More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6559 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_6559  protein of unknown function UPF0047  100 
 
 
143 aa  290  7e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.552252  normal  0.186603 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1293  hypothetical protein  62.32 
 
 
140 aa  186  9e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1102  hypothetical protein  62.6 
 
 
139 aa  185  2e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.495108  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1264  hypothetical cytosolic protein  62.77 
 
 
150 aa  182  2.0000000000000003e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1322  hypothetical protein  62.77 
 
 
139 aa  181  3e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1691  hypothetical protein  62.6 
 
 
138 aa  175  2e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00156174  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1152  protein of unknown function UPF0047  61.48 
 
 
139 aa  168  3e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.916503  hitchhiker  0.00000047058 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1880  hypothetical protein  58.02 
 
 
137 aa  164  5e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2851  protein of unknown function UPF0047  56.83 
 
 
140 aa  162  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4457  hypothetical protein  54.2 
 
 
138 aa  160  5.0000000000000005e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.42448  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1302  protein of unknown function UPF0047  50.72 
 
 
139 aa  157  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0065  hypothetical protein  51.45 
 
 
139 aa  151  2e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0632  hypothetical protein  51.11 
 
 
139 aa  149  8.999999999999999e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1762  hypothetical protein  56.3 
 
 
142 aa  148  3e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.292066  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3428  protein of unknown function UPF0047  49.28 
 
 
138 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2407  hypothetical protein  51.91 
 
 
137 aa  145  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2676  protein of unknown function UPF0047  49.28 
 
 
138 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0643  protein of unknown function UPF0047  51.8 
 
 
142 aa  143  6e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4874  hypothetical protein  51.54 
 
 
137 aa  143  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.903926  hitchhiker  0.00000135956 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3983  hypothetical protein  48.59 
 
 
139 aa  142  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000000552293  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2190  hypothetical protein  52.76 
 
 
139 aa  142  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2118  protein of unknown function UPF0047  49.3 
 
 
139 aa  140  4e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0078  hypothetical protein  45.95 
 
 
149 aa  140  4e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3301  hypothetical protein  51.41 
 
 
139 aa  141  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0121064 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1273  protein of unknown function UPF0047  52.67 
 
 
138 aa  140  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0131  hypothetical protein  49.28 
 
 
139 aa  140  7e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1587  hypothetical protein  49.28 
 
 
139 aa  140  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.185989  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0099  hypothetical protein  49.28 
 
 
139 aa  140  7e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.426584  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0104  hypothetical protein  49.28 
 
 
139 aa  140  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5223  hypothetical protein  51.41 
 
 
139 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4801  hypothetical protein  49.28 
 
 
139 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.639835  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3367  hypothetical protein  49.28 
 
 
139 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00750068  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4149  hypothetical protein  49.28 
 
 
139 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.183368  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5144  hypothetical protein  50 
 
 
139 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.356001  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0742  conserved hypothetical protein TIGR00149  47.48 
 
 
143 aa  138  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0889  protein of unknown function UPF0047  47.48 
 
 
143 aa  138  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2219  hypothetical protein  52.63 
 
 
140 aa  138  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.334245  normal  0.457573 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0081  protein of unknown function UPF0047  50 
 
 
139 aa  137  6e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0686334  normal  0.0165253 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5528  protein of unknown function UPF0047  48.48 
 
 
140 aa  135  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.652918  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1335  hypothetical protein  47.83 
 
 
140 aa  135  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.970106  decreased coverage  0.00476745 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2128  hypothetical protein  51.85 
 
 
140 aa  135  3.0000000000000003e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.594367  normal  0.370679 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3433  protein of unknown function UPF0047  52.55 
 
 
160 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2384  hypothetical protein  48.48 
 
 
139 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5282  protein of unknown function UPF0047  47.83 
 
 
139 aa  134  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.421624  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2889  hypothetical protein  47.83 
 
 
139 aa  134  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1467  hypothetical protein  50 
 
 
144 aa  134  5e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3510  hypothetical protein  53.28 
 
 
139 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3238  hypothetical protein  50.35 
 
 
160 aa  133  8e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.143896 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2217  hypothetical protein  46.97 
 
 
139 aa  133  8e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.851507  hitchhiker  0.001424 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0527  Alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  46.97 
 
