More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_00020 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_00020  DNA polymerase III, beta subunit  100 
 
 
367 aa  740  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0002  DNA polymerase III, beta subunit  36.78 
 
 
365 aa  251  1e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.610199  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0003  DNA polymerase III, beta subunit  32.15 
 
 
366 aa  228  2e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  5.53224e-06  hitchhiker  3.89013e-07 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0953  DNA polymerase III, beta subunit  33.78 
 
 
374 aa  218  1e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0002  DNA polymerase III, beta subunit  35.33 
 
 
367 aa  218  2e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.226085  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0002  DNA polymerase III subunit beta  34.24 
 
 
366 aa  216  3e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.279408  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0002  DNA polymerase III subunit beta  34.24 
 
 
366 aa  216  3e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.316057  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0002  DNA polymerase III subunit beta  35.22 
 
 
370 aa  216  5e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0002  DNA polymerase III, beta subunit  34.15 
 
 
367 aa  214  2e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.150547  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.15 
 
 
370 aa  213  4e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  7.29086e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0002  DNA polymerase III, beta subunit  33.51 
 
 
372 aa  211  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0002  DNA polymerase III, beta subunit  33.69 
 
 
373 aa  209  5e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.394263  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0001  DNA polymerase III, beta subunit  32.98 
 
 
372 aa  207  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0872728  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0816  DNA polymerase III, beta subunit  34.33 
 
 
366 aa  205  9e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.731986  normal  0.187979 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.24 
 
 
376 aa  204  2e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0002  DNA polymerase III, beta subunit  32.98 
 
 
372 aa  203  4e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0618208  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0002  DNA polymerase III, beta subunit  32.22 
 
 
389 aa  203  4e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.105928  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1009  DNA polymerase III, beta subunit  30.13 
 
 
378 aa  202  8e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  5.12645e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0002  DNA polymerase III, beta subunit  33.42 
 
 
370 aa  201  1e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1227  DNA polymerase III, beta subunit  30.13 
 
 
378 aa  202  1e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  1.28167e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0002  DNA polymerase III, beta subunit  32.71 
 
 
372 aa  200  3e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2372  DNA polymerase III subunit beta  32.7 
 
 
366 aa  200  3e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2552  DNA polymerase III subunit beta  31.3 
 
 
377 aa  199  5e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0587336  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00020  DNA polymerase III, beta subunit  30.11 
 
 
365 aa  199  7e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.443906  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.5 
 
 
377 aa  199  8e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0177596  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.5 
 
 
377 aa  199  8e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00213885  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.91 
 
 
372 aa  197  2e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.205747 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.36 
 
 
375 aa  197  2e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  4.18991e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4406  DNA polymerase III, beta subunit  30.85 
 
 
377 aa  197  3e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.150139  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.97 
 
 
381 aa  196  5e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0002  DNA polymerase III subunit beta  30.97 
 
 
381 aa  196  7e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  3.41772e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5318  DNA polymerase III subunit beta  30.97 
 
 
381 aa  196  7e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.00172021  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00020  DNA polymerase III, beta subunit  30.79 
 
 
365 aa  195  9e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000592113  decreased coverage  5.99685e-05 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1036  DNA polymerase III, beta subunit  28.91 
 
 
378 aa  195  1e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  3.28779e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0002  DNA polymerase III subunit beta  30.87 
 
 
379 aa  194  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0872061  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0002  DNA polymerase III, beta subunit  32.27 
 
 
375 aa  194  3e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.301651  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0002  DNA polymerase III, beta subunit  33.77 
 
 
376 aa  193  3e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.73 
 
 
375 aa  193  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.71 
 
 
381 aa  193  4e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000678483  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.05 
 
 
365 aa  193  4e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.87 
 
 
379 aa  193  4e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0173994  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.21 
 
 
372 aa  193  5e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0002  DNA polymerase III subunit beta  30.87 
 
 
379 aa  193  5e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  8.20509e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0002  DNA polymerase III, beta subunit  32.27 
 
 
375 aa  192  7e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.22 
 
 
373 aa  192  8e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0823829  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.61 
 
 
379 aa  192  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00656712  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0351  DNA polymerase III subunit beta  31.18 
 
 
412 aa  191  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203557  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.61 
 
 
379 aa  192  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.478099 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0002  DNA polymerase III, beta subunit  33.07 
 
 
372 aa  192  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.59068e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0002  DNA polymerase sliding clamp subunit  30.59 
 
