More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6852 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6852  putative signal transduction protein with CBS domains  100 
 
 		 141 aa  273  4e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1126  putative signal transduction protein with CBS domains  38.97 
 
 		 143 aa  90.1  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  44.63 
 
 		 166 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2625  CBS domain containing protein  44.63 
 
 		 146 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2529  CBS domain containing protein  44.63 
 
 		 146 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.48063  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1330  signal transduction protein  44.63 
 
 		 146 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2078  CBS  38.24 
 
 		 142 aa  84.3  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000050024  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0268  hypothetical protein  38.26 
 
 		 169 aa  82.8  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00882605  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00940  CBS domain containing protein  38.52 
 
 		 262 aa  82  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000126291  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01043  hypothetical protein  37.01 
 
 		 154 aa  81.6  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0709  CBS domain containing protein  38.19 
 
 		 214 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1312  signal transduction protein  35.82 
 
 		 142 aa  78.6  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000000202163  decreased coverage  0.000166712 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2437  hypothetical protein  31.72 
 
 		 147 aa  77.8  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0413  putative signal transduction protein with CBS domains  36.76 
 
 		 142 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0401079 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  38.24 
 
 		 225 aa  77.4  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004370  putative acetoin utilization protein AcuB  35.61 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0657  signal transduction protein  35.2 
 
 		 309 aa  73.9  0.0000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00784458  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4562  acetoin utilization protein AcuB  32.65 
 
 		 214 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4917  acetoin utilization protein AcuB  32.65 
 
 		 214 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3243  CBS domain containing protein  38.46 
 
 		 268 aa  73.9  0.0000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.100628  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  42.37 
 
 		 769 aa  73.6  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2731  CBS domain containing membrane protein  33.33 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4799  acetoin utilization protein AcuB  32.65 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4803  acetoin utilization protein AcuB  32.65 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4396  acetoin utilization protein  32.65 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4413  acetoin utilization protein  32.65 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1923  CBS domain containing protein  32.35 
 
 		 154 aa  72.8  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4782  acetoin utilization protein AcuB  32.65 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  35.25 
 
 		 216 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4495  CBS domain-containing protein  32.65 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2958  putative signal transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 		 217 aa  72  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  35.04 
 
 		 225 aa  71.6  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  29.93 
 
 		 256 aa  72  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  31.65 
 
 		 215 aa  71.2  0.000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0462  acetoin utilization protein AcuB  31.97 
 
 		 214 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000917116 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4777  acetoin utilization protein AcuB  31.97 
 
 		 214 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1511  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  39.66 
 
 		 517 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316091 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1167  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  38.79 
 
 		 517 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.446861  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1184  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  38.79 
 
 		 517 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1194  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  38.79 
 
 		 517 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.515075  normal  0.0933798 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  35.25 
 
 		 216 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1899  IMP dehydrogenase/GMP reductase  34.75 
 
 		 517 aa  70.9  0.000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1726  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.79 
 
 		 503 aa  70.9  0.000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3337  CBS domain-containing protein  31.97 
 
 		 214 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.126622  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4909  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  38.79 
 
 		 517 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.636899 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  39.72 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0906  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.07 
 
 		 514 aa  70.1  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.213096  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1916  CBS domain containing membrane protein  31.76 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0545  homoserine O-acetyltransferase  36.28 
 
 		 487 aa  69.7  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.419548  normal  0.193935 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04740  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.79 
 
 		 514 aa  69.7  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1342  putative acetoin utilization protein AcuB  32.85 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4003  CBS domain-containing protein  29.85 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.360398 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0692  CBS domain-containing protein  31.78 
 
 		 636 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  31.94 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0935  CBS domain-containing protein  29.58 
 
 		 225 aa  68.2  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.872585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  38.17 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1027  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  40.17 
 
 		 485 aa  67.8  0.00000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1326  signal-transduction protein  37.82 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1105  putative signal transduction protein with CBS domains  36.75 
 
 		 268 aa  67.8  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0383  putative signal transduction protein with CBS domains  32.56 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0412615  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1429  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.6 
 
 		 321 aa  67.4  0.00000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1475  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.6 
 
 		 321 aa  67.4  0.00000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0990  acetoin utilization protein AcuB, putative  34.53 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0620  signal-transduction protein  36.97 
 
 		 144 aa  67  0.00000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1091  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.07 
 
 		 495 aa  67  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  30.22 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1198  CBS  35.9 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  29.93 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2164  CBS domain containing protein  35.9 
 
 		 288 aa  66.2  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.866866 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  33.58 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  28.78 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3288  CBS domain-containing protein  32.12 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0997819  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28670  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.97 
 
 		 507 aa  65.9  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0451  hypothetical protein  29.82 
 
 		 502 aa  65.9  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1708  phosphoesterase, RecJ-like  36.52 
 
 		 904 aa  65.5  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.833662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1421  polynucleotide adenylyltransferase region  35.65 
 
 		 909 aa  65.1  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2076  signal-transduction protein  35.71 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.250965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13445  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.93 
 
 		 529 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0612971  normal  0.0362546 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2720  CBS domain containing protein  32.09 
 
 		 220 aa  65.1  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.934738  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4253  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.04 
 
 		 500 aa  65.1  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2388  Polynucleotide adenylyltransferase region  30.77 
 
 		 903 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.991166 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  34.72 
 
 		 232 aa  64.7  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0278  CBS domain containing membrane protein  31.51 
 
 		 150 aa  64.3  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10697 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3135  CBS domain-containing protein  31.91 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0694667  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2219  CBS domain containing protein  32.48 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.338208  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4294  polynucleotide adenylyltransferase region  33.91 
 
 		 907 aa  63.9  0.0000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00498072  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0084  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  39.17 
 
 		 497 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2668  CBS domain containing membrane protein  34.31 
 
 		 277 aa  63.5  0.0000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204246  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  27.08 
 
 		 152 aa  63.5  0.0000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1328  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.43 
 
 		 496 aa  63.9  0.0000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0500  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.07 
 
 		 490 aa  63.9  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0750  CBS domain containing protein  35.97 
 
 		 867 aa  63.5  0.0000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.596795  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  28.81 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3742  Polynucleotide adenylyltransferase region  34.75 
 
 		 903 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4023  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.76 
 
 		 498 aa  62.8  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.836954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1013  CBS domain-containing protein  34.72 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0805  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.48 
 
 		 488 aa  63.2  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1256  signal-transduction protein  32.85 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0749  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.48 
 
 		 493 aa  62.4  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3557  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  35.59 
 
 		 605 aa  62  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>