4275  transcription elongation factor GreA  53.69 
 
 		 158 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282937  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4112  transcription elongation factor GreA  53.69 
 
 		 158 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4123  transcription elongation factor GreA  53.69 
 
 		 158 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3092  transcription elongation factor GreA  53.69 
 
 		 158 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4607  transcription elongation factor GreA  53.69 
 
 		 158 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4512  transcription elongation factor GreA  53.69 
 
 		 158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000192957  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4461  transcription elongation factor GreA  53.69 
 
 		 158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.310238  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4459  transcription elongation factor GreA  53.69 
 
 		 175 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0719149 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0115  GreA/GreB family elongation factor  52.6 
 
 		 159 aa  160  6e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000137367  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4226  transcription elongation factor GreA  51.68 
 
 		 175 aa  158  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0116  transcription elongation factor GreA  61.84 
 
 		 164 aa  155  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000184686  hitchhiker  0.00194606 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1680  transcription elongation factor GreA  51.37 
 
 		 161 aa  155  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1648  transcription elongation factor GreA  54.48 
 
 		 159 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0472  transcription elongation factor GreA  49.34 
 
 		 160 aa  149  1e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.384084  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2181  transcription elongation factor GreA  48.68 
 
 		 154 aa  148  3e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.015275  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0660  transcription elongation factor GreA  50 
 
 		 156 aa  144  3e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.143981  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2353  transcription elongation factor GreA  46.36 
 
 		 157 aa  144  6e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000000957781  decreased coverage  0.00150302 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1246  transcription elongation factor GreA  46.1 
 
 		 162 aa  143  8.000000000000001e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0270341  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2523  transcription elongation factor GreA  48.39 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182345  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1389  transcription elongation factor  50.33 
 
 		 160 aa  142  3e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  3.76815e-17  hitchhiker  8.922560000000001e-24 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1611  transcription elongation factor GreA  46.45 
 
 		 158 aa  141  5e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.69568e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0627  transcription elongation factor GreA  50 
 
 		 157 aa  140  5e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2078  transcription elongation factor GreA  48.39 
 
 		 158 aa  140  8e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000287405  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1002  transcription elongation factor GreA  49.67 
 
 		 156 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000716767  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1277  transcription elongation factor GreA  48.39 
 
 		 158 aa  138  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000293441  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2239  transcription elongation factor GreA  51.77 
 
 		 156 aa  138  3e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000131275  normal  0.39945 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1901  transcription elongation factor GreA  47.1 
 
 		 158 aa  137  6e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00416559  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2307  transcription elongation factor GreA  47.74 
 
 		 158 aa  137  6e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1128  transcription elongation factor GreA  48.34 
 
 		 156 aa  137  7e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000607304  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0008  transcription elongation factor GreA  47.33 
 
 		 157 aa  136  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000636821  hitchhiker  0.00000229317 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19500  transcription elongation factor GreA  50.32 
 
 		 155 aa  136  2e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000496817  unclonable  0.000000000539704 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1377  transcription elongation factor GreA  49.36 
 
 		 156 aa  135  2e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1865  transcription elongation factor GreA  47.1 
 
 		 158 aa  135  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182493  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1775  transcription elongation factor GreA  47.44 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000308338  normal  0.0541245 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1214  transcription elongation factor GreA  49.33 
 
 		 158 aa  135  2e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000531032  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0289  transcription elongation factor GreA  48.28 
 
 		 160 aa  135  2e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13240  transcription elongation factor GreA  51.77 
 
 		 156 aa  134  5e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00714364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1667  transcription elongation factor GreA  57.75 
 
 		 158 aa  132  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1701  transcription elongation factor GreA  57.75 
 
 		 158 aa  132  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1781  transcription elongation factor GreA  44.87 
 
 		 159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.695085  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0077  transcription elongation factor GreA  46.67 
 
 		 157 aa  132  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00207801  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1612  transcription elongation factor GreA  49.25 
 
 		 160 aa  131  3.9999999999999996e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.986319  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1174  transcription elongation factor GreA  57.04 
 
 		 158 aa  130  6e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1676  transcription elongation factor GreA  47.68 
 
 		 155 aa  130  6.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000127836  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3557  transcription elongation factor GreA  47.71 
 
 		 160 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000103558  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1242  transcription elongation factor GreA  44.3 
 
 		 164 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000024894  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0669  transcription elongation factor GreA  42 
 
 		 159 aa  128  3e-29  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1155  transcription elongation factor GreA  49.01 
 
 		 156 aa  128  4.0000000000000003e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl102  transcription elongation factor GreA  46.81 
 
 		 156 aa  127  6e-29  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2887  transcription elongation factor GreA  43.71 
 
 		 157 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1564  transcription elongation factor GreA  42.04 
 
 		 160 aa  127  8.000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000290434  hitchhiker  0.000735134 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1854  transcription elongation factor GreA  43.59 
 
 		 159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.866249  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2312  transcription elongation factor GreA  44.97 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.693473  hitchhiker  0.00295599 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1672  transcription elongation factor GreA  42.31 
 
 		 159 aa  123  8.000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.112053  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1688  transcription elongation factor GreA  40.94 
 
 		 156 aa  123  9e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.833443 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1733  transcription elongation factor GreA  46.71 
 
 		 158 aa  123  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.669906  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1851  transcription elongation factor GreA  44.81 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.888423  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1188  transcription elongation factor GreA  45.81 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00439545  normal  0.0602948 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3619  transcription elongation factor GreA  44.52 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1466  transcription elongation factor GreA  42.95 
 
 		 176 aa  122  3e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0366416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0910  transcription elongation factor GreA  42.95 
 
 		 157 aa  121  5e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4293  transcription elongation factor GreA  42.76 
 
 		 157 aa  121  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1129  GreA/GreB family elongation factor  46.62 
 
 		 158 aa  121  5e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2118  transcription elongation factor GreA  41.56 
 
 		 157 aa  120  5e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0940  transcription elongation factor GreA  45.39 
 
 		 172 aa  120  8e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0495  transcription elongation factor GreA  42.31 
 
 		 160 aa  120  9e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.588124  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1146  transcription elongation factor GreA  44.08 
 
 		 158 aa  120  9e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1372  transcription elongation factor GreA  42.67 
 
 		 161 aa  119  9.999999999999999e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3030  transcription elongation factor GreA  42.95 
 
 		 152 aa  120  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.953757  decreased coverage  0.00490744 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0906  transcription elongation factor GreA  42.04 
 
 		 160 aa  120  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2213  transcription elongation factor GreA  43.71 
 
 		 158 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1631  transcription elongation factor GreA  41.22 
 
 		 158 aa  119  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0576288  hitchhiker  0.00568101 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4606  transcription elongation factor GreA  42.95 
 
 		 158 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.127343  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2571  transcription elongation factor GreA  46.1 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000433551  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0638  transcription elongation factor GreA  45.51 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2780  transcription elongation factor GreA  46.05 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.115654  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0566  transcription elongation factor GreA  40.26 
 
 		 179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0510993  normal  0.103581 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2677  GreA/GreB family elongation factor  44 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0788  transcription elongation factor GreA  45.51 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3076  transcription elongation factor GreA  43.71 
 
 		 171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2139  transcription elongation factor GreA  40.52 
 
 		 157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.194554 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2866  transcription elongation factor GreA  46.71 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3357  transcription elongation factor GreA  46.2 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.970031  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>