58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6835 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6835  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 144 aa  283  7e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6836  transcriptional regulator, XRE family  45.65 
 
 		 199 aa  108  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5877  transcriptional regulator, XRE family  44.63 
 
 		 133 aa  88.2  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00666894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4304  transcriptional regulator, XRE family  42.42 
 
 		 131 aa  87.8  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.663644 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4237  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 140 aa  86.7  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.55821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5705  transcriptional regulator, XRE family  34.43 
 
 		 139 aa  77.4  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.712971 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0063  transcriptional regulator, XRE family  49.25 
 
 		 137 aa  73.6  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4456  transcriptional regulator, XRE family  48.53 
 
 		 147 aa  72.4  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0579  transcriptional regulator, XRE family  49.28 
 
 		 70 aa  70.5  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00759938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1224  transcriptional regulator, XRE family  40.85 
 
 		 79 aa  64.3  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0288237  hitchhiker  0.00260767 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1190  transcriptional regulator, XRE family  39.44 
 
 		 79 aa  62.8  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1091  transcriptional regulator, XRE family  39.44 
 
 		 79 aa  62  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0731  transcriptional regulator, XRE family  42.03 
 
 		 70 aa  62  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.228536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0677  transcriptional regulator, XRE family  42.03 
 
 		 70 aa  61.2  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6461  transcriptional regulator, XRE family  47.76 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0570  transcriptional regulator, XRE family  39.44 
 
 		 79 aa  60.5  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.532171 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2893  transcriptional regulator, XRE family  40.58 
 
 		 70 aa  60.1  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0147391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2567  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  39.78 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.375259 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2822  transcriptional regulator, XRE family  43.55 
 
 		 80 aa  59.3  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.161107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2247  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  39.78 
 
 		 119 aa  57  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.616763 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1221  XRE family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 173 aa  47.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000921846 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2696  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 117 aa  47.4  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6604  transcriptional regulator, XRE family  27.82 
 
 		 126 aa  47  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.608837  normal  0.251603 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0802  transcriptional regulator, XRE family  36.25 
 
 		 106 aa  46.6  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.237035 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2780  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 152 aa  45.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0182016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2714  XRE family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 204 aa  44.3  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2046  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 205 aa  43.9  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.298774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3914  XRE family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 84 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1485  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2402  XRE family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.314707  normal  0.620084 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0155  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 252 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2733  helix-turn-helix domain-containing protein  30.56 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000416248  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4788  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 114 aa  42  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000000200631  normal  0.763075 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1135  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 99 aa  41.6  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4781  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 113 aa  42  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00061071  normal  0.699893 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2524  transcriptional regulator, XRE family  35.59 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000972778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1907  XRE family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 107 aa  41.2  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2401  XRE family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000242769  hitchhiker  0.0000223583 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1147  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0843  XRE family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00421262 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3033  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  33.33 
 
 		 225 aa  41.2  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  40.58 
 
 		 72 aa  41.2  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0540  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 90 aa  41.2  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.229999 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4208  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.629555  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1276  transcriptional regulator, XRE family  35.38 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1207  transcriptional regulator, XRE family  35.38 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12255  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1228  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 85 aa  40.8  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4549  hypothetical protein  32.61 
 
 		 236 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1153  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.07 
 
 		 1143 aa  40.4  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648529  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0409  transcriptional regulator, XRE family  31.19 
 
 		 303 aa  40.4  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.481492 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3316  transcriptional regulator, XRE family  36.21 
 
 		 60 aa  40.8  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000216063  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1890  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 120 aa  40.4  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00515298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0631  hypothetical protein  40.35 
 
 		 73 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2787  transcriptional regulator, XRE family  49.02 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4019  XRE family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 72 aa  40.4  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0671372 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2624  XRE family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 73 aa  40  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.930034 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>