More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_00180 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  100 
 
 
337 aa  655    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  44.74 
 
 
330 aa  286  5e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  44.44 
 
 
330 aa  281  1e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1316  transport system permease protein  46.41 
 
 
338 aa  272  6e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  41.96 
 
 
346 aa  268  7e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2366  transport system permease protein  44.03 
 
 
353 aa  266  2.9999999999999995e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1420  transport system permease protein  42.55 
 
 
361 aa  257  2e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  46.2 
 
 
363 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1895  transport system permease protein  43.88 
 
 
336 aa  252  7e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00113354  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3251  transport system permease protein  44.62 
 
 
345 aa  252  7e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000970776  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3606  transport system permease protein  47.74 
 
 
367 aa  251  2e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.438147  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  45.82 
 
 
363 aa  249  5e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2340  transport system permease protein  42.9 
 
 
371 aa  249  6e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0881  corrinoid ABC transporter permease  45.82 
 
 
380 aa  248  8e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0557  transport system permease protein  40.97 
 
 
355 aa  248  1e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  45.7 
 
 
315 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  40.06 
 
 
359 aa  239  5e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1831  transport system permease protein  47.64 
 
 
376 aa  239  5.999999999999999e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  41.14 
 
 
367 aa  238  9e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  43.99 
 
 
370 aa  237  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2493  corrinoid ABC transporter permease  47.7 
 
 
373 aa  237  2e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  38.48 
 
 
350 aa  236  4e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0651  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  45.82 
 
 
334 aa  235  9e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0685  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  45.82 
 
 
334 aa  235  9e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  45.64 
 
 
366 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1546  ABC transporter, inner membrane subunit  43.04 
 
 
387 aa  233  3e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  38.4 
 
 
356 aa  232  8.000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2080  transport system permease protein  43.31 
 
 
368 aa  231  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1116  ABC transporter permease  37.79 
 
 
343 aa  228  1e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2792  corrinoid ABC transporter permease  49.48 
 
 
362 aa  227  2e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.525724  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1297  iron chelate ABC transporter permease protein  38.37 
 
 
343 aa  227  2e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0147613  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0447  transport system permease protein  37.94 
 
 
340 aa  227  2e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.279756  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2211  transport system permease protein  41.67 
 
 
350 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4112  iron compound ABC transporter, permease  39.94 
 
 
345 aa  225  8e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0583  transport system permease protein  37.65 
 
 
331 aa  224  2e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.777741  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2261  iron(III) ABC transporter, permease protein  40.43 
 
 
343 aa  224  2e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  36.66 
 
 
362 aa  224  2e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  39.38 
 
 
356 aa  223  4.9999999999999996e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0323  putative hemin ABC transporter, permease protein  40.19 
 
 
343 aa  223  4.9999999999999996e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00139931  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1753  transport system permease protein  40.06 
 
 
348 aa  222  6e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000172591  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1638  transport system permease protein  39.54 
 
 
383 aa  222  7e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.250999  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4501  iron compound ABC transporter, permease protein  39.64 
 
 
342 aa  222  7e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4241  transport system permease protein  37.35 
 
 
381 aa  222  8e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.2131 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0603  transport system permease protein  46.85 
 
 
316 aa  221  9e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.39796  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1711  transport system permease protein  39.88 
 
 
335 aa  221  9e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  38.05 
 
 
347 aa  220  1.9999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  41.51 
 
 
358 aa  219  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0256  transport system permease protein  39.94 
 
 
329 aa  219  5e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000493486  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  41.24 
 
 
315 aa  218  1e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1473  iron(III) ABC transporter, permease protein  39.71 
 
 
338 aa  218  1e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0402  transport system permease protein  39.88 
 
 
352 aa  217  2e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  43.14 
 
 
354 aa  217  2e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1290  hypothetical protein  37.13 
 
 
350 aa  217  2e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.385136 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2100  transport system permease protein  38.1 
 
