More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6499 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  100 
 
 
205 aa  413  9.999999999999999e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1665  polysaccharide export protein  35.57 
 
 
189 aa  114  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1596  polysaccharide export protein  33.54 
 
 
206 aa  112  4.0000000000000004e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.10693 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  38.12 
 
 
205 aa  109  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1536  polysaccharide export protein  30.14 
 
 
207 aa  107  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.595422  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3871  polysaccharide export protein  35.37 
 
 
214 aa  107  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.631942  normal  0.0416181 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1224  polysaccharide export protein  38.46 
 
 
191 aa  106  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2696  polysaccharide export protein  34.31 
 
 
196 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.975578 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4816  polysaccharide export protein  38.73 
 
 
253 aa  106  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.769943 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1658  polysaccharide export protein  36.31 
 
 
277 aa  105  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00056738  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01391  exopolysaccharide xanthan biosynthesis export protein GumB  33.5 
 
 
232 aa  105  6e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1312  polysaccharide export protein  36.54 
 
 
191 aa  105  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0132  putative polysaccharide export protein, outer membrane  31.34 
 
 
206 aa  104  9e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.679141  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1660  polysaccharide export protein  32.35 
 
 
214 aa  103  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.614311  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2495  polysaccharide export protein  28.37 
 
 
212 aa  103  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0309  polysaccharide export protein  34.33 
 
 
195 aa  104  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313034  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  36.65 
 
 
270 aa  103  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3509  polysaccharide export protein  31.86 
 
 
213 aa  103  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000101119 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2392  polysaccharide export protein  32.84 
 
 
210 aa  102  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3174  polysaccharide export protein  31.55 
 
 
185 aa  102  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2618  polysaccharide export protein  36.05 
 
 
193 aa  101  8e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.676482  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1156  polysaccharide export protein  32.12 
 
 
187 aa  99.8  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508119  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1903  polysaccharide export protein  35.19 
 
 
221 aa  99.4  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1985  polysaccharide export protein  28.22 
 
 
208 aa  99.4  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560938  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4708  polysaccharide export protein  35.85 
 
 
219 aa  99.8  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655126  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4531  polysaccharide export protein  34.1 
 
 
208 aa  99.8  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2881  polysaccharide export protein  30.05 
 
 
229 aa  99.4  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1175  polysaccharide biosynthesis/export protein  40.68 
 
 
152 aa  99  5e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.265571  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3117  polysaccharide export protein  33.17 
 
 
209 aa  98.2  7e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222433  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0810  polysaccharide export protein  32.02 
 
 
184 aa  97.8  9e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5025  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.16 
 
 
211 aa  96.7  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1525  polysaccharide export protein  34.84 
 
 
243 aa  96.7  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4819  polysaccharide export protein  33.95 
 
 
200 aa  97.1  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2650  polysaccharide export protein  32.62 
 
 
192 aa  96.7  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28267  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0160  polysaccharide export protein  27.72 
 
 
208 aa  96.3  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0458  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.85 
 
 
193 aa  97.1  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1538  periplasmic polysaccharide export protein  34.15 
 
 
268 aa  95.9  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0242  polysaccharide export protein  34.78 
 
 
264 aa  95.9  4e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0211  polysaccharide export protein  32.34 
 
 
201 aa  95.9  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1538  GumB protein  30.15 
 
 
249 aa  95.5  4e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2738  polysaccharide export protein  32.09 
 
 
192 aa  95.5  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2833  polysaccharide export protein  32.09 
 
 
192 aa  95.5  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3282  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  29.81 
 
 
209 aa  94.7  8e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.306881  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1444  polysaccharide export protein  32.76 
 
 
252 aa  94.7  9e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7871  hypothetical protein  33.33 
 
 
238 aa  94.7  9e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1482  polysaccharide export protein  29.65 
 
 
270 aa  94.4  1e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.242862  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1588  polysaccharide export protein  31.22 
 
 
257 aa  94.4  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.101952  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0148  capsular polysaccharide export protein, putative  30.85 
 
 
277 aa  94  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1858  polysaccharide export protein  32.99 
 
 
192 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.210486  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2193  polysaccharide export protein  32.99 
 
 
192 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.136002  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2957  polysaccharide export protein  32.18 
 
