More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6576 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6576  ribosomal protein L31  100 
 
 		 70 aa  146  8e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.770296 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0733  50S ribosomal protein L31  59.09 
 
 		 120 aa  92.8  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.243379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0725  ribosomal protein L31  62.71 
 
 		 120 aa  92.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0689  50S ribosomal protein L31  62.71 
 
 		 121 aa  92  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.649908  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0724  50S ribosomal protein L31  62.71 
 
 		 120 aa  92.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2874  LSU ribosomal protein L31P  62.71 
 
 		 66 aa  92  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000802115  hitchhiker  0.0000000061454 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1504  50S ribosomal protein L31  67.21 
 
 		 67 aa  91.7  3e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.063569  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2781  ribosomal protein L31  67.8 
 
 		 71 aa  92  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00270559  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0377  50S ribosomal protein L31  64.41 
 
 		 66 aa  90.9  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171245  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0322  ribosomal protein L31  63.93 
 
 		 67 aa  89  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.385126  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4064  50S ribosomal protein L31  61.02 
 
 		 65 aa  88.6  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000459753  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0163  ribosomal protein L31  55.74 
 
 		 66 aa  88.2  4e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0237125  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0028  50S ribosomal protein L31  60.94 
 
 		 74 aa  87.8  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2650  50S ribosomal protein L31  60 
 
 		 66 aa  87.4  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000189789  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0223  50S ribosomal protein L31  57.38 
 
 		 66 aa  87.4  6e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0349  50S ribosomal protein L31  59.38 
 
 		 75 aa  87  7e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000414614  normal  0.989516 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1712  ribosomal protein L31  63.33 
 
 		 76 aa  87.4  7e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00361207  normal  0.842415 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2172  50S ribosomal protein L31P  62.71 
 
 		 70 aa  87  8e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.316232  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3107  50S ribosomal protein L31  59.32 
 
 		 65 aa  86.7  9e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.938901  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0385  50S ribosomal protein L31  59.38 
 
 		 75 aa  86.7  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000143362  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4125  ribosomal protein L31  57.58 
 
 		 71 aa  86.7  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000665259  hitchhiker  0.000000407647 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2086  50S ribosomal protein L31  53.85 
 
 		 75 aa  86.3  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0471  ribosomal protein L31  63.33 
 
 		 73 aa  85.9  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000394944  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1026  50S ribosomal protein L31  60 
 
 		 66 aa  85.5  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000398278  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0136  50S ribosomal protein L31P  62.9 
 
 		 69 aa  85.1  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000785169  normal  0.746727 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2073  50S ribosomal protein L31  57.81 
 
 		 75 aa  84.7  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000264126  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4835  50S ribosomal protein L31  58.33 
 
 		 65 aa  84.7  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000883025  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3438  50S ribosomal protein L31  55.74 
 
 		 66 aa  84.3  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2060  50S ribosomal protein L31  57.81 
 
 		 75 aa  84.3  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.725226  normal  0.0217721 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3375  ribosomal protein L31  57.63 
 
 		 69 aa  84  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00476029  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2399  50S ribosomal protein L31  60.66 
 
 		 66 aa  84  6e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.728854 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2694  ribosomal protein L31  57.38 
 
 		 69 aa  84  7e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000747794  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1861  50S ribosomal protein L31  56.92 
 
 		 72 aa  84  7e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.985858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0929  50S ribosomal protein L31  53.12 
 
 		 115 aa  84  7e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000140602  hitchhiker  1.58847e-17 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0801  ribosomal protein L31  58.62 
 
 		 68 aa  83.6  8e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000158788  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0243  ribosomal protein L31  55.56 
 
 		 68 aa  83.6  9e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1810  ribosomal protein L31  52.54 
 
 		 74 aa  83.6  9e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.731859  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2982  50S ribosomal protein L31  60.66 
 
 		 69 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2402  50S ribosomal protein L31  56.25 
 
 		 75 aa  82.8  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.115749  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3328  50S ribosomal protein L31  54.1 
 
 		 66 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000410329  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0453  50S ribosomal protein L31  59.02 
 
 		 71 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0490  ribosomal protein L31  53.97 
 
 		 94 aa  82  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3712  50S ribosomal protein L31  53.45 
 
 		 73 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000169936  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0823  ribosomal protein L31  54.69 
 
 		 73 aa  82  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.013762  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4496  50S ribosomal protein L31  57.63 
 
 		 70 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1256  ribosomal protein L31  52.86 
 
 		 82 aa  81.6  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0693718  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4428  50S ribosomal protein L31  57.63 
 
 		 70 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1235  ribosomal protein L31  50 
 
 		 76 aa  82  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.803826  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45340  ribosomal protein L31  57.58 
 
