More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6621 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_6621  ABC transporter related protein  100 
 
 
525 aa  1055    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000823555 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0106  xylose transporter ATP-binding subunit  53.24 
 
 
505 aa  530  1e-149  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2021  xylose transporter ATP-binding subunit  53.05 
 
 
504 aa  513  1e-144  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0157  ABC transporter related  50.29 
 
 
507 aa  511  1e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3279  ABC transporter related  51.97 
 
 
505 aa  489  1e-137  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4900  D-ribose transporter ATP binding protein  50 
 
 
501 aa  489  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200163  hitchhiker  0.000000993507 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0080  xylose transporter ATP-binding subunit  47.51 
 
 
513 aa  485  1e-136  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4435  xylose transporter ATP-binding subunit  47.81 
 
 
513 aa  485  1e-136  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1986  ABC transporter related  48.44 
 
 
511 aa  484  1e-135  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19490  ABC transporter related  50.88 
 
 
509 aa  485  1e-135  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.524485  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0775  xylose transporter ATP-binding subunit  48.92 
 
 
512 aa  484  1e-135  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  53.29 
 
 
512 aa  482  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1667  ABC transporter related  50.39 
 
 
507 aa  479  1e-134  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.2144  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4153  xylose transporter ATP-binding subunit  47.61 
 
 
513 aa  481  1e-134  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  51.68 
 
 
512 aa  476  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  48.24 
 
 
501 aa  476  1e-133  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0062  xylose transporter ATP-binding subunit  48.01 
 
 
513 aa  477  1e-133  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  51.68 
 
 
512 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  51.68 
 
 
512 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  50.6 
 
 
514 aa  478  1e-133  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000341  ribose ABC transport system ATP-binding protein RbsA  49.33 
 
 
501 aa  477  1e-133  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06145  D-ribose transporter ATP binding protein  48.75 
 
 
501 aa  473  1e-132  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4274  D-ribose transporter ATP binding protein  49.01 
 
 
516 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  51.81 
 
 
504 aa  474  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4094  D-ribose transporter ATP binding protein  49.01 
 
 
516 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  47.85 
 
 
501 aa  473  1e-132  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4165  D-ribose transporter ATP binding protein  49.01 
 
 
501 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.846402  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  51.08 
 
 
513 aa  472  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4215  D-ribose transporter ATP binding protein  49.01 
 
 
516 aa  474  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.777457 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  51.68 
 
 
514 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  51.18 
 
 
513 aa  474  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4109  D-ribose transporter ATP binding protein  49.01 
 
 
516 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114584  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1371  D-ribose transporter ATP binding protein  49.32 
 
 
504 aa  469  1.0000000000000001e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0058  xylose transporter ATP-binding subunit  46.81 
 
 
510 aa  470  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0239  ABC transporter related protein  49.12 
 
 
512 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.301252  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  49.5 
 
 
501 aa  469  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4100  xylose transporter ATP-binding subunit  46.81 
 
 
510 aa  470  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3837  xylose transporter ATP-binding subunit  49.21 
 
 
515 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.623686  normal  0.377794 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4914  xylose transporter ATP-binding subunit  49.21 
 
 
515 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00466146  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0341  D-ribose transporter ATP binding protein  48.92 
 
 
501 aa  469  1.0000000000000001e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4174  D-ribose transporter ATP binding protein  49 
 
 
501 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283711  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3660  ABC transporter related  48.63 
 
 
512 aa  470  1.0000000000000001e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1865  ABC transporter related  49.02 
 
 
508 aa  470  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.251568  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3977  D-ribose transporter ATP binding protein  47.61 
 
 
501 aa  465  9.999999999999999e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  49.3 
 
 
501 aa  466  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2519  ABC transporter related protein  49.7 
 
 
515 aa  465  9.999999999999999e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.760037  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4265  D-ribose transporter ATP binding protein  48.41 
 
 
501 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146477  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09550  ABC transporter related  50.69 
 
 
500 aa  466  9.999999999999999e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.58805  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4115  D-ribose transporter ATP binding protein  48.02 
 
