More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_00090 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_00090  ABC-type sugar transport system periplasmic component  100 
 
 
276 aa  556  1e-157  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3958  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.8 
 
 
436 aa  127  2e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  1.79604e-07  hitchhiker  9.17586e-09 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1473  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  29.82 
 
 
467 aa  113  4e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2522  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.24 
 
 
315 aa  102  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0166  monosaccharide-transporting ATPase  27.23 
 
 
307 aa  94.7  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0292  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  29.28 
 
 
425 aa  94.7  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3328  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.93 
 
 
311 aa  93.2  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0923  monosaccharide-transporting ATPase  27.59 
 
 
289 aa  93.2  4e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3049  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding, putative  29.13 
 
 
308 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00910782  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1401  ribose ABC transporter, substrate binding protein  26.83 
 
 
315 aa  89.4  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1618  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.23 
 
 
316 aa  89  7e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1794  monosaccharide-transporting ATPase  27.36 
 
 
295 aa  87.8  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.37883  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0054  periplasmic sugar-binding protein  28.15 
 
 
352 aa  86.3  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  3.50797e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3265  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.43 
 
 
311 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0610984  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3490  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  28.57 
 
 
309 aa  84.7  1e-15  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.70516  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2807  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.92 
 
 
351 aa  84  2e-15  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.104692  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2780  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.92 
 
 
351 aa  84  2e-15  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.585093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2824  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.92 
 
 
351 aa  84  2e-15  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0298901 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6620  D-xylose transporter subunit XylF  22.73 
 
 
374 aa  82.4  6e-15  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00486776 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4011  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.92 
 
 
319 aa  81.6  1e-14  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1336  periplasmic binding protein and sugar binding domain of the LacI family protein  25.42 
 
 
312 aa  81.6  1e-14  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.454554 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2277  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  22.63 
 
 
321 aa  80.9  2e-14  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.455143  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50320  ABC transporter substrate binding protein  25.12 
 
 
315 aa  79  8e-14  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.193489  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3164  Monosaccharide-transporting ATPase  27.35 
 
 
310 aa  78.6  9e-14  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1961  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.85 
 
 
309 aa  78.2  1e-13  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0249015 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19500  D-xylose ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.27 
 
 
344 aa  78.6  1e-13  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.497232  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0948  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.12 
 
 
311 aa  78.2  1e-13  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50140  Periplasmic substrate-binding protein of sugar ABC transporter  25.96 
 
 
310 aa  77  3e-13  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2825  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.32 
 
 
349 aa  76.6  4e-13  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  0.0535027 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2808  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.32 
 
 
349 aa  76.6  4e-13  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.122332  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2781  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.32 
 
 
349 aa  76.6  4e-13  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2399  ribose ABC transporter, periplasmic ribose-binding protein  25.48 
 
 
310 aa  76.3  5e-13  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1457  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.9 
 
 
362 aa  75.9  6e-13  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1402  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.36 
 
 
308 aa  75.9  7e-13  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0942  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.36 
 
 
308 aa  75.9  8e-13  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000643298  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1424  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.36 
 
 
308 aa  75.9  8e-13  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0115263  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2685  Monosaccharide-transporting ATPase  22.61 
 
 
306 aa  75.1  1e-12  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.450778  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0798  ribose ABC transporter, ribose-binding protein  24.79 
 
 
308 aa  75.1  1e-12  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  2.67941e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3199  two component transcriptional regulator, AraC family  24.23 
 
 
940 aa  75.5  1e-12  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.157032  normal  0.236848 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0701  ribose ABC transporter, ribose-binding protein  24.37 
 
 
308 aa  73.9  2e-12  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.199726  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0737  ribose ABC transporter, ribose-binding protein  24.79 
 
 
308 aa  74.3  2e-12  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.926456  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26220  Periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator protein  27.7 
 
 
308 aa  74.3  2e-12  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4637  ribose ABC transporter, ribose-binding protein  24.37 
 
 
308 aa  73.2  4e-12  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.146123  unclonable  4.40126e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0583  monosaccharide-transporting ATPase  23.95 
 
 
307 aa  73.2  5e-12  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4154  D-xylose transporter subunit XylF  25.65 
 
 
332 aa  72.8  6e-12  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0220  two component transcriptional regulator, AraC family  26.34 
 
 
934 aa  72.8  6e-12  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.497584  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0580  ribose ABC transporter, ribose-binding protein  23.5 
 
 
308 aa  72.8  6e-12  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1824  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.39 
 
 
318 aa  72.8  6e-12  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00471967  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4436  D-xylose transporter subunit XylF  25.65 
 
 
332 aa  72.8  6e-12  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2682  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.3 
 
 
328 aa  72.8  6e-12  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.776041 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1047  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.31 
 
 
317 aa  72.4  7e-12  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0579  ribose ABC transporter, ribose-binding protein  23.5 
 
