More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6769 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_6769  regulatory protein GntR HTH  100 
 
 
261 aa  517  1e-146  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  35.78 
 
 
245 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  38.03 
 
 
233 aa  117  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  35.2 
 
 
240 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  31.56 
 
 
239 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1263  GntR domain protein  31.25 
 
 
229 aa  109  5e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  32.42 
 
 
241 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1084  regulatory protein GntR HTH  32.63 
 
 
226 aa  104  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00753008  hitchhiker  0.00000253482 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1464  GntR domain protein  33.33 
 
 
249 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.232072 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10503  GntR family transcriptional regulator  32.75 
 
 
242 aa  103  4e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000487705  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  33.18 
 
 
239 aa  103  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  35.19 
 
 
227 aa  102  7e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
230 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0362  GntR domain-containing protein  37.78 
 
 
261 aa  100  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  31.9 
 
 
241 aa  100  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4037  GntR domain protein  33.18 
 
 
226 aa  100  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  33.47 
 
 
239 aa  99.8  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2727  GntR family transcriptional regulator  31.94 
 
 
239 aa  99.4  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.45563  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2771  GntR family transcriptional regulator  31.94 
 
 
239 aa  99.4  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.908882  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  32.19 
 
 
233 aa  99.4  6e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2904  GntR domain protein  36.26 
 
 
240 aa  98.2  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111996  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2942  regulatory protein GntR, HTH  36.65 
 
 
240 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0684718  normal  0.415025 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3963  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
269 aa  96.7  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  35.71 
 
 
240 aa  96.7  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  36.05 
 
 
255 aa  96.3  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2241  GntR domain protein  32.8 
 
 
227 aa  95.9  5e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0923  GntR domain protein  29.6 
 
 
230 aa  95.5  8e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0612567  normal  0.0530485 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3543  GntR domain-containing protein  37.16 
 
 
235 aa  95.5  8e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.909399 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4488  regulatory protein GntR HTH  33.19 
 
 
252 aa  94.4  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1362  GntR domain protein  31.76 
 
 
231 aa  95.1  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.971171  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2274  GntR family transcriptional regulator  33.15 
 
 
232 aa  94.4  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000375173  decreased coverage  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0943  regulatory protein GntR HTH  27.6 
 
 
242 aa  94.7  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1453  GntR domain protein  32.93 
 
 
231 aa  94  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  31.67 
 
 
238 aa  94.4  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0527  GntR domain-containing protein  33.6 
 
 
258 aa  94  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.914747  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4648  transcriptional regulator NanR  29.3 
 
 
234 aa  94  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.462339  normal  0.769273 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  30.96 
 
 
243 aa  93.6  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  30.4 
 
 
240 aa  93.2  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3935  transcriptional regulator PdhR  34.58 
 
 
250 aa  92.8  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.470057  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5880  GntR domain protein  35.35 
 
 
223 aa  92.8  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3857  transcriptional regulator PdhR  34.58 
 
 
250 aa  92.8  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000012948 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3914  transcriptional regulator PdhR  34.58 
 
 
250 aa  92.8  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.517213  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4055  transcriptional regulator PdhR  34.58 
 
 
250 aa  92.8  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112662  normal  0.466854 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  37.25 
 
 
252 aa  92.8  6e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2757  GntR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
239 aa  92  9e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.578268  normal  0.348506 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0423  transcriptional regulator PdhR  33.61 
 
 
250 aa  91.7  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4763  transcriptional regulator NanR  28.37 
 
 
235 aa  91.3  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436481  normal  0.284781 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4257  transcriptional regulator, GntR family  30.05 
 
 
226 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00030759 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0427  transcriptional regulator PdhR  33.61 
 
 
250 aa  91.7  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.988139  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3600  transcriptional regulator PdhR  33.61 
 
 
250 aa  91.7  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.988331  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0425  transcriptional regulator PdhR  33.61 
 
 
250 aa  91.7  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.113174  normal  0.0306695 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6461  GntR domain protein  33.33 
 
 
257 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0712738  hitchhiker  0.00000516822 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0328  GntR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
221 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.661086 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5153  GntR domain-containing protein  31.06 
 
