77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6461 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6461  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 137 aa  254  4e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4456  transcriptional regulator, XRE family  51.15 
 
 		 147 aa  105  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6836  transcriptional regulator, XRE family  47.83 
 
 		 199 aa  104  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5877  transcriptional regulator, XRE family  52.99 
 
 		 133 aa  96.7  9e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00666894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0063  transcriptional regulator, XRE family  64.29 
 
 		 137 aa  91.7  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4237  transcriptional regulator, XRE family  40.15 
 
 		 140 aa  78.6  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.55821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5705  transcriptional regulator, XRE family  37.86 
 
 		 139 aa  75.1  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.712971 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0579  transcriptional regulator, XRE family  52.17 
 
 		 70 aa  74.7  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00759938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1190  transcriptional regulator, XRE family  45.95 
 
 		 79 aa  70.5  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1091  transcriptional regulator, XRE family  45.95 
 
 		 79 aa  70.1  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1224  transcriptional regulator, XRE family  44.59 
 
 		 79 aa  68.6  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0288237  hitchhiker  0.00260767 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4304  transcriptional regulator, XRE family  36.69 
 
 		 131 aa  68.2  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.663644 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0570  transcriptional regulator, XRE family  44.59 
 
 		 79 aa  68.2  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.532171 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0731  transcriptional regulator, XRE family  47.83 
 
 		 70 aa  64.3  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.228536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0677  transcriptional regulator, XRE family  47.83 
 
 		 70 aa  63.5  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2893  transcriptional regulator, XRE family  46.38 
 
 		 70 aa  62.8  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0147391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6835  transcriptional regulator, XRE family  47.76 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2822  transcriptional regulator, XRE family  50.82 
 
 		 80 aa  60.8  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.161107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5917  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  43.28 
 
 		 113 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.19317  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6604  transcriptional regulator, XRE family  37.21 
 
 		 126 aa  53.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.608837  normal  0.251603 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3445  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 76 aa  48.1  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0664347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2567  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  45.45 
 
 		 120 aa  48.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.375259 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3301  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 234 aa  47.8  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2247  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  45.83 
 
 		 119 aa  47.8  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.616763 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0025  putative DNA-binding protein  34.62 
 
 		 81 aa  47  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0532078  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2714  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 204 aa  46.6  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2922  transcriptional regulator, XRE family  42.67 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.562834  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0697  transcriptional regulator, XRE family  28.08 
 
 		 151 aa  45.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0921  XRE family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 132 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000830973  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2505  XRE family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 220 aa  45.1  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2780  transcriptional regulator, XRE family  33.88 
 
 		 152 aa  45.1  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0182016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0432  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  31.46 
 
 		 113 aa  44.7  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000371645  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0418  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  31.46 
 
 		 113 aa  44.7  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00527482  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 191 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 191 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 191 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6009  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 219 aa  43.9  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.285081  hitchhiker  0.00726065 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3344  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 125 aa  43.5  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 191 aa  43.9  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2015  Cro/CI family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00850971  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0540  helix-turn-helix domain-containing protein  32.86 
 
 		 90 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.229999 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0267  XRE family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.257195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2578  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 182 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0039  PbsX family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81047  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2086  helix-turn-helix domain protein  35.19 
 
 		 327 aa  42.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0272363  normal  0.126806 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6574  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 227 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0448941 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3035  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 208 aa  42  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.348685 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0378  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 120 aa  42  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.309443  hitchhiker  0.00198984 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2104  helix-turn-helix domain-containing protein  37.7 
 
 		 95 aa  42  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0694198  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5130  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  37.5 
 
 		 188 aa  41.2  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.87177  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  25.76 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06250  predicted transcriptional regulator  30.49 
 
 		 256 aa  41.6  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0155  XRE family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 115 aa  41.2  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5637  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 227 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.76756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4506  XRE family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 189 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1702  transcriptional regulator, XRE family  34.44 
 
 		 218 aa  41.2  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2733  helix-turn-helix domain-containing protein  38.96 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000416248  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2995  transcriptional regulator  38.89 
 
 		 191 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0735878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  38.1 
 
 		 263 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5414  XRE family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 192 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1721  XRE family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 201 aa  40.8  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4589  transcriptional regulator, XRE family  27.88 
 
 		 188 aa  40.8  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4867  XRE family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 192 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1414  XRE family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 179 aa  40.8  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0298473 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0889  putative transcriptional regulator, XRE family  37.93 
 
 		 99 aa  40.8  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 374 aa  40.8  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0474  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 192 aa  40.8  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.554508  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2259  transcriptional regulator, XRE family  32.43 
 
 		 255 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3859  transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 		 93 aa  40.4  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4729  XRE family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 192 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5790  XRE family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 90 aa  40.4  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.902407  hitchhiker  0.00485473 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5543  XRE family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 192 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.827143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5317  XRE family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 192 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221767  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3465  XRE family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 142 aa  40  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4439  transcriptional regulator, XRE family  38.81 
 
 		 190 aa  40.4  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957299  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4529  transcriptional regulator, XRE family  36.71 
 
 		 120 aa  40.4  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>