 
308 aa  72.4  7e-12  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.196661  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6712  ABC transporter  26.46 
 
 
315 aa  72.4  7e-12  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0620834  normal  0.169373 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0636  ribose ABC transporter ribose-binding protein  23.5 
 
 
308 aa  72.4  7e-12  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0669  ribose ABC transporter ribose-binding protein  23.5 
 
 
308 aa  72.4  7e-12  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0726  ribose ABC transporter, ribose-binding protein  23.5 
 
 
308 aa  72.4  7e-12  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.98542e-37 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50130  Periplasmic substrate-binding protein of sugar ABC transporter  25.24 
 
 
308 aa  72.4  7e-12  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2257  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.77 
 
 
309 aa  72.4  8e-12  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.876756  normal  0.048401 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1343  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.36 
 
 
308 aa  72  9e-12  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0564  monosaccharide-transporting ATPase  21.79 
 
 
307 aa  71.6  1e-11  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  3.02445e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0155  D-xylose ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.23 
 
 
368 aa  71.6  1e-11  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0079  D-xylose transporter subunit XylF  26.11 
 
 
332 aa  72  1e-11  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0101  Monosaccharide-transporting ATPase  24.9 
 
 
362 aa  71.2  2e-11  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0225  monosaccharide-transporting ATPase  27.57 
 
 
360 aa  71.2  2e-11  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2035  Monosaccharide-transporting ATPase  24.39 
 
 
309 aa  71.2  2e-11  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.609477  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4186  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.21 
 
 
325 aa  70.9  2e-11  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2022  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.79 
 
 
381 aa  71.2  2e-11  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4568  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  24.88 
 
 
308 aa  71.2  2e-11  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0155  D-xylose transporter subunit XylF  28.02 
 
 
330 aa  70.1  3e-11  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2621  ABC xylose transporter, periplasmic ligand binding protein  26.61 
 
 
342 aa  70.5  3e-11  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.935077 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0259  xylose binding protein transport system  26.52 
 
 
370 aa  70.5  3e-11  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.465034  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6632  D-xylose ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.61 
 
 
342 aa  70.5  3e-11  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4609  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.41 
 
 
319 aa  69.7  4e-11  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1891  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.88 
 
 
308 aa  70.1  4e-11  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.189915 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1604  two component transcriptional regulator, AraC family  25.39 
 
 
904 aa  69.7  5e-11  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0105  D-xylose ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.21 
 
 
351 aa  69.7  5e-11  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4893  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25 
 
 
309 aa  69.7  5e-11  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.202209  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4136  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.16 
 
 
322 aa  69.3  6e-11  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1642  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.4 
 
 
333 aa  68.9  8e-11  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  8.07495e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1633  D-xylose-binding periplasmic ABC transporter protein  25.49 
 
 
339 aa  68.9  9e-11  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4184  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.52 
 
 
309 aa  68.9  9e-11  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1304  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.82 
 
 
311 aa  68.9  9e-11  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1150  D-xylose ABC transporter, periplasmic D-xylose-binding protein  26.82 
 
 
339 aa  68.6  1e-10  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0756849  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2341  D-xylose ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.02 
 
 
342 aa  68.2  1e-10  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462735  normal  0.0483299 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0114  ribose ABC transporter, periplasmic D-ribose-binding protein  22.09 
 
 
322 aa  68.6  1e-10  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.686148  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3042  D-xylose ABC transporter, periplasmic substrate- binding protein  24.27 
 
 
347 aa  68.2  1e-10  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2906  Monosaccharide-transporting ATPase  22.33 
 
 
308 aa  68.6  1e-10  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0655902 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4971  Monosaccharide-transporting ATPase  24.04 
 
 
309 aa  67.8  2e-10  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.155709  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3856  Monosaccharide-transporting ATPase  24.04 
 
 
309 aa  67.8  2e-10  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0772543  normal  0.188822 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1798  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.58 
 
 
324 aa  67.4  2e-10  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.482327  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0061  D-xylose transporter subunit XylF  25.23 
 
 
331 aa  67.8  2e-10  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1599  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.05 
 
 
301 aa  67.8  2e-10  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.078071  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3414  D-xylose ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.84 
 
 
339 aa  67  3e-10  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.443639  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0907  ABC sugar transporter, periplasmic binding protein  23.75 
 
 
352 aa  67.4  3e-10  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal  0.0322478 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03369  hypothetical protein  28.02 
 
 
330 aa  67.4  3e-10  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4913  D-xylose ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25 
 
 
335 aa  67  3e-10  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00296988  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0144  D-xylose ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.02 
 
 
330 aa  67.4  3e-10  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03418  D-xylose transporter subunit  28.02 
 
 
330 aa  67.4  3e-10  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0148  D-xylose transporter subunit XylF  28.02 
 
 
330 aa  67.4  3e-10  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4062  D-xylose transporter subunit XylF  28.02 
 
 
330 aa  67  3e-10  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>