More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6458 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011728  BbuZS7_0257  leucyl-tRNA synthetase  46.47 
 
 
840 aa  811  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.847152  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0665  leucyl-tRNA synthetase  49.59 
 
 
807 aa  832  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0505  leucyl-tRNA synthetase  50 
 
 
806 aa  828  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf171  leucyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 
804 aa  715  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0551  leucyl-tRNA synthetase  48.83 
 
 
806 aa  833  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.629594 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1363  leucyl-tRNA synthetase  40.42 
 
 
923 aa  696  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2116  leucyl-tRNA synthetase  44.07 
 
 
825 aa  704  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0598  leucyl-tRNA synthetase  49.65 
 
 
805 aa  832  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0537  leucyl-tRNA synthetase  43.72 
 
 
826 aa  712  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.993969  normal  0.956377 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0609  leucyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 
860 aa  647  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.212281  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1654  leucyl-tRNA synthetase  50.56 
 
 
857 aa  839  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.119933 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0201  leucyl-tRNA synthetase  50.35 
 
 
835 aa  871  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3868  leucyl-tRNA synthetase  48.05 
 
 
857 aa  804  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579289  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3702  leucyl-tRNA synthetase  43.67 
 
 
859 aa  676  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.031134  hitchhiker  5.16313e-07 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0627  leucyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 
868 aa  678  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.339775  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0705  leucyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 
860 aa  644  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0764  leucyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 
860 aa  644  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.544549  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0808  leucyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 
860 aa  645  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3236  leucyl-tRNA synthetase  46.93 
 
 
856 aa  750  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4851  leucyl-tRNA synthetase  55.82 
 
 
802 aa  984  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.36273  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_56599  predicted protein  50 
 
 
899 aa  825  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1098  leucyl-tRNA synthetase  42.87 
 
 
859 aa  668  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  2.77445e-09 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1563  leucyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 
810 aa  713  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.954503  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4875  leucyl-tRNA synthetase  55.93 
 
 
802 aa  986  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0380  leucyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 
806 aa  746  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0731  leucyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 
860 aa  647  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0463588  normal  0.765619 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0619  leucyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 
821 aa  644  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0751  leucyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 
860 aa  647  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0691  leucyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 
860 aa  644  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.229457  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0751  leucyl-tRNA synthetase  44.77 
 
 
824 aa  714  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2819  leucyl-tRNA synthetase  43.69 
 
 
832 aa  677  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01672  leucyl-tRNA synthetase  41.91 
 
 
867 aa  661  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.126917  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0662  leucyl-tRNA synthetase  42 
 
 
860 aa  647  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0168621  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0780  leucyl-tRNA synthetase  45.31 
 
 
824 aa  757  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3003  leucyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 
860 aa  647  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.27573  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0668  leucyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 
860 aa  647  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00449058  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0694  leucyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 
860 aa  650  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.28668  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01222  leucyl-tRNA synthetase  42.52 
 
 
862 aa  658  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0077  leucyl-tRNA synthetase  44.41 
 
 
904 aa  707  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.622899  hitchhiker  8.64885e-05 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1280  leucyl-tRNA synthetase  42.36 
 
 
870 aa  657  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1522  leucyl-tRNA synthetase  44.3 
 
 
819 aa  747  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2926  leucyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 
860 aa  641  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.454668  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2719  leucyl-tRNA synthetase  42.47 
 
 
838 aa  670  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3415  leucyl-tRNA synthetase  56.81 
 
 
802 aa  997  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3311  leucyl-tRNA synthetase  42.91 
 
 
874 aa  674  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134968  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1121  leucyl-tRNA synthetase  41.91 
 
 
873 aa  650  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2915  leucyl-tRNA synthetase  43.04 
 
 
815 aa  664  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1848  leucyl-tRNA synthetase  54.87 
 
 
805 aa  940  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.164346  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0256  leucyl-tRNA synthetase  43.61 
 
 
823 aa  731  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3479  leucyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 
863 aa  664  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  1.60913e-05 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1207  leucyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 
860 aa  644  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.338789  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3143  leucyl-tRNA synthetase  42.82 
 
