46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6364 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_6364  hypothetical protein  100 
 
 
606 aa  1237    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.038941  normal  0.601528 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3661  hypothetical protein  41.15 
 
 
1282 aa  243  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0794553  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0224  hypothetical protein  40.43 
 
 
1264 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2883  hypothetical protein  40.43 
 
 
1264 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3859  hypothetical protein  33.11 
 
 
734 aa  145  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0643  hypothetical protein  29.15 
 
 
1183 aa  144  6e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00455941 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2678  hypothetical protein  34.97 
 
 
1170 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2958  hypothetical protein  34.97 
 
 
1160 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000406417 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2699  hypothetical protein  34.97 
 
 
1170 aa  140  6e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3005  hypothetical protein  34.97 
 
 
1160 aa  140  6e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.386641  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2999  hypothetical protein  34.97 
 
 
1161 aa  140  7e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128545  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2750  hypothetical protein  34.97 
 
 
305 aa  138  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.595373  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4463  hypothetical protein  32.07 
 
 
1116 aa  137  7.000000000000001e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0870888  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2961  hypothetical protein  34.97 
 
 
1160 aa  137  8e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6326  hypothetical protein  34.08 
 
 
1267 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0236689 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2279  hypothetical protein  34.97 
 
 
1160 aa  135  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00522466 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2015  hypothetical protein  31.42 
 
 
1166 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2752  hypothetical protein  34.86 
 
 
1160 aa  133  7.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.923311  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6508  hypothetical protein  33.45 
 
 
1197 aa  130  9.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.302042 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0328  hypothetical protein  31.09 
 
 
1242 aa  127  5e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0740  hypothetical protein  29.45 
 
 
1269 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.261719  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4329  hypothetical protein  34.3 
 
 
519 aa  87.8  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.982381  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2020  hypothetical protein  26.78 
 
 
290 aa  57.4  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5775  hypothetical protein  28.46 
 
 
328 aa  57  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.314122  normal 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4364  hypothetical protein  24.55 
 
 
484 aa  54.7  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.945805  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5667  hypothetical protein  26.69 
 
 
746 aa  54.3  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.627177  normal  0.0881924 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4725  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  25.48 
 
 
272 aa  53.5  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0045977 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0836  hypothetical protein  22.91 
 
 
613 aa  52  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.715517  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4438  hypothetical protein  26.64 
 
 
476 aa  51.6  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.35414  normal  0.628211 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0167  hypothetical protein  23.08 
 
 
632 aa  51.6  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.427298  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0687  hypothetical protein  22.91 
 
 
519 aa  50.8  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1557  hypothetical protein  23.33 
 
 
377 aa  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.71793  normal  0.744672 
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6511  hypothetical protein  25.72 
 
 
497 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0156  hypothetical protein  30.42 
 
 
306 aa  49.7  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0142  hypothetical protein  31.36 
 
 
323 aa  48.9  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.253672 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1597  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  24 
 
 
286 aa  48.9  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.417903  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3327  hypothetical protein  22.11 
 
 
435 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000506493  hitchhiker  9.65434e-22 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0138  hypothetical protein  30 
 
 
306 aa  48.1  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.650511  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0266  hypothetical protein  21.34 
 
 
263 aa  47.8  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0145  hypothetical protein  28.69 
 
 
306 aa  47.4  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.185076  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17060  hypothetical protein  28.81 
 
 
294 aa  47.4  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0373  hypothetical protein  24.77 
 
 
481 aa  47.4  0.0009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2483  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  24.02 
 
 
286 aa  45.4  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000992077  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4271  hypothetical protein  24.34 
 
 
593 aa  44.7  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3377  phage protein  30.28 
 
 
516 aa  44.7  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00845273  hitchhiker  0.00000000000000133815 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1037  hypothetical protein  25.6 
 
 
477 aa  44.3  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.960638  normal  0.0242167 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>