More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6139 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001305  ANIA_05626  Acetyl-coenzyme A synthetase (EC 6.2.1.1)(Acetate--CoA ligase)(Acyl-activating enzyme) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P16928]  49.92 
 
 
670 aa  636    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0101756 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03941  acetyl-coenzyme A synthetase  52.02 
 
 
652 aa  674    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3923  acetate/CoA ligase  52.02 
 
 
652 aa  675    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4487  acetyl-CoA synthetase  53.14 
 
 
653 aa  702    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4702  acetyl-CoA synthetase  52.31 
 
 
644 aa  693    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105105 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2043  acetyl-CoA synthetase  53.68 
 
 
662 aa  726    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3595  acetyl-CoA synthetase  54.43 
 
 
645 aa  704    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3955  acetyl-CoA synthetase  51.39 
 
 
648 aa  683    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1744  acetyl-CoA synthetase  54.26 
 
 
651 aa  733    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1811  acetyl-CoA synthetase  54.26 
 
 
651 aa  733    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2743  acetyl-CoA synthetase  52.28 
 
 
650 aa  695    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1825  acetyl-CoA synthetase  52.83 
 
 
651 aa  692    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.90086  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0297  acetyl-CoA synthetase  53.29 
 
 
652 aa  674    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.447688  hitchhiker  0.000249841 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3992  acetyl-CoA synthetase  53.14 
 
 
653 aa  702    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.733733  normal  0.105895 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3553  acetyl-coenzyme A synthetase  53.23 
 
 
658 aa  671    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2288  acetate--CoA ligase  54.18 
 
 
644 aa  721    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3572  acetyl-CoA synthetase  52.83 
 
 
651 aa  689    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0184  acetyl-CoA synthetase  50.08 
 
 
653 aa  637    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.217877 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0276  acetyl-CoA synthetase  51.24 
 
 
652 aa  673    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.715577  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1092  acetyl-CoA synthetase  54.26 
 
 
651 aa  723    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.750983  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  50.56 
 
 
658 aa  635    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0688  acetyl-coenzyme A synthetase  54.57 
 
 
651 aa  696    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.84853  normal  0.838987 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4701  acetyl-CoA synthetase  52.19 
 
 
644 aa  687    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120403  normal  0.0122351 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0467  acetyl-CoA synthetase  53.48 
 
 
652 aa  703    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2859  acetate--CoA ligase  49.06 
 
 
636 aa  650    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4314  acetyl-CoA synthetase  52.02 
 
 
652 aa  675    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4293  acetyl-CoA synthetase  51.91 
 
 
651 aa  680    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4814  acetyl-CoA synthetase  52.82 
 
 
645 aa  682    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.422495  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0579  Acetyl-coenzyme A synthetase  52.21 
 
 
653 aa  670    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0624  acetyl-CoA synthetase  49.23 
 
 
651 aa  652    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0391564 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4625  acetyl-CoA synthetase  52.02 
 
 
652 aa  674    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0111  acetyl-CoA synthetase  53.31 
 
 
646 aa  690    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.865041  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1399  acetate--CoA ligase  53.23 
 
 
653 aa  671    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.570682  normal  0.412853 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3006  acetate--CoA ligase  52.91 
 
 
652 aa  665    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0231172  normal  0.972893 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1791  acetyl-CoA synthetase  52.28 
 
 
650 aa  696    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1116  acetyl-CoA synthetase  50 
 
 
653 aa  649    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.311917  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3958  acetyl-CoA synthetase  52.02 
 
 
652 aa  674    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.524009 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5450  acetyl-CoA synthetase  52.08 
 
 
645 aa  686    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.820254  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  53.3 
 
 
656 aa  651    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3575  acetyl-coenzyme A synthetase  55.09 
 
 
646 aa  720    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.566418  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3109  acetyl-CoA synthetase  52.37 
 
 
653 aa  687    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0101  acetyl-CoA synthetase  50.53 
 
 
652 aa  707    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1331  acetate--CoA ligase  55.66 
 
 
647 aa  728    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000000184836 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0319  acetyl-CoA synthetase  54.29 
 
 
652 aa  726    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.994772 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2625  acetyl-coenzyme A synthetase  55.62 
 
 
649 aa  720    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3703  acetyl-coenzyme A synthetase  51.8 
 
 
645 aa  661    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.963682 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00169  acetyl-CoA synthetase  51.92 
 
 
682 aa  683    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1067  acetyl-CoA synthetase  53.31 
 
 
645 aa  709    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0042  acetyl-CoA synthetase  54.75 
 
 
647 aa  719    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2562  acetyl-CoA synthetase  54.73 
 