 
868 aa  659  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0606298  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3015  leucyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 
860 aa  641  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.652989  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1865  leucyl-tRNA synthetase  44.82 
 
 
826 aa  689  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.107054  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4847  leucyl-tRNA synthetase  43.42 
 
 
868 aa  682  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0255  leucyl-tRNA synthetase  42.96 
 
 
816 aa  669  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00083346  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4570  leucyl-tRNA synthetase  55.46 
 
 
802 aa  981  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1842  leucyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 
860 aa  641  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0344  leucyl-tRNA synthetase  44.19 
 
 
828 aa  734  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.361332  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0938  leucyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 
807 aa  735  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3447  leucyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 
874 aa  675  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00121594 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08751  leucyl-tRNA synthetase  41.03 
 
 
872 aa  640  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.115344  hitchhiker  0.00155899 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4419  leucyl-tRNA synthetase  42.64 
 
 
814 aa  673  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3451  leucyl-tRNA synthetase  47.04 
 
 
952 aa  762  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0150406 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2438  leucyl-tRNA synthetase  44.37 
 
 
865 aa  713  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000200562  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0829  leucyl-tRNA synthetase  41.77 
 
 
1016 aa  702  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0577341  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10040  leucyl-tRNA synthetase  46.8 
 
 
969 aa  740  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.928861 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1860  leucyl-tRNA synthetase  45.25 
 
 
854 aa  721  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04530  leucyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 
944 aa  715  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0736  leucyl-tRNA synthetase  43.65 
 
 
865 aa  717  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0349  leucyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 
865 aa  661  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1582  leucyl-tRNA synthetase  41.69 
 
 
838 aa  641  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0708157  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0671  leucyl-tRNA synthetase  54.61 
 
 
906 aa  954  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004217  leucyl-tRNA synthetase  42.97 
 
 
857 aa  670  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  8.07673e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4829  leucyl-tRNA synthetase  46.04 
 
 
951 aa  748  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.304554  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6458  leucyl-tRNA synthetase  100 
 
 
854 aa  1753  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1744  leucyl-tRNA synthetase  41.4 
 
 
818 aa  639  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.123788  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3144  leucyl-tRNA synthetase  42.06 
 
 
860 aa  649  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0666  leucyl-tRNA synthetase  58.8 
 
 
805 aa  1036  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1804  leucyl-tRNA synthetase  44.78 
 
 
824 aa  727  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5392  leucyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 
978 aa  722  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1425  leucyl-tRNA synthetase  42.63 
 
 
831 aa  671  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.164097  normal  0.135581 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3306  leucyl-tRNA synthetase  44.78 
 
 
828 aa  719  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  1.02477e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0698  leucyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 
829 aa  652  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0323791  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1009  leucyl-tRNA synthetase  46.39 
 
 
816 aa  739  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2223  leucyl-tRNA synthetase  43.47 
 
 
990 aa  679  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1033  leucyl-tRNA synthetase  45.25 
 
 
875 aa  714  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.229858 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2429  leucyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 
820 aa  654  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.83241 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4214  leucyl-tRNA synthetase  45.1 
 
 
952 aa  734  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2055  leucyl-tRNA synthetase  38.92 
 
 
853 aa  653  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3733  leucyl-tRNA synthetase  49.05 
 
 
936 aa  838  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0244486  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4914  leucyl-tRNA synthetase  45.08 
 
 
950 aa  753  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.782007 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1074  leucyl-tRNA synthetase  46.09 
 
 
875 aa  717  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.902773 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2132  leucyl-tRNA synthetase  44.31 
 
 
863 aa  648  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.142112 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3367  leucyl-tRNA synthetase  45.33 
 
 
963 aa  736  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.737021  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2829  leucyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 
819 aa  673  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.747648 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1712  leucyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 
949 aa  721  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0837375  normal  0.849359 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0944  leucine--tRNA ligase  40.27 
 
 
994 aa  674  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7138  leucyl-tRNA synthetase  42.77 
 
 
828 aa  666  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.480251 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_182  leucyl-tRNA synthetase  44.6 
 
 
813 aa  719  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00206077  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>