More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_R0015 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  Gs23SA  23S ribosomal RNA  87.7 
 
 		 2958 bp  1160    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.287  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  Gs23SB  23S ribosomal RNA  87.7 
 
 		 2958 bp  1160    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5739  23S ribosomal RNA  90.02 
 
 		 2908 bp  656    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5742  23S ribosomal RNA  90.02 
 
 		 2908 bp  656    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5745  23S ribosomal RNA  90.02 
 
 		 2909 bp  656    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00582654  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5748  23S ribosomal RNA  90.02 
 
 		 2908 bp  656    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.014193  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5751  23S ribosomal RNA  90.02 
 
 		 2909 bp  656    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5754  23S ribosomal RNA  90.02 
 
 		 2909 bp  656    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5757  23S ribosomal RNA  90.02 
 
 		 2908 bp  656    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5760  23S ribosomal RNA  90.02 
 
 		 2908 bp  656    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5763  23S ribosomal RNA  90.02 
 
 		 2908 bp  656    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5766  23S ribosomal RNA  90.02 
 
 		 2908 bp  656    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000129923  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5769  23S ribosomal RNA  90.02 
 
 		 2908 bp  656    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00191145  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5772  23S ribosomal RNA  90.02 
 
 		 2926 bp  656    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000735902  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-1  23S ribosomal RNA  90.02 
 
 		 2911 bp  656    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-10  23S ribosomal RNA  90.02 
 
 		 2911 bp  656    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-11  23S ribosomal RNA  90.02 
 
 		 2911 bp  656    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-2  23S ribosomal RNA  90.02 
 
 		 2911 bp  656    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-3  23S ribosomal RNA  90.02 
 
 		 2851 bp  656    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-4  23S ribosomal RNA  90.02 
 
 		 2911 bp  656    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-5  23S ribosomal RNA  90.02 
 
 		 2911 bp  656    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-6  23S ribosomal RNA  90.02 
 
 		 2911 bp  656    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-8  23S ribosomal RNA  90.02 
 
 		 2911 bp  656    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_1  23S ribosomal RNA  90.02 
 
 		 2912 bp  656    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_10  23S ribosomal RNA  90.02 
 
 		 2912 bp  656    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_11  23S ribosomal RNA  90.02 
 
 		 2911 bp  656    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_12  23S ribosomal RNA  90.02 
 
 		 2911 bp  656    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_13  23S ribosomal RNA  90.02 
 
 		 2911 bp  656    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_2  23S ribosomal RNA  90.02 
 
 		 2911 bp  656    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_3  23S ribosomal RNA  90.02 
 
 		 2911 bp  656    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_4  23S ribosomal RNA  90.02 
 
 		 2911 bp  656    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_5  23S ribosomal RNA  90.02 
 
 		 2911 bp  656    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.759228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_6  23S ribosomal RNA  90.02 
 
 		 2911 bp  656    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_7  23S ribosomal RNA  90.02 
 
 		 2911 bp  656    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_8  23S ribosomal RNA  90.02 
 
 		 2911 bp  656    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_9  23S ribosomal RNA  90.02 
 
 		 2912 bp  656    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_1  23S ribosomal RNA  90.02 
 
 		 2911 bp  656    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_10  23S ribosomal RNA  90.02 
 
 		 2911 bp  656    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_11  23S ribosomal RNA  90.02 
 
 		 2911 bp  656    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.701116  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_12  23S ribosomal RNA  90.02 
 
 		 2911 bp  656    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_13  23S ribosomal RNA  90.02 
 
 		 2911 bp  656    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_2  23S ribosomal RNA  90.02 
 
 		 2911 bp  656    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_3  23S ribosomal RNA  90.02 
 
 		 2911 bp  656    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_4  23S ribosomal RNA  90.02 
 
 		 2911 bp  656    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0824907  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_5  23S ribosomal RNA  90.02 
 
 		 2911 bp  656    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_6  23S ribosomal RNA  90.02 
 
 		 2911 bp  656    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_8  23S ribosomal RNA  90.02 
 
 		 2911 bp  656    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_9  23S ribosomal RNA  90.02 
 
 		 2912 bp  656    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppr02  23S ribosomal RNA  82.69 
 
 		 2783 bp  668    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppr05  23S ribosomal RNA  82.69 
 
 		 2783 bp  668    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppr08  23S ribosomal RNA  82.69 
 
 		 2861 bp  668    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplr02  23S ribosomal RNA  82.61 
 