 
649 aa  715    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.732738  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3194  acetyl-CoA synthetase  54.53 
 
 
649 aa  701    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1895  acetyl-CoA synthetase  53.78 
 
 
645 aa  730    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0173616  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0333  acetyl-CoA synthetase  53.37 
 
 
650 aa  715    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0282682 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2044  acetyl-CoA synthetase  51.15 
 
 
651 aa  679    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.408247  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4567  acetyl-CoA synthetase  52.47 
 
 
644 aa  693    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0933221 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0474  acetyl-CoA synthetase  53.99 
 
 
650 aa  719    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.165738 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0865  acetyl-coenzyme A synthetase  53.5 
 
 
649 aa  713    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0558  acetyl-CoA synthetase  53.4 
 
 
652 aa  701    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0203  acetyl-CoA synthetase  50.84 
 
 
655 aa  664    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1748  acetyl-CoA synthetase  52.28 
 
 
650 aa  698    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.221935  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  52.04 
 
 
652 aa  647    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1533  acetyl-CoA synthetase  52.34 
 
 
650 aa  686    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1489  acetyl-coenzyme A synthetase  52.77 
 
 
652 aa  658    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0115492  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1811  acetate--CoA ligase  52.05 
 
 
654 aa  663    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.573695  normal  0.931024 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  52.09 
 
 
658 aa  635    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4531  acetyl-CoA synthetase  52.17 
 
 
652 aa  678    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3835  acetyl-CoA synthetase  51.08 
 
 
652 aa  678    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.415539  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0856  acetyl-coenzyme A synthetase  53 
 
 
644 aa  659    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0521  acetate--CoA ligase  51.07 
 
 
646 aa  665    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3431  acetyl-CoA synthetase  55.66 
 
 
654 aa  734    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.405806  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2429  acetyl-coenzyme A synthetase  50.32 
 
 
631 aa  655    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3921  acetyl-CoA synthetase  51.08 
 
 
652 aa  677    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2362  acetyl-CoA synthetase  52.66 
 
 
650 aa  697    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0493483 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2434  acetyl-CoA synthetase  52.66 
 
 
650 aa  697    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0673  acetyl-CoA synthetase  52.92 
 
 
645 aa  723    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1469  acetyl-CoA synthetase  51.74 
 
 
650 aa  693    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.126764  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1621  acetyl-coenzyme A synthetase  54.1 
 
 
651 aa  681    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.423647  normal  0.248645 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4627  acetyl-CoA synthetase  52.91 
 
 
651 aa  695    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.369065  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1863  acetyl-CoA synthetase  50.98 
 
 
650 aa  673    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.579141  normal  0.108064 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52800  acetyl-CoA synthetase  52.91 
 
 
651 aa  695    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62630  acetyl-CoA synthetase  51.77 
 
 
645 aa  686    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2349  acetyl-CoA synthetase  52.36 
 
 
650 aa  697    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2691  acetyl-CoA synthetase  53.23 
 
 
649 aa  703    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.217498  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0510  acetate--CoA ligase  52.37 
 
 
653 aa  676    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0620636 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0745  acetyl-CoA synthetase  52.77 
 
 
650 aa  704    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.701189  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0598  acetyl-coenzyme A synthetase  53.62 
 
 
644 aa  730    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.957105  normal  0.326929 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2523  acetyl-CoA synthetase  52.82 
 
 
650 aa  699    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0016553 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3479  acetyl-coenzyme A synthetase  54.62 
 
 
645 aa  707    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.837124  hitchhiker  0.000568147 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2558  acetyl-CoA synthetase  52.19 
 
 
650 aa  691    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4213  acetate--CoA ligase  51.29 
 
 
651 aa  669    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.169041  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4550  acetate--CoA ligase  51.29 
 
 
651 aa  669    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01635  acetyl-CoA synthase  50.87 
 
 
653 aa  651    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2079  acetyl-CoA synthetase  52.43 
 
 
650 aa  696    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1479  acetyl-CoA synthetase  54.14 
 
 
651 aa  708    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.341037  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3120  acetate--CoA ligase  51.99 
 
 
649 aa  682    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1752  acetyl-CoA synthetase  52.28 
 
 
650 aa  698    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2219  acetate--CoA ligase  52.38 
 
 
649 aa  692    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3947  acetyl-CoA synthetase  51.23 
 
 
652 aa  679    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.903736  normal  0.891151 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2232  acetate--CoA ligase  52.21 
 
 
653 aa  671    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.590235  normal  0.663904 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1428  acetyl-CoA synthetase  53.14 
 
 
653 aa  702    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0956838  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>