More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6392 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_6392  DNA primase  100 
 
 
605 aa  1225  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  42.73 
 
 
587 aa  352  1e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  43.12 
 
 
588 aa  336  7e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  37.64 
 
 
583 aa  335  2e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  37.93 
 
 
582 aa  333  5e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  40.73 
 
 
587 aa  326  7e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  41.27 
 
 
588 aa  313  5e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0256  DNA primase  37.79 
 
 
652 aa  310  5e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230248  normal  0.131007 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  31.32 
 
 
601 aa  310  5e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2679  DNA primase  40.32 
 
 
604 aa  309  1e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  34.31 
 
 
626 aa  306  6e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  41.77 
 
 
614 aa  306  1e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  7.25747e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  34.91 
 
 
599 aa  301  3e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  34.57 
 
 
605 aa  300  5e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  31.46 
 
 
600 aa  300  6e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  42.82 
 
 
599 aa  296  6e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  31.52 
 
 
604 aa  296  9e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  38.8 
 
 
598 aa  294  3e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1727  DNA primase  35.62 
 
 
611 aa  293  6e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0735  DNA primase  38.19 
 
 
675 aa  290  5e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  42.05 
 
 
598 aa  290  7e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0288  DNA primase  37.6 
 
 
651 aa  290  7e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.375271  normal  0.0229545 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  42.05 
 
 
598 aa  290  8e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  42.05 
 
 
598 aa  290  8e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  42.7 
 
 
600 aa  289  9e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  32.76 
 
 
613 aa  288  1e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  42.05 
 
 
598 aa  289  1e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  42.05 
 
 
598 aa  289  1e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  1.25124e-06  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  42.05 
 
 
598 aa  289  1e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  42.05 
 
 
571 aa  289  1e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  2.15576e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  42.05 
 
 
598 aa  289  1e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  9.94887e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  42.05 
 
 
598 aa  289  1e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0315  DNA primase  41.5 
 
 
655 aa  288  2e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  38.67 
 
 
601 aa  288  2e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0720  DNA primase  38.49 
 
 
647 aa  288  2e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205397  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  42.33 
 
 
598 aa  288  2e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  37.39 
 
 
584 aa  287  4e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  32.68 
 
 
593 aa  285  1e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  42.22 
 
 
619 aa  282  1e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0014  DNA primase  36.22 
 
 
645 aa  281  3e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0081672  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0491  DNA primase  37.48 
 
 
599 aa  280  6e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.34781  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0548  DNA primase  41.62 
 
 
660 aa  279  1e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00859761  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1128  DNA primase  33.56 
 
 
598 aa  278  2e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0012752  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0527  DNA primase  33.33 
 
 
588 aa  278  3e-73  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00124146  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0757  DNA primase  44.16 
 
 
647 aa  277  4e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.255391  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1136  DNA primase  33.99 
 
 
544 aa  276  6e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  1.06361e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5973  DNA primase  34.92 
 
 
703 aa  276  8e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.328857 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0602  DNA primase  36.19 
 
 
636 aa  275  1e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2268  DNA primase  37.65 
 
 
587 aa  275  2e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1213  DNA primase  35.17 
 
 
601 aa  275  2e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.140428 
 
 
-
 
NC_002936  DET0552  DNA primase  32.18 
 
 
590 aa  274  3e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1292  DNA primase  36.97 
 
 
694 aa  274  3e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.320597 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_492  DNA primase  32.76 
 
 
590 aa  274  4e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0123236  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0631  DNA primase  37.21 
 
 
630 aa  273  7e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0622  DNA primase  41.33 
 
 
641 aa  272  1e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.156261 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0927  DNA primase  32.32 
 
 
653 aa  272  2e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.584516  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3836  DNA primase  36.95 
 
 
646 aa  271  3e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0564656  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3785  DNA primase  36.95 
 
 
646 aa  271  3e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  35.07 
 
 
604 aa  270  4e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0586  DNA primase  41.74 
 
 
632 aa  270  5e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.284459  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  29.87 
 
 
595 aa  270  5e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0742  DNA primase  33.92 
 
 
621 aa  270  7e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00012137  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1895  DNA primase  36.01 
 
 
573 aa  269  9e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.158344  normal  0.0137969 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0611  DNA primase  40.56 
 
 
641 aa  269  1e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.753185  normal  0.102101 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1275  DNA primase  37.27 
 
 
629 aa  268  2e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3096  DNA primase  40.36 
 
 
660 aa  268  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0761  DNA primase  43.08 
 
 
607 aa  268  3e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.139011  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  37.44 
 
 
656 aa  267  4e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1589  DNA primase  35.96 
 
 
633 aa  267  4e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.567407  normal  0.0206676 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0572  DNA primase  35.84 
 
 
629 aa  266  7e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.26895  normal  0.474628 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0587  DNA primase  40.56 
 
 
642 aa  266  7e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.356346  normal  0.0328717 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1835  DNA primase  37.3 
 
 
623 aa  265  1e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1654  DNA primase  37.46 
 
 
605 aa  265  2e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000285307  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1427  DNA primase  32.94 
 
 
602 aa  265  2e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0410677  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1620  DNA primase  37.46 
 
 
605 aa  265  2e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0393306  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4297  DNA primase  33.92 
 
 
640 aa  264  3e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.624136  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6776  DNA primase  42.6 
 
 
627 aa  264  4e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.258909  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3425  DNA primase  35.63 
 
 
632 aa  263  6e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2351  DNA primase  36.11 
 
 
616 aa  263  7e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2323  DNA primase  36.77 
 
 
576 aa  263  8e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0128644  hitchhiker  0.00849609 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15911  DNA primase  41.11 
 
 
684 aa  262  1e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7521  DNA primase  42.56 
 
 
629 aa  262  1e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0761  DNA primase  37.47 
 
 
623 aa  262  1e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1295  DNA primase  41.11 
 
 
686 aa  261  2e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.830099  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1175  DNA primase  37.67 
 
 
682 aa  262  2e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00198747  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1681  DNA primase  42.78 
 
 
592 aa  260  4e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.10447 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1100  DNA primase  35.32 
 
 
614 aa  261  4e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1282  DNA primase  39.59 
 
 
629 aa  260  5e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12367  DNA primase  37.88 
 
 
639 aa  259  7e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0806  DNA primase  35.96 
 
 
639 aa  259  1e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1910  DNA primase  40.21 
 
 
587 aa  259  1e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.351058  normal  0.0156727 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0728  DNA primase  35.73 
 
 
631 aa  258  2e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06600  putative DNA primase  31.39 
 
 
657 aa  258  2e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0757  DNA primase  43.78 
 
 
617 aa  258  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  32.81 
 
 
595 aa  258  3e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2128  DNA primase  36.11 
 
 
624 aa  257  3e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1605  DNA primase  39.09 
 
 
676 aa  257  4e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2458  DNA primase  32.13 
 
 
567 aa  257  4e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00693823  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  35.76 
 
 
663 aa  257  4e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2058  DNA primase  32.95 
 
 
592 aa  257  4e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.507155  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>