More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6416 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6416  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  100 
 
 		 362 aa  724    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  34.62 
 
 		 432 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3540  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  32.57 
 
 		 429 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000000050948  normal  1 
 
 
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  35.06 
 
 		 407 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  34.91 
 
 		 407 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  31.13 
 
 		 427 aa  125  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0592  TolB-like protein  38.05 
 
 		 438 aa  120  3.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  28.96 
 
 		 430 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  30.34 
 
 		 435 aa  114  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  32.56 
 
 		 443 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0859  WD40 domain-containing protein  29.5 
 
 		 442 aa  108  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.318178  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  33.89 
 
 		 572 aa  105  8e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0133  WD40 domain protein beta Propeller  31.62 
 
 		 445 aa  104  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0747  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  30.31 
 
 		 444 aa  104  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000257607  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1711  WD40 domain protein beta Propeller  30.38 
 
 		 444 aa  101  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000750977  decreased coverage  0.0000915698 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1910  TolB protein, putative  30.43 
 
 		 440 aa  101  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1279  WD40 domain-containing protein  30.98 
 
 		 428 aa  99.4  9e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0136  WD40 domain protein beta Propeller  30.32 
 
 		 419 aa  97.1  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3933  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  28.57 
 
 		 298 aa  97.1  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  35.19 
 
 		 567 aa  96.7  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0750  WD40 domain protein beta Propeller  27.91 
 
 		 441 aa  96.3  7e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000257042  normal  0.0548288 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2161  WD40 domain protein beta Propeller  28.25 
 
 		 440 aa  96.3  7e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000041437  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2210  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  31.17 
 
 		 438 aa  95.5  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000769838  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0303  translocation protein TolB  29.74 
 
 		 403 aa  94.7  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.307961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4155  transcriptional regulatory protein-like  33.33 
 
 		 717 aa  93.6  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.297616 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  29.74 
 
 		 434 aa  92.8  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0614  TolB protein, putative  28.46 
 
 		 449 aa  92.4  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00377452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1577  serine/threonine protein kinase  31.84 
 
 		 969 aa  92.4  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.713812 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2397  WD40 domain-containing protein  31.41 
 
 		 352 aa  92  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000884296 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0467  TolB domain-containing protein  32.75 
 
 		 450 aa  91.7  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.84052  normal  0.495381 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  28.57 
 
 		 426 aa  90.9  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2178  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  31.58 
 
 		 292 aa  90.9  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02684  translocation protein TolB  27.88 
 
 		 451 aa  90.5  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0273488  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0012  WD40 domain-containing protein  30.85 
 
 		 620 aa  90.5  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2455  translocation protein TolB  27.59 
 
 		 430 aa  89.7  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328002  normal  0.860267 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  30.66 
 
 		 427 aa  89  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  29.49 
 
 		 436 aa  89  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0659  TolB-like protein  29.79 
 
 		 434 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.481566  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0693  TolB domain protein  29.79 
 
 		 434 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180783  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0755  TolB domain-containing protein  27.85 
 
 		 457 aa  88.6  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0694  TolB domain protein  29.79 
 
 		 434 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1277  translocation protein TolB  27.41 
 
 		 432 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154906  normal  0.476044 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  28.02 
 
 		 446 aa  87.4  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1981  translocation protein TolB  29 
 
 		 440 aa  87.4  4e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1723  translocation protein TolB  29 
 
 		 443 aa  87  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0502645 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0759  translocation protein TolB  27.16 
 
 		 430 aa  86.7  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397862  normal  0.413932 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  32.82 
 
 		 441 aa  86.7  6e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0727  TolB domain-containing protein  31.02 
 
 		 437 aa  86.7  6e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.162759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  28.45 
 
 		 434 aa  86.3  7e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3920  translocation protein TolB  27.16 
 
 		 430 aa  86.7  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0501302 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0977  WD40 domain-containing protein  34.64 
 
