25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_00720 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_00720  hypothetical protein  100 
 
 
305 aa  618  1e-176  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000877673  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0807  hypothetical protein  62.75 
 
 
302 aa  386  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00370253  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0112  hypothetical protein  52.15 
 
 
304 aa  339  2.9999999999999998e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000282861  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0475  hypothetical protein  53.36 
 
 
299 aa  336  2.9999999999999997e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0149  hypothetical protein  55.48 
 
 
300 aa  335  7.999999999999999e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0567257  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0114  hypothetical protein  53.18 
 
 
302 aa  329  4e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0358289  hitchhiker  0.00078389 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2695  hypothetical protein  49.35 
 
 
317 aa  322  6e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0587  hypothetical protein  50.33 
 
 
303 aa  317  1e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0873705  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3630  dehydrogenase-like protein  49.84 
 
 
312 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.496684  normal  0.352042 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1511  hypothetical protein  52.19 
 
 
301 aa  312  3.9999999999999997e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.850305  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2025  hypothetical protein  47.83 
 
 
299 aa  303  2.0000000000000002e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0375526  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1830  hypothetical protein  47.52 
 
 
304 aa  295  7e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.290615 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0492  hypothetical protein  48.15 
 
 
334 aa  291  1e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1617  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  32.59 
 
 
685 aa  191  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1330  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  32.91 
 
 
685 aa  189  5e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.372745  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4364  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  30.97 
 
 
691 aa  167  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0103685  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0662  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  32.25 
 
 
681 aa  160  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0104064  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1644  dehydrogenase-like protein  28.43 
 
 
707 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1059  dehydrogenase-like  27.92 
 
 
684 aa  139  4.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2483  dehydrogenase-like protein  30.89 
 
 
728 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0417165  normal  0.165062 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2305  dehydrogenase-like  28.24 
 
 
720 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1566  dehydrogenase-like protein  27.12 
 
 
707 aa  135  8e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386533  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1964  putative dehydrogenase  25.88 
 
 
710 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.220999  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2362  dehydrogenase-like protein  30.25 
 
 
728 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.221453 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1668  putative dehydrogenase  23.75 
 
 
689 aa  90.1  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0410472  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>