 
190 aa  94  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836808  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5609  polysaccharide export protein  43.33 
 
 
419 aa  94  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02478  polysaccharide export periplasmic protein  32.08 
 
 
153 aa  92.8  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0783  capsule polysaccharide export protein, putative  32.82 
 
 
195 aa  93.2  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0776  putative capsule polysaccharide export protein  32.82 
 
 
196 aa  93.2  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4616  polysaccharide export protein  46.23 
 
 
439 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5320  polysaccharide export protein  32.55 
 
 
213 aa  92.8  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.884665  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4037  polysaccharide export protein  34.59 
 
 
235 aa  92.8  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1809  polysaccharide export protein  32.49 
 
 
192 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3013  polysaccharide export protein  31.06 
 
 
270 aa  93.2  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2529  polysaccharide export protein  30.77 
 
 
208 aa  92.4  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3405  hypothetical protein  36 
 
 
410 aa  92.4  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0853  polysaccharide export protein  31.09 
 
 
191 aa  92.4  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.317786 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5213  polysaccharide export protein  32 
 
 
190 aa  92  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118373  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4418  polysaccharide export protein  34.24 
 
 
220 aa  91.7  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0586  polysaccharide export protein  31.02 
 
 
185 aa  91.3  8e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0658  polysaccharide export protein  31.09 
 
 
188 aa  91.3  9e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.308974  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1695  polysaccharide export protein  29.88 
 
 
356 aa  90.9  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.24357  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2506  polysaccharide export protein  30.98 
 
 
196 aa  90.9  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2963  polysaccharide export protein  30.05 
 
 
213 aa  91.3  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0834  polysaccharide export protein  28.64 
 
 
309 aa  90.9  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4093  hypothetical protein  35.06 
 
 
356 aa  90.9  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.818341  normal  0.104815 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2586  polysaccharide export protein  34.18 
 
 
184 aa  90.5  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.693737  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3319  polysaccharide export protein  33.91 
 
 
351 aa  89.7  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.211792 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1487  polysaccharide export protein  32.02 
 
 
193 aa  89.7  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0270462  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4134  polysaccharide export protein  39.46 
 
 
455 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.285347  normal  0.57622 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4940  polysaccharide export protein  33.96 
 
 
247 aa  90.1  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.89418 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0460  hypothetical protein  38.66 
 
 
175 aa  90.1  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4502  polysaccharide export protein  39.46 
 
 
455 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.317742 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0281  polysaccharide export outer membrane protein  29.29 
 
 
207 aa  89.7  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.585377  normal  0.906054 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0979  polysaccharide export protein  29.47 
 
 
234 aa  89.4  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  35.76 
 
 
264 aa  89  5e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2464  polysaccharide export protein  33.96 
 
 
235 aa  88.6  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.719315  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06665  hypothetical protein  34.71 
 
 
373 aa  88.6  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1414  polysaccharide export protein  33.96 
 
 
234 aa  88.2  7e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.639365 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3192  polysaccharide export protein  30.24 
 
 
227 aa  88.6  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3311  polysaccharide export protein  30.57 
 
 
324 aa  88.2  8e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.328062 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3558  polysaccharide export protein  27.89 
 
 
185 aa  87.4  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2397  polysaccharide export protein  31.48 
 
 
207 aa  87.8  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00232374  normal  0.762704 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0791  polysaccharide export protein  33.67 
 
 
216 aa  87.4  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.22146  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2814  polysaccharide export protein  38.1 
 
 
177 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3126  polysaccharide export protein  32.48 
 
 
185 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1114  polysaccharide export protein  33.33 
 
 
431 aa  87  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0366205  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4309  polysaccharide export protein  34.81 
 
 
495 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0799  polysaccharide export protein  35.33 
 
 
393 aa  86.7  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2730  polysaccharide export protein  32.48 
 
 
185 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1170  polysaccharide export protein  26.42 
 
 
211 aa  85.9  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3000  polysaccharide export protein  32.94 
 
 
186 aa  85.1  6e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.912736  normal  0.44921 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1072  polysaccharide export protein  33.96 
 
 
178 aa  85.1  7e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.875269  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2336  polysaccharide export protein  27.59 
 
 
215 aa  84.7  8e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.125477  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>