 
239 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.25689  normal  0.577182 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1705  regulatory protein GntR HTH  31.9 
 
 
256 aa  90.1  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0259893  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
255 aa  90.1  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10060  transcriptional regulator, GntR family  33.93 
 
 
226 aa  90.5  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815539  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2087  fatty acid responsive transcription factor FadR domain protein  32.18 
 
 
233 aa  90.1  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.30946e-19 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4197  GntR family transcriptional regulator  30.42 
 
 
255 aa  89.7  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.675851  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0374  transcriptional regulator PdhR  34.44 
 
 
250 aa  89.4  5e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.783921  hitchhiker  0.000643873 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3068  transcriptional regulator NanR  26.29 
 
 
235 aa  89  6e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2500  GntR transcriptional regulators family  30.58 
 
 
243 aa  89.4  6e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3401  GntR domain-containing protein  30.95 
 
 
235 aa  89  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2075  GntR domain-containing protein  33.66 
 
 
255 aa  89  7e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0915  GntR domain-containing protein  29.09 
 
 
226 aa  88.6  8e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  30.04 
 
 
225 aa  89  8e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1999  fatty acid metabolism regulator  34.36 
 
 
239 aa  88.6  9e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00814717  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2363  fatty acid metabolism regulator  34.36 
 
 
239 aa  88.6  9e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000339682  normal  0.326287 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0202  GntR-like  31.4 
 
 
257 aa  88.6  9e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2109  fatty acid metabolism regulator  34.36 
 
 
239 aa  88.6  9e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.109018  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1983  fatty acid metabolism regulator  34.15 
 
 
239 aa  87.8  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0199399  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7456  regulatory protein GntR HTH  32.17 
 
 
237 aa  88.6  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0768739  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  30.18 
 
 
337 aa  87.8  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3384  transcriptional regulator PdhR  33.19 
 
 
250 aa  88.2  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0673  transcriptional regulator PdhR  33.33 
 
 
254 aa  88.6  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1537  putative GntR domain protein  27.69 
 
 
239 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2132  GntR family transcriptional regulator  29.65 
 
 
246 aa  88.2  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2187  GntR domain-containing protein  31.84 
 
 
239 aa  87.8  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00327996  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1947  fatty acid metabolism regulator  34.36 
 
 
239 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0438592  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10597  GntR family transcriptional regulator  37.16 
 
 
240 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1943  fatty acid metabolism regulator  34.36 
 
 
239 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0247778  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1328  fatty acid metabolism regulator  34.36 
 
 
239 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000224704  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0754  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 
255 aa  87  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.393325  normal  0.323423 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1513  fatty acid metabolism regulator  34.36 
 
 
239 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.127061  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3418  transcriptional regulator PdhR  33.89 
 
 
250 aa  87.8  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.530869  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4012  transcriptional regulator PdhR  33.01 
 
 
254 aa  87.4  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.152194  normal  0.323384 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2589  GntR family transcriptional regulator  31.96 
 
 
255 aa  87.4  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00059476 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0787  GntR domain protein  34.78 
 
 
237 aa  87.8  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.812552  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2003  fatty acid metabolism regulator  34.36 
 
 
239 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.69959  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0399  GntR domain protein  35.37 
 
 
224 aa  87.8  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9327  putative transcriptional regulator  33.5 
 
 
229 aa  87  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1707  GntR domain protein  35.03 
 
 
252 aa  87  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0659  transcriptional regulator PdhR  36.9 
 
 
254 aa  86.7  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.01329  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0418  transcriptional regulator PdhR  31.17 
 
 
250 aa  86.3  5e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1972  putative pyruvate dehydrogenase complex repressor  30.56 
 
 
260 aa  86.3  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0510687  normal  0.668194 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0633  transcriptional regulator PdhR  32.2 
 
 
254 aa  86.3  5e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.498815  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  27.7 
 
 
241 aa  85.9  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3569  transcriptional regulator PdhR  32.07 
 
 
254 aa  85.9  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2748  fatty acid metabolism regulator  34.59 
 
 
239 aa  85.9  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000401699  decreased coverage  0.0000363622 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1948  fatty acid metabolism regulator  32.5 
 
 
239 aa  85.5  7e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00527579  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>