174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6784 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6784  CheW protein  100 
 
 		 199 aa  380  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.428989 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  31.47 
 
 		 163 aa  57.8  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1142  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.08 
 
 		 164 aa  52.8  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0223438  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  27.27 
 
 		 160 aa  52.8  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1420  CheW protein  28.19 
 
 		 161 aa  52.8  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.701601  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0809  CheW protein  27.03 
 
 		 163 aa  52.4  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1769  CheW protein  23.24 
 
 		 160 aa  52  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4231  putative CheW protein  33.33 
 
 		 221 aa  52  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1491  CheW domain-containing protein  32.86 
 
 		 215 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000195231  normal  0.824381 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0612  CheW protein  26.47 
 
 		 166 aa  51.2  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.398331 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  27.63 
 
 		 164 aa  50.8  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2689  CheW protein  25.93 
 
 		 155 aa  51.2  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1096  CheW protein  32.86 
 
 		 221 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.153582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2991  putative CheW protein  28.19 
 
 		 169 aa  50.1  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.5403  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2771  CheW protein  37.5 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0420843  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1198  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  27.88 
 
 		 158 aa  49.3  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.841781  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2986  putative CheW protein  28.38 
 
 		 162 aa  49.7  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.344963  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2314  CheW protein  26.21 
 
 		 165 aa  49.7  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07620  putative CheW protein  19.59 
 
 		 165 aa  49.3  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000372381  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  26.97 
 
 		 164 aa  48.9  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  32.94 
 
 		 169 aa  48.9  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1918  CheW protein  27.52 
 
 		 161 aa  48.9  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.33362  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0575  CheW protein  29.73 
 
 		 164 aa  48.5  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.447704  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.43 
 
 		 164 aa  48.5  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0280  CheW protein  29.09 
 
 		 155 aa  48.1  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.128089  normal  0.922662 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0874  CheW protein  37.1 
 
 		 167 aa  48.1  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0776  CheW protein  27.66 
 
 		 228 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.01614 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0587  CheW protein  28.29 
 
 		 174 aa  47.8  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.647124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1208  CheW protein  39.36 
 
 		 179 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0917816 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2676  CheW protein  36.46 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0640816  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.11 
 
 		 164 aa  46.6  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  26.57 
 
 		 178 aa  47  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1195  CheW protein  36.46 
 
 		 212 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0365  CheW protein  30.37 
 
 		 175 aa  47.4  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  decreased coverage  0.00626903 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0138  putative CheW protein  22.33 
 
 		 147 aa  47  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0706424  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0218  putative CheW protein  22.33 
 
 		 147 aa  47  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  24.14 
 
 		 163 aa  47.4  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1078  CheW protein  33.33 
 
 		 160 aa  46.2  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.603821  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0932  CheW protein  34.55 
 
 		 165 aa  46.2  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0978481 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  27.52 
 
 		 157 aa  46.2  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0185  CheW protein  24.72 
 
 		 183 aa  46.6  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3800  CheW protein  26.13 
 
 		 176 aa  45.8  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2121  CheW protein  25 
 
 		 253 aa  45.8  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2408  CheW protein  35.87 
 
 		 152 aa  45.8  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.492759  normal  0.123205 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2144  chemotaxis protein cheW  25.96 
 
 		 175 aa  45.8  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.929583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3304  CheW protein  38.46 
 
 		 479 aa  45.8  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.948049 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  28.57 
 
 		 157 aa  45.4  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2102  CheW protein  24.07 
 
 		 150 aa  45.4  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0517911  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1843  CheW protein  28.47 
 
 		 164 aa  45.8  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.718513  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3029  CheW protein  27.69 
 
 		 163 aa  45.4  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2648  CheW protein  26.53 
 
 		 163 aa  45.4  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34231  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1014  putative purine-binding chemotaxis protein CheW  22.92 
 
 		 520 aa  45.4  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4187  CheW protein  23.87 
 
 		 171 aa  45.4  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.370753  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1623  CheW protein  25.17 
 
 		 167 aa  45.1  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0546  chemotaxis signal transduction protein, CheW-like  32.73 
 
 		 171 aa  45.4  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.32366e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1531  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  29.33 
 
 		 313 aa  45.4  0.0006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.577848  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  25.23 
 
 		 159 aa  45.1  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1871  CheW protein  30 
 
 		 185 aa  45.4  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.688459 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  34.48 
 
 		 163 aa  45.4  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2148  CheW protein  28.43 
 
 		 140 aa  45.1  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0798486  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  24.49 
 
 		 159 aa  45.1  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3789  CheW protein  33.82 
 
 		 162 aa  45.1  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.763569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3135  CheW protein  35.88 
 
 		 132 aa  45.1  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3063  CheW protein  33.82 
 
 		 162 aa  45.1  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  23.57 
 
 		 167 aa  45.1  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1144  CheW-like protein  32.63 
 
 		 184 aa  45.1  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.990234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2360  putative CheW protein  40.35 
 
 		 173 aa  44.7  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.210142  normal  0.140243 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  25.56 
 
 		 164 aa  44.7  0.0009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.19 
 
 		 164 aa  44.3  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2026  CheW protein  28.81 
 
 		 148 aa  44.3  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0784  CheW-like protein  23.81 
 
 		 179 aa  43.9  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.883745 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  22.66 
 
 		 164 aa  44.3  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1375  CheW protein  36.36 
 
 		 194 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2482  CheW protein  29.25 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.259604  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  27.34 
 
 		 163 aa  44.3  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  23.58 
 
 		 154 aa  44.3  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2973  CheW protein  29.33 
 
 		 175 aa  43.9  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110924 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4127  CheW protein  31.47 
 
 		 221 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0808304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2578  CheW protein  29.25 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.322319  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1667  putative CheW protein  26.47 
 
 		 141 aa  44.3  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.33191  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0333  chemotaxis protein CheV  26.09 
 
 		 318 aa  43.1  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  24.06 
 
 		 165 aa  43.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0627  CheW protein  39.62 
 
 		 194 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5600  CheW-like protein  25 
 
 		 158 aa  43.9  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944828  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1692  CheW protein  39.34 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0484464  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0602  CheW protein  41.51 
 
 		 194 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3681  purine-binding chemotaxis protein  25.96 
 
 		 183 aa  43.5  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.501979  normal  0.0481885 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1773  CheW protein  34 
 
 		 161 aa  43.5  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0311  chemotaxis protein CheV  26.09 
 
 		 318 aa  43.1  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0165  CheW protein  30.36 
 
 		 183 aa  43.9  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1763  CheW protein  39.34 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  29.59 
 
 		 163 aa  43.9  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2293  putative CheW protein  41.51 
 
 		 150 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.164304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4203  CheW protein  28.37 
 
 		 163 aa  43.9  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.017726  normal  0.169541 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  24.06 
 
 		 165 aa  43.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0656  CheW protein  26 
 
 		 162 aa  43.9  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211882 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  29.47 
 
 		 147 aa  43.1  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0196  response regulator receiver modulated CheW protein  43.48 
 
 		 346 aa  43.1  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.031176  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3216  CheW protein  32.73 
 
 		 174 aa  43.1  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.83638 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0240  putative CheW protein  27.47 
 
 		 325 aa  43.1  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.476867  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>