 		 2861 bp  660    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplr05  23S ribosomal RNA  82.61 
 
 		 2861 bp  660    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplr08  23S ribosomal RNA  82.61 
 
 		 2861 bp  660    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0002  23S ribosomal RNA  84.64 
 
 		 2882 bp  656    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.0000000280391  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1476  23S ribosomal RNA  84.64 
 
 		 2882 bp  656    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000361386  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3559  23S ribosomal RNA  84.64 
 
 		 2882 bp  656    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000413254  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1911  23S ribosomal RNA  84.64 
 
 		 2882 bp  656    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000130607  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0013  23S ribosomal RNA  82.99 
 
 		 2913 bp  698    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0027  23S ribosomal RNA  82.99 
 
 		 2913 bp  698    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0049  23S ribosomal RNA  87.03 
 
 		 2956 bp  1102    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0054  23S ribosomal RNA  87.03 
 
 		 2956 bp  1102    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.175608  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0018  23S ribosomal RNA  84.64 
 
 		 2882 bp  656    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000431257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0014  23S ribosomal RNA  88.03 
 
 		 2983 bp  1191    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.58284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0043  23S ribosomal RNA  87.95 
 
 		 2983 bp  1183    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.101725  hitchhiker  0.000000749297 
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SA  23S ribosomal RNA  90.02 
 
 		 2908 bp  656    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.479202  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SB  23S ribosomal RNA  90.02 
 
 		 2908 bp  656    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SC  23S ribosomal RNA  90.02 
 
 		 2908 bp  656    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.948592  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SD  23S ribosomal RNA  90.02 
 
 		 2908 bp  656    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000431114  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SE  23S ribosomal RNA  90.02 
 
 		 2908 bp  656    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.842717  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SF  23S ribosomal RNA  90.02 
 
 		 2908 bp  656    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SH  23S ribosomal RNA  90.02 
 
 		 2908 bp  656    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SJ  23S ribosomal RNA  90.02 
 
 		 2908 bp  656    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00026047  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SK  23S ribosomal RNA  90.02 
 
 		 2908 bp  656    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00794568  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2044  23S ribosomal RNA  84.64 
 
 		 2881 bp  656    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0408175  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1099  23S ribosomal RNA  84.64 
 
 		 2881 bp  656    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000727484  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2895  23S ribosomal RNA  84.64 
 
 		 2881 bp  656    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0262305  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3092  23S ribosomal RNA  84.64 
 
 		 2882 bp  656    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000732021  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0014  23S ribosomal RNA  85.48 
 
 		 2985 bp  817    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0035  23S ribosomal RNA  85.48 
 
 		 2985 bp  817    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0039  23S ribosomal RNA  83.82 
 
 		 3105 bp  690    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0522575  normal  0.211989 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0047  23S ribosomal RNA  83.82 
 
 		 3105 bp  690    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.137502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0014  23S ribosomal RNA  83.74 
 
 		 2872 bp  672    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0368239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0042  23S ribosomal RNA  83.74 
 
 		 2872 bp  672    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.121457 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0002  23S ribosomal RNA  84.15 
 
 		 2905 bp  708    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.905525  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0010  23S ribosomal RNA  84.15 
 
 		 2905 bp  708    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0016  23S ribosomal RNA  84.15 
 
 		 2905 bp  708    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.427778  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0047  23S ribosomal RNA  84.15 
 
 		 2905 bp  708    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0106  23S ribosomal RNA  84.15 
 
 		 2905 bp  708    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.492781  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0116  23S ribosomal RNA  84.15 
 
 		 2905 bp  708    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0121  23S ribosomal RNA  83.75 
 
 		 2905 bp  676    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0126  23S ribosomal RNA  84.15 
 
 		 2905 bp  708    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0004  23S ribosomal RNA  83.29 
 
 		 2897 bp  741    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0014  23S ribosomal RNA  83.29 
 
 		 2897 bp  741    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20297  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0058  23S ribosomal RNA  83.29 
 
 		 2897 bp  741    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0076  23S ribosomal RNA  83.38 
 
 		 2898 bp  749    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.430532  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0084  23S ribosomal RNA  83.29 
 
 		 2897 bp  741    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0002  23S ribosomal RNA  83.65 
 
 		 2893 bp  668    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.492003  hitchhiker  0.00473622 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0010  23S ribosomal RNA  83.87 
 
 		 2893 bp  670    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00150973  normal  0.511936 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0017  23S ribosomal RNA  83.55 
 
 		 2893 bp  660    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000288824 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>