 
501 aa  467  9.999999999999999e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.684938  normal  0.0182067 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  49.3 
 
 
495 aa  468  9.999999999999999e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03635  fused D-ribose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  48.21 
 
 
501 aa  465  1e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.483932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4218  ABC transporter related protein  48.21 
 
 
501 aa  465  1e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3415  xylose transporter ATP-binding subunit  48.62 
 
 
511 aa  462  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.055967  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1634  xylose transporter ATP-binding subunit  49.01 
 
 
514 aa  464  1e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.714407  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  50.1 
 
 
516 aa  463  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3004  D-xylose ABC transporter, ATP-binding protein  46.39 
 
 
528 aa  465  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.271477  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  49.8 
 
 
524 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  51.2 
 
 
503 aa  462  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4187  xylose transporter ATP-binding subunit  48.62 
 
 
517 aa  462  1e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.300713  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4245  D-ribose transporter ATP binding protein  48.02 
 
 
501 aa  462  1e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0036959 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2301  xylose transporter ATP-binding subunit  47.02 
 
 
518 aa  464  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.538906  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  50.49 
 
 
524 aa  462  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4117  D-ribose transporter ATP binding protein  48.21 
 
 
501 aa  465  1e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.159229 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4943  xylose transporter ATP-binding subunit  47.01 
 
 
513 aa  462  1e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0106818 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  49.8 
 
 
524 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  50.2 
 
 
514 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  51.18 
 
 
499 aa  464  1e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2577  ABC transporter related  50 
 
 
507 aa  464  1e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.589076 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  50.2 
 
 
514 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03580  hypothetical protein  48.21 
 
 
501 aa  465  1e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550483  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  49.8 
 
 
524 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  50.2 
 
 
514 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5185  D-ribose transporter ATP binding protein  48.02 
 
 
501 aa  462  1e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0631054  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3965  D-ribose transporter ATP binding protein  48.21 
 
 
501 aa  465  1e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3041  ABC transporter related protein  47.25 
 
 
511 aa  464  1e-129  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4075  xylose transporter ATP-binding subunit  48.62 
 
 
517 aa  462  1e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.818661  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4109  ABC transporter related  46.95 
 
 
512 aa  465  1e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000359898 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0010  D-ribose transporter ATP binding protein  49.51 
 
 
500 aa  463  1e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3890  xylose transporter ATP-binding subunit  47.01 
 
 
513 aa  462  1e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1586  ABC transporter related  48.42 
 
 
513 aa  462  1e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.192443  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  49.8 
 
 
499 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0143  D-xylose ABC transporter, ATPase subunit  47.01 
 
 
513 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  49.9 
 
 
524 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2122  ABC transporter related  49.02 
 
 
511 aa  461  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2885  xylose transporter ATP-binding subunit  46.45 
 
 
518 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.700201  normal  0.945677 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3402  ABC transporter related protein  49.7 
 
 
522 aa  458  9.999999999999999e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.146962 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4063  xylose transporter ATP-binding subunit  47.01 
 
 
513 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3770  xylose transporter ATP-binding subunit  47.01 
 
 
513 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0503  ABC transporter related  47.44 
 
 
508 aa  460  9.999999999999999e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.689531  normal  0.17522 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  48.62 
 
 
524 aa  460  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0147  xylose transporter ATP-binding subunit  47.01 
 
 
513 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  50.29 
 
 
524 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  49.8 
 
 
499 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1683  ABC transporter related  50 
 
 
503 aa  459  9.999999999999999e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305806  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2913  ABC transporter related  46.6 
 
 
512 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.169153  normal  0.630322 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3955  xylose transporter ATP-binding subunit  46.81 
 
 
513 aa  460  9.999999999999999e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0515  D-ribose transporter ATP binding protein  48.62 
 
 
501 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0154  xylose transporter ATP-binding subunit  46.61 
 
 
513 aa  461  9.999999999999999e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  47.65 
 
 
501 aa  457  1e-127  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  49.21 
 
 
497 aa  457  1e-127  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>