 		 316 aa  86.3  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  27.71 
 
 		 438 aa  86.3  8e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  28.45 
 
 		 450 aa  85.9  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4436  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  33.85 
 
 		 442 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314306  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3729  WD40 domain protein beta Propeller  35.91 
 
 		 354 aa  85.5  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.135548  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1462  translocation protein TolB  28.27 
 
 		 442 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000134108  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2714  translocation protein TolB  27.16 
 
 		 441 aa  85.1  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0459045  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2092  translocation protein TolB  27.63 
 
 		 425 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626129  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  29.74 
 
 		 415 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  27.71 
 
 		 441 aa  85.1  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0590  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  32.49 
 
 		 590 aa  85.1  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0677  translocation protein TolB  27.11 
 
 		 431 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814489  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0686  translocation protein TolB  32.12 
 
 		 461 aa  84  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.223253  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0694  translocation protein TolB  27.11 
 
 		 431 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4427  translocation protein TolB  27.75 
 
 		 441 aa  84.3  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0925  WD40 domain protein beta Propeller  30.4 
 
 		 629 aa  84.3  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.775889  normal  0.417234 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36640  translocation protein TolB  27.14 
 
 		 430 aa  83.6  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.239695  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0769  translocation protein TolB  27.11 
 
 		 431 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.103724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3387  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  32.58 
 
 		 442 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.413738  normal  0.777637 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2587  translocation protein TolB  26.67 
 
 		 431 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1346  translocation protein TolB  26.84 
 
 		 421 aa  83.2  0.000000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4532  serine/threonine protein kinase  30.58 
 
 		 642 aa  83.6  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000271647  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3153  peptidase S41  29.41 
 
 		 1090 aa  83.2  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2050  translocation protein TolB  25.97 
 
 		 429 aa  82.8  0.000000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0782  translocation protein TolB  30.4 
 
 		 425 aa  82.8  0.000000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0181245  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0844  translocation protein TolB  26.84 
 
 		 431 aa  82.8  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0211285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0811  translocation protein TolB  26.84 
 
 		 431 aa  82.8  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.188067  normal  0.784941 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0907  translocation protein TolB  26.84 
 
 		 431 aa  82.8  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.077859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0875  translocation protein TolB  26.84 
 
 		 431 aa  82.8  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0139765  normal  0.325318 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2939  translocation protein TolB  26.61 
 
 		 451 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00432408  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0784  translocation protein TolB  26.84 
 
 		 431 aa  82.8  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000303788  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  27.16 
 
 		 432 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3119  translocation protein TolB  27.04 
 
 		 439 aa  82  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0800  translocation protein TolB  26.67 
 
 		 431 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.665253  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3972  tolB protein  26.77 
 
 		 433 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0956227  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1415  translocation protein TolB  26.77 
 
 		 433 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00100672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2717  translocation protein TolB  31.68 
 
 		 450 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.599754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0270  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  31 
 
 		 448 aa  81.3  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.989147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2194  translocation protein TolB  31.18 
 
 		 432 aa  81.6  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246481  normal  0.294233 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2360  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  24.46 
 
 		 446 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.28939 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0317  translocation protein TolB  26.6 
 
 		 431 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0520547  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2122  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  34.36 
 
 		 446 aa  81.6  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256883  normal  0.227077 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2731  translocation protein TolB  26.16 
 
 		 442 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00144802  decreased coverage  0.0000043993 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1279  translocation protein TolB  25.97 
 
 		 430 aa  80.9  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000335238  decreased coverage  0.00000521877 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1394  translocation protein TolB  27.23 
 
 		 442 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000203609  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0028  amidohydrolase  30.83 
 
 		 1062 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.847177  hitchhiker  0.00656795 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3512  translocation protein TolB  34.01 
 
 		 450 aa  80.5  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2538  translocation protein TolB  25.13 
 
 		 442 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000186682  hitchhiker  0.0000162747 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1742  translocation protein TolB  25.13 
 
 		 442 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000714613  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1853  translocation protein TolB  32 
 
 		 428 aa  80.5  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>