86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6443 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_6443  NHL repeat containing protein  100 
 
 
344 aa  672    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3670  NHL repeat-containing protein  30.3 
 
 
503 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1718  NHL repeat-containing protein  35.27 
 
 
487 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1280  NHL repeat-containing protein  29.88 
 
 
504 aa  98.6  1e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.164299  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1286  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.53 
 
 
493 aa  97.4  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4099  NHL repeat containing protein  29.89 
 
 
581 aa  95.9  9e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.649178  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1402  NHL repeat containing protein  32.94 
 
 
470 aa  93.6  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.649211  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  30.72 
 
 
1750 aa  90.5  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00583  hypothetical protein  31.65 
 
 
472 aa  88.2  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0567  Redoxin domain protein  30.36 
 
 
498 aa  87.4  4e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  30.83 
 
 
1351 aa  81.3  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7086  serine/threonine protein kinase  38.12 
 
 
732 aa  80.9  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0100  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.72 
 
 
612 aa  79  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  30.3 
 
 
1051 aa  78.6  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2063  NHL repeat containing protein  31.82 
 
 
652 aa  72.8  0.000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  35.17 
 
 
1030 aa  72.8  0.000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0097  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.38 
 
 
612 aa  70.9  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.328632  hitchhiker  0.000931017 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  32.28 
 
 
2296 aa  70.5  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  30.29 
 
 
963 aa  69.7  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4253  putative NHL repeat protein  33.07 
 
 
584 aa  68.9  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376441  normal  0.79365 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35610  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  28.49 
 
 
634 aa  68.6  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  32.16 
 
 
1026 aa  63.9  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6967  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.12 
 
 
612 aa  63.2  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.265007  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3914  NHL repeat-containing protein  27.66 
 
 
672 aa  62.8  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  23.18 
 
 
307 aa  62  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1291  hypothetical protein  23.62 
 
 
510 aa  62  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.984868  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4089  serine/threonine protein kinase  31.25 
 
 
772 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205571  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.16 
 
 
693 aa  60.8  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  33.78 
 
 
1292 aa  60.5  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  35.85 
 
 
850 aa  60.8  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0842  YD repeat-containing protein  29.27 
 
 
2831 aa  60.8  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  26.15 
 
 
892 aa  60.1  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  27.8 
 
 
1293 aa  60.1  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  27.05 
 
 
646 aa  59.7  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0027  Fibronectin type III domain protein  33.33 
 
 
460 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  26 
 
 
391 aa  58.9  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3901  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.78 
 
 
641 aa  58.2  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  24.92 
 
 
930 aa  57.4  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  24.92 
 
 
346 aa  57.8  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  33.49 
 
 
1763 aa  57.8  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  30.14 
 
 
1130 aa  56.6  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0173  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.38 
 
 
639 aa  55.5  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00772059 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  21.57 
 
 
903 aa  53.9  0.000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3716  NHL repeat containing protein  26.83 
 
 
674 aa  53.9  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  24.24 
 
 
709 aa  53.9  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  28.65 
 
 
439 aa  53.1  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2329  NHL repeat containing protein  30.07 
 
 
404 aa  53.1  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0716797  normal  0.125112 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  27.27 
 
 
1079 aa  51.6  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3814  NHL repeat containing protein  38.95 
 
 
359 aa  50.8  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000000186749  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25270  NHL repeat protein  29.09 
 
 
697 aa  50.8  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.671028  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  34.95 
 
 
1163 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  23.24 
 
 
668 aa  50.4  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  24.5 
 
 
522 aa  50.8  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1791  NHL repeat containing protein  26.24 
 
 
425 aa  50.4  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.326453  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7126  serine/threonine protein kinase  30.7 
 
 
770 aa  50.1  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4185  serine/threonine protein kinase  30.92 
 
 
719 aa  49.3  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  24.27 
 
 
579 aa  48.9  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2917  NHL repeat containing protein  38.68 
 
 
623 aa  49.3  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.304592  normal  0.453442 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0567  NHL repeat containing protein  30.95 
 
 
453 aa  48.9  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00166551  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  29.38 
 
 
1146 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3618  hypothetical protein  27.41 
 
 
362 aa  48.1  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3843  NHL repeat containing protein  31.22 
 
 
1046 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0246016 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  22.77 
 
 
676 aa  47.8  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4090  serine/threonine protein kinase  36.29 
 
 
756 aa  47.4  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.252638  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7288  serine/threonine protein kinase  31.54 
 
 
807 aa  46.6  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.30608 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0357  NHL repeat containing protein  24.55 
 
 
700 aa  46.6  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.18335e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  30.1 
 
 
841 aa  46.2  0.0009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  23.21 
 
 
343 aa  45.4  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2644  hypothetical protein  30.97 
 
 
359 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0696665  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  22.3 
 
 
525 aa  45.8  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2283  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25.32 
 
 
317 aa  45.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492267 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2446  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.08 
 
 
628 aa  44.7  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0385674 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  23.42 
 
 
831 aa  45.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1699  protein of unknown function DUF1533  26.19 
 
 
1916 aa  45.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4743  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.93 
 
 
457 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  27.59 
 
 
1140 aa  44.3  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3225  NHL repeat-containing protein  26.32 
 
 
365 aa  43.5  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13808  predicted protein  26.03 
 
 
1675 aa  43.5  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0947447  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38790  Peroxiredoxin  27.01 
 
 
644 aa  43.5  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.605672 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1591  NHL repeat containing protein  29.21 
 
 
686 aa  43.1  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.24269  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1861  Phage tail protein  31.07 
 
 
747 aa  43.1  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1920  NHL repeat-containing protein  23.04 
 
 
343 aa  43.1  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00542747  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5723  gluconolactonase precursor  28.67 
 
 
296 aa  43.1  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.299972  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  23.48 
 
 
786 aa  43.1  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2272  glycoside hydrolase family 26  22.18 
 
 
711 aa  42.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.738347  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0044  serine/threonine protein kinase  30.1 
 
 
863 aa  42.7  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0701705  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>