 		 70 aa  82  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0374331  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4426  50S ribosomal protein L31  57.63 
 
 		 70 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4342  50S ribosomal protein L31  57.63 
 
 		 70 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2301  50S ribosomal protein L31  59.02 
 
 		 70 aa  82  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4312  50S ribosomal protein L31  57.63 
 
 		 70 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2381  ribosomal protein L31  53.73 
 
 		 67 aa  81.3  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00476114  normal  0.0805503 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1910  ribosomal protein L31  54.1 
 
 		 67 aa  81.3  0.000000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0287  50S ribosomal protein L31  54.1 
 
 		 66 aa  81.3  0.000000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3793  ribosomal protein L31  57.63 
 
 		 71 aa  80.9  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2084  ribosomal protein L31  59.02 
 
 		 74 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000294546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2999  50S ribosomal protein L31  54.1 
 
 		 74 aa  80.9  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00163219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0537  50S ribosomal protein L31P  56.34 
 
 		 70 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0604  50S ribosomal protein L31P  58.06 
 
 		 71 aa  80.9  0.000000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2156  ribosomal protein L31  57.63 
 
 		 67 aa  80.9  0.000000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000333298  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1442  50S ribosomal protein L31  59.02 
 
 		 71 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3807  50S ribosomal protein L31  51.72 
 
 		 72 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1472  50S ribosomal protein L31P  50.77 
 
 		 77 aa  80.5  0.000000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000025459  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0061  50S ribosomal protein L31  53.33 
 
 		 66 aa  80.5  0.000000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000149068  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0704  50S ribosomal protein L31  49.3 
 
 		 75 aa  80.1  0.000000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0686  50S ribosomal protein L31  49.3 
 
 		 75 aa  80.1  0.000000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0039  50S ribosomal protein L31  53.62 
 
 		 68 aa  80.1  0.000000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.196539 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0327  50S ribosomal protein L31  54.84 
 
 		 70 aa  80.1  0.000000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.127242  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1150  50S ribosomal protein L31  50.82 
 
 		 66 aa  80.1  0.00000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18000  ribosomal protein L31  55.93 
 
 		 68 aa  80.1  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000315531  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0170  50S ribosomal protein L31  55.93 
 
 		 71 aa  80.1  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1087  ribosomal protein L31  54.69 
 
 		 70 aa  79.7  0.00000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2306  50S ribosomal protein L31  48.44 
 
 		 70 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.684418 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2460  ribosomal protein L31  51.52 
 
 		 71 aa  79.7  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1204  ribosomal protein L31  52.31 
 
 		 72 aa  79.7  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.72511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1997  50S ribosomal protein L31  55.22 
 
 		 72 aa  79.3  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.285312  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0184  50S ribosomal protein L31  52.31 
 
 		 71 aa  79.3  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0118  ribosomal protein L31  55.93 
 
 		 71 aa  79.3  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3758  50S ribosomal protein L31  53.97 
 
 		 70 aa  79  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03520  50S ribosomal subunit protein L31  55 
 
 		 70 aa  78.6  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4340  50S ribosomal protein L31  49.21 
 
 		 74 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.062409 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1009  50S ribosomal protein L31  49.28 
 
 		 78 aa  78.6  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.622612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4960  ribosomal protein L31  50.77 
 
 		 100 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1908  ribosomal protein L31  50 
 
 		 75 aa  78.6  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.188174  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1420  50S ribosomal protein L31  50.82 
 
 		 66 aa  78.2  0.00000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0828  50S ribosomal protein L31  50.85 
 
 		 66 aa  78.6  0.00000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00960478  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09910  LSU ribosomal protein L31P  52.86 
 
 		 69 aa  78.2  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5087  50S ribosomal protein L31  50.77 
 
 		 71 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2967  ribosomal protein L31  52.46 
 
 		 67 aa  77.8  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000717812  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1068  50S ribosomal protein L31  53.85 
 
 		 69 aa  77.8  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.113765  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0151  50S ribosomal protein L31  49.18 
 
 		 66 aa  77.4  0.00000000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.515789  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0170  50S ribosomal protein L31  50.85 
 
 		 65 aa  77.4  0.00000000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0447  50S ribosomal protein L31  55 
 
 		 70 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0191  50S ribosomal protein L31  49.18 
 
 		 66 aa  77.4  0.00000000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3888  50S ribosomal protein L31  47.06 
 
 		 81 aa  77  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3962  50S ribosomal protein L31  47.06 
 
 		 81 aa  77  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.845671  normal  0.37282 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3874  50S ribosomal protein L31  47.06 
 
 		 81 aa  77  0.00000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0952306 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3776  50S ribosomal protein L31  53.33 
 
 		 70 aa  77  0.00000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.653741  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>