 
334 aa  218  2e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1266  transport system permease protein  41.05 
 
 
344 aa  216  2.9999999999999998e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.594883  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0966  transport system permease protein  37.91 
 
 
369 aa  216  2.9999999999999998e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0445  transport system permease protein  36.9 
 
 
336 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1720  hypothetical protein  35.4 
 
 
350 aa  216  5e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1968  transport system permease protein  38.87 
 
 
365 aa  216  5e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2134  transport system permease protein  38.69 
 
 
357 aa  216  5e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0133047 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2017  transport system permease protein  38.69 
 
 
369 aa  216  7e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3020  transport system permease protein  42.96 
 
 
370 aa  215  9e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.277606  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1179  iron compound ABC transporter, permease protein  37.94 
 
 
325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00674105  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4449  iron compound ABC transporter, permease protein  39.94 
 
 
342 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4264  iron compound ABC transporter permease  39.94 
 
 
345 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0749  iron compound ABC transporter, permease protein  40.24 
 
 
342 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0417  transport system permease protein  37.54 
 
 
344 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4101  iron compound ABC transporter, permease  39.94 
 
 
345 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4448  iron compound ABC transporter, permease protein  39.94 
 
 
342 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4596  iron compound ABC transporter permease protein  39.94 
 
 
342 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4487  iron compound ABC transporter, permease protein  39.88 
 
 
342 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3104  iron compound ABC transporter, permease protein  39.32 
 
 
359 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  40.19 
 
 
334 aa  213  3.9999999999999995e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3892  transport system permease protein  40.19 
 
 
334 aa  213  3.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  40.19 
 
 
334 aa  213  3.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4152  transport system permease protein  40.55 
 
 
349 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0212216  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001351  hemin ABC transporter permease protein  40.79 
 
 
345 aa  213  4.9999999999999996e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000656529  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1283  transport system permease protein  37.91 
 
 
332 aa  212  5.999999999999999e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0152  transport system permease protein  40.63 
 
 
351 aa  212  5.999999999999999e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3808  iron chelate ABC transporter permease  40 
 
 
330 aa  212  7e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0360927 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1738  transport system permease protein  36.02 
 
 
330 aa  212  7e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.922017  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4865  ABC transporter, iron chelate uptake transporter (FeCT) family, permease protein  40 
 
 
318 aa  212  7.999999999999999e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.737377 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4009  transport system permease protein  39.77 
 
 
338 aa  212  9e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2393  iron ABC transporter, permease protein  39.71 
 
 
359 aa  211  1e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0214  iron chelate ABC transporter permease protein  37.09 
 
 
328 aa  211  1e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05240  ABC-type Fe3+-siderophore transporter permease  40.65 
 
 
345 aa  211  1e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0845  transport system permease protein  37.24 
 
 
322 aa  210  2e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1121  transport system permease protein  38.39 
 
 
372 aa  211  2e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0471477  hitchhiker  0.00000000101745 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0179  transport system permease protein  38.27 
 
 
326 aa  210  3e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3843  transport system permease protein  39.53 
 
 
349 aa  210  3e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.19753  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3306  transport system permease protein  39.88 
 
 
354 aa  209  4e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.205104  hitchhiker  0.000395648 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0657  ABC-type transporter, permease component  40.83 
 
 
346 aa  209  5e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0868  transport system permease protein  35.56 
 
 
322 aa  209  5e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0494  transport system permease protein  40.62 
 
 
336 aa  209  6e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.877978  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0497  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  40.2 
 
 
354 aa  209  7e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.760715  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4215  transport system permease protein  41.44 
 
 
342 aa  209  8e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0076  transport system permease protein  37.43 
 
 
452 aa  208  8e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0415  transport system permease protein  36.88 
 
 
357 aa  208  9e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.920967 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0039  transport system permease protein  38.08 
 
 
336 aa  208  9e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00235157  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2385  FecCD-family membrane transport protein  38.66 
 
 
367 aa  208  1e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567541  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>