More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6462 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6462  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 342 aa  662    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1947  OmpA/MotB domain protein  30.23 
 
 		 490 aa  153  4e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0070  OmpA/MotB domain protein  32.72 
 
 		 458 aa  139  7.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  34.38 
 
 		 637 aa  106  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2321  OmpA/MotB domain-containing protein  31.61 
 
 		 727 aa  97.4  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0697  OmpA/MotB domain-containing protein  32.24 
 
 		 487 aa  96.3  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  33.17 
 
 		 623 aa  94.4  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  31.36 
 
 		 374 aa  94  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  36.65 
 
 		 498 aa  92.8  8e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  28.77 
 
 		 456 aa  92.8  8e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5254  OmpA/MotB domain protein  35.58 
 
 		 1264 aa  90.1  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  35.04 
 
 		 1755 aa  90.1  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  34.26 
 
 		 1987 aa  89.7  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  29.69 
 
 		 478 aa  89.4  9e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  33.16 
 
 		 320 aa  87  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  36.07 
 
 		 506 aa  84.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4651  Thrombospondin type 3 repeat protein  38.96 
 
 		 671 aa  83.2  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0694576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  28.14 
 
 		 427 aa  81.6  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5779  OmpA/MotB domain protein  35.98 
 
 		 570 aa  78.6  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  31.77 
 
 		 544 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  30.92 
 
 		 510 aa  77.8  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  31.25 
 
 		 543 aa  76.3  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  30.37 
 
 		 542 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3703  OmpA/MotB domain protein  30.65 
 
 		 386 aa  74.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.150466  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3645  OmpA/MotB family outer membrane protein  33.48 
 
 		 412 aa  72.8  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.340454  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2080  OmpA/MotB  27.65 
 
 		 366 aa  72.8  0.000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  30.62 
 
 		 319 aa  72.8  0.000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_011891  A2cp1_3786  OmpA/MotB domain protein  33.77 
 
 		 386 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.432228  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  26.67 
 
 		 417 aa  71.6  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  30.61 
 
 		 440 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  26.89 
 
 		 381 aa  70.9  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1527  thrombospondin type 3 repeat-containing protein  38.79 
 
 		 722 aa  69.3  0.00000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.000000000497915 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1526  thrombospondin type 3 repeat-containing protein  37.7 
 
 		 722 aa  68.2  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000258397 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0594  OmpA/MotB  25 
 
 		 232 aa  67.4  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  30.05 
 
 		 294 aa  65.9  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  29.76 
 
 		 429 aa  64.3  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1528  ATPase  50 
 
 		 792 aa  63.5  0.000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000453148 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  33.04 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1209  OmpA/MotB domain-containing protein  29.91 
 
 		 369 aa  62.8  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.469659  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  29.26 
 
 		 447 aa  62  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  33.04 
 
 		 263 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  30.32 
 
 		 350 aa  62  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  30.32 
 
 		 350 aa  62  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  30.97 
 
 		 345 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  29.68 
 
 		 344 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  28.19 
 
 		 380 aa  60.5  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2542  OmpA/MotB domain protein  27.03 
 
 		 704 aa  60.5  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  31.48 
 
 		 641 aa  60.5  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  30.32 
 
 		 344 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  35.34 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  30.32 
 
 		 344 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  30.32 
 
 		 344 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  29.68 
 
 		 344 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  30.32 
 
 		 344 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  26.35 
 
 		 402 aa  59.7  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  33.67 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  24.7 
 
 		 345 aa  59.7  0.00000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  33.67 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  31.3 
 
 		 260 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3473  OmpA/MotB domain protein  35.11 
 
 		 222 aa  58.9  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.773207  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  26.91 
 
 		 401 aa  58.9  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  33.04 
 
 		 262 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2677  outer membrane protein  27.93 
 
 		 380 aa  58.9  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  31.3 
 
 		 263 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  30.21 
 
 		 1026 aa  58.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4286  OmpA/MotB domain protein  30.43 
 
 		 540 aa  58.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.451181  normal  0.14038 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0127  OmpA/MotB domain protein  36.89 
 
 		 364 aa  58.2  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1229  putative outer membrane protein  29.11 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000815007  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1066  OmpA/MotB  30.7 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  30.05 
 
 		 428 aa  57  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02373  hypothetical protein  29.49 
 
 		 208 aa  57  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0250  OmpA/MotB  29.44 
 
 		 368 aa  57  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000280448  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  31.3 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  26.18 
 
 		 420 aa  56.6  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1854  OmpA/MotB  32.43 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  28.83 
 
 		 424 aa  55.8  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  28.18 
 
 		 670 aa  56.2  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0311  outer membrane protein, OmpA family  33.33 
 
 		 275 aa  55.5  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2359  peptidoglycan-associated lipoprotein  31.37 
 
 		 170 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.12328 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0746  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  25.95 
 
 		 890 aa  55.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.34227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5767  OmpA/MotB family protein  30.91 
 
 		 214 aa  55.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00312455  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1967  OmpA/MotB domain-containing protein  25.66 
 
 		 213 aa  55.5  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0899  OmpA/MotB  36.96 
 
 		 205 aa  55.5  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000025431  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  28.45 
 
 		 215 aa  55.5  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  26.03 
 
 		 351 aa  55.8  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  25 
 
 		 440 aa  55.5  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0858  OmpA/MotB domain-containing protein  28.95 
 
 		 214 aa  55.8  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000645517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1054  ompA family protein  31.58 
 
 		 215 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2984  ompA family protein  31.58 
 
 		 215 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00790258  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0711  ompA family protein  31.58 
 
 		 215 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0433789  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  33.01 
 
 		 412 aa  54.7  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2302  ompA family protein  31.58 
 
 		 215 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1059  ompA family protein  31.58 
 
 		 215 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2107  OmpA/MotB domain-containing protein  29.36 
 
 		 417 aa  55.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.425223  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  26.07 
 
 		 365 aa  55.1  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1615  ompA family protein  31.58 
 
 		 215 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1811  OmpA/MotB domain-containing protein  26.21 
 
 		 322 aa  54.7  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000728339  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1814  OmpA/MotB  34.26 
 
 		 321 aa  54.3  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0898802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  30.39 
 
 		 220 aa  54.3  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.19452  normal  0.568242 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3536  outer membrane protein  25.93 
 
 		 505 aa  53.9  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.624164 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>