31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_00220 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_00220  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  100 
 
 
74 aa  149  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4595  addiction module antidote  43.66 
 
 
73 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00566686  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3972  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  41.67 
 
 
74 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157013  normal  0.120349 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1432  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  41.67 
 
 
91 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6861  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  41.67 
 
 
74 aa  68.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387116  normal  0.292975 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0218  putative addiction module antidote  41.89 
 
 
74 aa  68.6  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.108167 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4245  addiction module antidote  40 
 
 
75 aa  67.4  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1983  addiction module antidote  33.78 
 
 
74 aa  66.6  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00343693  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2110  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  39.19 
 
 
73 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0781  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  39.19 
 
 
73 aa  64.7  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2222  putative addiction module antidote  36.49 
 
 
74 aa  62.8  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.286313  hitchhiker  0.00864042 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3405  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  35.14 
 
 
74 aa  62.4  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226786  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1578  addiction module antidote  35.14 
 
 
74 aa  61.6  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23904 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2982  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  38.89 
 
 
74 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.354218  normal  0.955686 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8344  addiction module antidote  33.78 
 
 
74 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1314  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  33.78 
 
 
73 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.271247  normal  0.35065 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2175  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  36.49 
 
 
73 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.634416  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1412  SpoVT/AbrB-like  34.25 
 
 
86 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0288311  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0853  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  35.21 
 
 
73 aa  59.3  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2467  SpoVT/AbrB domain-containing protein  32.43 
 
 
74 aa  59.3  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1371  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  35.14 
 
 
73 aa  58.2  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4393  addiction module antidote  29.33 
 
 
75 aa  54.3  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.706573 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02087  putative addiction module antidote  30.99 
 
 
73 aa  52.8  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1258  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  31.94 
 
 
73 aa  49.7  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.277274 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2153  SpoVT/AbrB domain protein  32.43 
 
 
75 aa  48.9  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.84509  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4109  SpoVT/AbrB-like  33.8 
 
 
75 aa  47.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.462334  normal  0.998914 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2972  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  28.17 
 
 
73 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3137  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  28.17 
 
 
73 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.408099 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0034  hypothetical protein  30.67 
 
 
75 aa  45.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2705  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  34.67 
 
 
76 aa  45.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3974  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  48.48 
 
 
84 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>