More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6308 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_6308  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
1235 aa  2415    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5633  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  31.41 
 
 
1131 aa  222  3.9999999999999997e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3410  PAS sensor protein  31.89 
 
 
1788 aa  202  3.9999999999999996e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1401  serine/threonine protein kinase  29.94 
 
 
1333 aa  199  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4616  PAS sensor protein  31.19 
 
 
1836 aa  194  6e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1450  diguanylate cyclase  26.78 
 
 
1774 aa  191  5e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3295  multi-sensor signal transduction multi-kinase  24.53 
 
 
1774 aa  191  9e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  31.73 
 
 
2109 aa  189  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3762  serine/threonine protein kinase  29.55 
 
 
1192 aa  189  3e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.00167797  normal  0.557916 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  30.37 
 
 
1833 aa  189  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4360  serine/threonine protein kinase  32.12 
 
 
1636 aa  188  5e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0183  protein kinase  30.63 
 
 
1697 aa  184  7e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4716  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  25.74 
 
 
1808 aa  184  8.000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230197  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4642  serine/threonine protein kinase  31.7 
 
 
1629 aa  184  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3863  serine/threonine protein kinase  24.05 
 
 
1932 aa  183  2e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.16281 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3011  serine/threonine protein kinase  31.42 
 
 
1637 aa  182  4.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15444  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  26.07 
 
 
1908 aa  181  7e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2857  adenylate/guanylate cyclase  24.32 
 
 
1805 aa  181  8e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5744  multi-sensor signal transduction multi-kinase  29.33 
 
 
1845 aa  180  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7079  serine/threonine protein kinase  31.7 
 
 
1643 aa  178  6e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2398  ATP-binding region ATPase domain protein  26.89 
 
 
1712 aa  177  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623096  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6170  multi-sensor signal transduction multi-kinase  32.43 
 
 
1748 aa  176  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2277  multi-sensor signal transduction multi-kinase  29.86 
 
 
1797 aa  176  2.9999999999999996e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.947046 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2803  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  24.53 
 
 
1805 aa  174  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.70885 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6020  multi-sensor signal transduction multi-kinase  25.86 
 
 
1666 aa  173  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4074  serine/threonine protein kinase  29.71 
 
 
1297 aa  173  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0173368 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3855  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
1726 aa  171  5e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.993945  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6496  ATPase domain-containing protein  30.88 
 
 
1685 aa  171  6e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53789  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6208  ATP-binding region ATPase domain protein  29.45 
 
 
1885 aa  171  7e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2978  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.38 
 
 
1942 aa  170  2e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4550  serine/threonine protein kinase  30.47 
 
 
1649 aa  169  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.773527  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2845  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF and PAS/PAC sensor  24.22 
 
 
1934 aa  168  5e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218586  normal  0.818872 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5519  serine/threonine protein kinase  30.11 
 
 
1188 aa  167  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2768  serine/threonine protein kinase  28.74 
 
 
1446 aa  167  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2428  PAS sensor protein  28.25 
 
 
1837 aa  167  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787008  normal  0.842881 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  28.43 
 
 
1663 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5743  ATPase domain-containing protein  30 
 
 
1685 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  28.05 
 
 
1668 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2107  serine/threonine protein kinase  27.01 
 
 
670 aa  164  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.568575 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0854  ATP-binding region ATPase domain protein  27.64 
 
 
1871 aa  163  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2181  ATP-binding region ATPase domain protein  25.91 
 
 
1922 aa  162  5e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4503  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  25.48 
 
 
1797 aa  159  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194827  normal  0.137244 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1563  multi-sensor signal transduction multi-kinase  27.91 
 
 
1822 aa  159  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0557891 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  25.8 
 
 
1914 aa  158  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0083  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  24.27 
 
 
1780 aa  158  7e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000111107  normal  0.0603915 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0645  serine/threonine protein kinase  29.15 
 
 
1644 aa  157  9e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171562  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3596  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  25.34 
 