 
376 aa  192  1e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.88302e-11  unclonable  1.4129e-28 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.42 
 
 
373 aa  191  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.125376 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.68 
 
 
372 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.120269  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.88 
 
 
373 aa  191  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.969312  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3543  DNA polymerase III subunit beta  31.64 
 
 
372 aa  191  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0003  DNA polymerase III subunit beta  28.15 
 
 
373 aa  191  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.174848  normal  0.920378 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.68 
 
 
372 aa  190  4e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2239  DNA polymerase III subunit beta  28.95 
 
 
373 aa  190  4e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0102545  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.84 
 
 
372 aa  189  5e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0730917  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0002  DNA polymerase III subunit beta  33.78 
 
 
366 aa  189  5e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.039801  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0003  DNA polymerase III subunit beta  27.61 
 
 
373 aa  189  5e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  0.512948 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0002  DNA polymerase III subunit beta  30.34 
 
 
379 aa  189  6e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.34 
 
 
379 aa  189  6e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0132884  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.95 
 
 
373 aa  188  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0861969  hitchhiker  9.29484e-07 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.63 
 
 
378 aa  188  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0003  DNA polymerase III, beta subunit  30.16 
 
 
374 aa  187  3e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00459981  hitchhiker  1.16577e-06 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.16 
 
 
369 aa  186  7e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4329  DNA polymerase III subunit beta  30.91 
 
 
372 aa  186  8e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3047  DNA polymerase III subunit beta  30.48 
 
 
371 aa  185  1e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.579013  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0003  DNA polymerase III, beta subunit  29.27 
 
 
366 aa  185  1e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0993  DNA polymerase III, beta subunit  30.13 
 
 
376 aa  184  2e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.11 
 
 
372 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.34 
 
 
378 aa  183  4e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000189832  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4592  DNA polymerase III subunit beta  30.91 
 
 
372 aa  183  4e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0352599 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.37 
 
 
378 aa  182  6e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  1.67002e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3705  DNA polymerase III subunit beta  29.03 
 
 
372 aa  182  8e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0432616 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.05 
 
 
380 aa  181  1e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0019  DNA polymerase III, beta subunit  27.39 
 
 
378 aa  181  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0004  DNA polymerase III subunit beta  29.57 
 
 
372 aa  181  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114385  unclonable  5.12755e-25 
 
 
-
 
NC_004310  BR0002  DNA polymerase III subunit beta  30.11 
 
 
397 aa  179  5e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.41342  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.11 
 
 
397 aa  179  8e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00789927  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0002  DNA polymerase III subunit beta  29.84 
 
 
372 aa  177  3e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2456  DNA polymerase III subunit beta  29.84 
 
 
376 aa  176  5e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0115889  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1278  DNA polymerase III subunit beta  29.95 
 
 
373 aa  175  1e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  unclonable  2.76035e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0749  DNA polymerase III, beta subunit  28 
 
 
377 aa  174  2e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00160623  normal  0.0661529 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2795  DNA polymerase III subunit beta  29.03 
 
 
370 aa  174  2e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.924667  normal  0.594035 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2430  DNA polymerase III subunit beta  30.18 
 
 
376 aa  174  2e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  8.41235e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.03 
 
 
372 aa  174  2e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  1.38199e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0003  DNA polymerase III, beta subunit  29.84 
 
 
369 aa  174  3e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  3.52181e-08 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.19 
 
 
367 aa  174  3e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  3.48538e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.65 
 
 
379 aa  173  4e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0162  DNA polymerase III subunit beta  30.91 
 
 
372 aa  173  5e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281652  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0004  DNA polymerase III subunit beta  28.91 
 
 
385 aa  172  6e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.638398  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.54 
 
 
374 aa  172  7e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.017071  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1226  DNA polymerase III, beta subunit  31.52 
 
 
366 aa  171  1e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.123805  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3374  DNA polymerase III subunit beta  28.23 
 
 
372 aa  171  1e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2460  DNA polymerase III subunit beta  29.4 
 
 
376 aa  171  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.10658e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2750  DNA polymerase III subunit beta  29.66 
 
 
376 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000190996  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00001  DNA polymerase III subunit beta  29.46 
 
 
388 aa  170  4e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.67 
 
 
373 aa  170  4e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00126039  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0002  DNA polymerase III subunit beta  28.31 
 
 
378 aa  170  4e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>