 
139 aa  132  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3095  hypothetical protein  54.84 
 
 
126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0121064  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0267  hypothetical protein  58.4 
 
 
141 aa  132  1.9999999999999998e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.508397  normal  0.204565 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2940  protein of unknown function UPF0047  52.67 
 
 
140 aa  131  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.250526  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3562  protein of unknown function UPF0047  50.36 
 
 
160 aa  130  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.140371 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3660  protein of unknown function UPF0047  53.28 
 
 
139 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.180865  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2650  hypothetical protein  48.48 
 
 
139 aa  130  3.9999999999999996e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1542  protein of unknown function UPF0047  46.05 
 
 
166 aa  130  6e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2680  protein of unknown function UPF0047  51.91 
 
 
140 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.686166  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2820  hypothetical protein  50.72 
 
 
144 aa  129  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.269441  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1665  hypothetical protein  50.37 
 
 
139 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000223212  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1688  hypothetical protein  50 
 
 
195 aa  128  3e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2784  hypothetical protein  47.48 
 
 
139 aa  127  4.0000000000000003e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00159172  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1124  hypothetical protein  47.1 
 
 
140 aa  127  4.0000000000000003e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0627  hypothetical protein  44.74 
 
 
166 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.299074  decreased coverage  0.00428994 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1893  hypothetical protein  46.97 
 
 
139 aa  126  8.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.323991 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3690  hypothetical protein  48.18 
 
 
160 aa  126  8.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2137  hypothetical protein  47.29 
 
 
142 aa  126  9.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.435583  normal  0.930073 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4820  hypothetical protein  51.2 
 
 
157 aa  125  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.277818  normal  0.824892 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2403  protein of unknown function UPF0047  46.32 
 
 
140 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1889  protein of unknown function UPF0047  51.85 
 
 
143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05561  hypothetical protein  38.26 
 
 
151 aa  124  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1262  protein of unknown function UPF0047  47.73 
 
 
140 aa  124  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.46172 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04921  hypothetical protein  40.54 
 
 
212 aa  124  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0925424  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69780  hypothetical protein  50 
 
 
141 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.570881 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1451  hypothetical protein  46.85 
 
 
157 aa  124  5e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4360  hypothetical protein  43.18 
 
 
139 aa  124  6e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002339  hypothetical protein  45.45 
 
 
148 aa  124  6e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00014  hypothetical protein  44.7 
 
 
159 aa  124  6e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0725  protein of unknown function UPF0047  54.72 
 
 
141 aa  123  8.000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2246  protein of unknown function UPF0047  45.71 
 
 
140 aa  123  8.000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0261  hypothetical protein  55.66 
 
 
141 aa  123  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6028  hypothetical protein  50 
 
 
141 aa  122  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0188  hypothetical protein  57.01 
 
 
141 aa  122  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0249  hypothetical protein  43.18 
 
 
145 aa  122  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00650906  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0219  hypothetical protein  57.69 
 
 
141 aa  121  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0674  hypothetical protein  48.09 
 
 
205 aa  120  4e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.798458  normal  0.310853 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0850  hypothetical protein  47.33 
 
 
155 aa  120  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.162209  normal  0.719995 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03928  hypothetical protein  46.76 
 
 
138 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.17037  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3936  protein of unknown function UPF0047  46.76 
 
 
138 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03888  hypothetical protein  46.76 
 
 
138 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.143638  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47770  hypothetical protein  53.7 
 
 
141 aa  119  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.141406  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5559  conserved hypothetical protein TIGR00149  46.76 
 
 
138 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.484103  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3971  hypothetical protein  46.76 
 
 
138 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.147621 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3740  hypothetical protein  47.2 
 
 
141 aa  119  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.597829  hitchhiker  0.000337865 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4518  hypothetical protein  46.76 
 
 
138 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4298  hypothetical protein  46.76 
 
 
138 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32835  conserved hypothetical protein  43.18 
 
 
147 aa  119  9.999999999999999e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.805601  normal  0.755477 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0559  hypothetical protein  45.93 
 
 
139 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49270  predicted protein  47.26 
 
 
154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4570  hypothetical protein  46.04 
 
 
138 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>