 
2017 aa  157  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  24.18 
 
 
2051 aa  156  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  24.02 
 
 
2077 aa  156  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2556  ATP-binding region, ATPase-like  24.64 
 
 
1811 aa  154  8e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3535  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  24.84 
 
 
1804 aa  154  8.999999999999999e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.655347 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  31.1 
 
 
1015 aa  154  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  25.55 
 
 
2361 aa  153  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4992  serine/threonine protein kinase  32.79 
 
 
641 aa  153  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000171785  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  27.99 
 
 
1809 aa  152  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4504  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  25.14 
 
 
1795 aa  151  6e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1544  ATP-binding region ATPase domain protein  30.45 
 
 
1710 aa  149  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0224  serine/threonine protein kinase  28.22 
 
 
1295 aa  149  4.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4709  serine/threonine protein kinase  36.91 
 
 
557 aa  148  6e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0170  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.02 
 
 
681 aa  148  7.0000000000000006e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.504438 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3995  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  26.67 
 
 
1794 aa  147  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2492  Serine/threonine protein kinase-related protein  33.12 
 
 
503 aa  146  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.169488  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0999  hypothetical protein  23.77 
 
 
2272 aa  146  2e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.715869 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0030  kinase domain protein  31.07 
 
 
667 aa  145  3e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1629  hypothetical protein  25 
 
 
2279 aa  145  5e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00385433 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00180  serine/threonine protein kinase  32.82 
 
 
691 aa  145  5e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2767  serine/threonine protein kinase  32.38 
 
 
1514 aa  145  6e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.98115 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3707  protein kinase  34.22 
 
 
348 aa  144  7e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1593  serine/threonine protein kinase  26.96 
 
 
1377 aa  144  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3543  serine/threonine protein kinase  35.11 
 
 
537 aa  144  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0435506  normal  0.170453 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0018  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.33 
 
 
693 aa  143  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3726  serine/threonine protein kinase  34.87 
 
 
351 aa  143  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.06 
 
 
1081 aa  142  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.75 
 
 
676 aa  141  7e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4114  serine/threonine protein kinase  32.91 
 
 
513 aa  141  8.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0600748  normal  0.0166963 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1980  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  22.15 
 
 
1901 aa  140  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0349147  normal  0.535824 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2438  Serine/threonine protein kinase-like protein  35.35 
 
 
620 aa  140  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00115665 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3652  serine/threonine protein kinase  34.58 
 
 
363 aa  141  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.519367  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1669  protein kinase  32.82 
 
 
1053 aa  140  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.421495  normal  0.873367 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1160  hypothetical protein  24.54 
 
 
2303 aa  140  2e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  33.02 
 
 
618 aa  139  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0072  protein kinase  32.81 
 
 
661 aa  140  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1020  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.4 
 
 
1441 aa  140  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3586  serine/threonine protein kinase  34.08 
 
 
363 aa  139  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.28 
 
 
1080 aa  139  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0870  serine/threonine protein kinase  34.19 
 
 
328 aa  139  5e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0035  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.01 
 
 
647 aa  139  5e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0025  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32 
 
 
668 aa  139  5e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  23.23 
 
 
1850 aa  137  9e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.78 
 
 
1089 aa  137  9e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.42 
 
 
650 aa  137  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  31.87 
 
 
1029 aa  137  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0022  protein kinase  33.88 
 
 
597 aa  136  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6196  serine/threonine protein kinase  33.7 
 
 
1414 aa  136  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4054  ATPase domain-containing protein  31.38 
 
 
1756 aa  136  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.892687 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5246  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.58 
 
 
613 aa  136  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.438769  hitchhiker  0.0079464 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1383  serine/threonine protein kinase  31.23 
 
 
690 aa  135  3.9999999999999996e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.149944  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0230  ATPase domain-containing protein  28.35 
 
 
1685 aa  135  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59916  normal  0.455487 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5621  serine/threonine protein kinase  34.49 
 
 
845 aa  135  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.205775  normal  0.427226 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6471  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.85 
 
 
613 aa  135  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0431978 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>