More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6100 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6100  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 		 374 aa  721    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00945728  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2813  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.57 
 
 		 214 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1226  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.2 
 
 		 209 aa  180  4e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1709  histidine triad (HIT) protein  51.85 
 
 		 136 aa  154  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00500014  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2944  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.19 
 
 		 212 aa  153  4e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0293  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.28 
 
 		 212 aa  151  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.572416  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.52 
 
 		 211 aa  150  3e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.172224  normal  0.0331815 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4417  histidine triad (HIT) protein  48.92 
 
 		 144 aa  144  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00244718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1662  histidine triad family protein  48.94 
 
 		 147 aa  143  4e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1704  HIT family protein  46.32 
 
 		 144 aa  141  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.274737  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3986  hypothetical protein  48.91 
 
 		 143 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0356527  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0910  Pectate lyase/Amb allergen  45.77 
 
 		 155 aa  140  3.9999999999999997e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000231178  decreased coverage  0.0000000980143 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1065  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.58 
 
 		 215 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4211  histidine triad (HIT) protein  46.43 
 
 		 139 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.2 
 
 		 211 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.146647  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2473  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.76 
 
 		 211 aa  138  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0687  hypothetical protein  49.61 
 
 		 147 aa  138  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1261  histidine triad (HIT) protein  45.07 
 
 		 143 aa  137  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0545124  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1207  histidine triad (HIT) protein  46.43 
 
 		 139 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1754  hypothetical protein  37.86 
 
 		 218 aa  137  4e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.843314  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01367  hypothetical protein  53.21 
 
 		 159 aa  137  4e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1236  histidine triad (HIT) protein  45 
 
 		 139 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18650  histidine triad (HIT) family protein  49.22 
 
 		 141 aa  134  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51860  hypothetical protein  43.31 
 
 		 209 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.393091  hitchhiker  0.00413081 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004101  histidine triad family protein  52.29 
 
 		 142 aa  133  5e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000876238  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1401  histidine triad (HIT) protein  48.44 
 
 		 143 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.541573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02326  hypothetical protein  38.39 
 
 		 210 aa  132  6.999999999999999e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.544292  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1483  histidine triad (HIT) family protein  45.38 
 
 		 143 aa  132  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0478904 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1663  histidine triad (HIT) protein  45.38 
 
 		 143 aa  132  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0109838 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2174  hypothetical protein  42.03 
 
 		 141 aa  131  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4549  hypothetical protein  52.17 
 
 		 142 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.498263  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09343  hypothetical protein  33.96 
 
 		 212 aa  130  5.0000000000000004e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0414979  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0461  histidine triad (HIT) protein  50.77 
 
 		 138 aa  129  8.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4008  histidine triad (HIT) protein  44.44 
 
 		 165 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2949  histidine triad (HIT) protein  46.27 
 
 		 142 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2685  histidine triad (HIT) protein  50.76 
 
 		 135 aa  128  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.934104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4849  histidine triad (HIT) protein  46.88 
 
 		 139 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104991  normal  0.870904 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1635  histidine triad (HIT) protein  45.38 
 
 		 144 aa  128  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235606 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2180  hypothetical protein  35.85 
 
 		 221 aa  127  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2218  hypothetical protein  35.85 
 
 		 221 aa  127  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.864295  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2441  histidine triad (HIT) protein  47.29 
 
 		 140 aa  127  3e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.132009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.11 
 
 		 213 aa  126  5e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.7 
 
 		 231 aa  125  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1048  histidine triad (HIT) protein  48.85 
 
 		 137 aa  125  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.136733  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2336  histidine triad (HIT) protein  39.1 
 
 		 147 aa  122  7e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.6925  decreased coverage  0.00924855 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7347  hypothetical protein  48.74 
 
 		 139 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2657  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.59 
 
 		 230 aa  121  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352219  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0370  histidine triad (HIT) protein  48.06 
 
 		 138 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.673964 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0088  histidine triad (HIT) protein  44.53 
 
 		 161 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.348291  normal  0.0668606 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4398  histidine triad (HIT) protein  46.21 
 
 		 136 aa  117  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0675  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.93 
 
 		 223 aa  116  6.9999999999999995e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.523369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0669  histidine triad (HIT) protein  48.31 
 
 		 138 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1085  histidine triad (HIT) protein  54.05 
 
 		 139 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.986739 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0109  hypothetical protein  47.54 
 
 		 147 aa  115  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.648306  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4475  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.82 
 
 		 220 aa  114  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0035  hypothetical protein  43.51 
 
 		 165 aa  114  4.0000000000000004e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.871621  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1667  histidine triad (HIT) protein  47.73 
 
 		 137 aa  113  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.619204 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1068  histidine triad (HIT) protein  47.33 
 
 		 137 aa  113  5e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0035  hypothetical protein  43.51 
 
 		 134 aa  113  6e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.132487  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4962  histidine triad (HIT) protein  53.85 
 
 		 138 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0265226  normal  0.0774828 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0618  histidine triad (HIT) protein  42.97 
 
 		 139 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.619143  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4448  histidine triad (HIT) protein  52.14 
 
 		 138 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.678684 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3431  histidine triad (HIT) protein  45.04 
 
 		 134 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4912  histidine triad (HIT) protein  52.14 
 
 		 138 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.363403  normal  0.678464 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4078  histidine triad (HIT) protein  43.18 
 
 		 136 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0494  hypothetical protein  39.02 
 
 		 137 aa  110  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2901  histidine triad (HIT) protein  43.41 
 
 		 146 aa  110  5e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0749971  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2294  histidine triad (HIT) protein  49.15 
 
 		 139 aa  109  6e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.125873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5002  histidine triad (HIT) protein  44.93 
 
 		 141 aa  109  7.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.503788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2936  hypothetical protein  39.07 
 
 		 218 aa  109  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5510  hypothetical protein  39.44 
 
 		 219 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325809  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0020  histidine triad (HIT) protein  38.17 
 
 		 134 aa  107  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.089911  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3079  hypothetical protein  39.05 
 
 		 218 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0470  hypothetical protein  37.4 
 
 		 143 aa  105  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00500  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  41.1 
 
 		 220 aa  104  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.39496  normal  0.546332 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4847  NmrA family protein  41.31 
 
 		 216 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00912445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2676  hypothetical protein  40.72 
 
 		 229 aa  104  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1686  histidine triad (HIT) protein  40.48 
 
 		 159 aa  103  4e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02549  putative HIT family hydrolase  46.79 
 
 		 111 aa  103  4e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.68 
 
 		 211 aa  102  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.825731  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2867  histidine triad (HIT) protein  38.46 
 
 		 140 aa  102  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32240  putative NADH-flavin reductase  37.38 
 
 		 214 aa  101  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.778097  normal  0.45843 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2626  histidine triad (HIT) protein  43.61 
 
 		 140 aa  100  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.815959 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2748  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.41 
 
 		 218 aa  99.8  8e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0203481 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  38.14 
 
 		 216 aa  99  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0474  hypothetical protein  37.33 
 
 		 214 aa  98.6  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.84085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.6 
 
 		 212 aa  98.2  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.809178  normal  0.950879 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4058  histidine triad (HIT) protein  34.56 
 
 		 139 aa  98.6  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.688633  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22130  putative NADH-flavin reductase  36.87 
 
 		 221 aa  97.4  3e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.8 
 
 		 216 aa  96.3  8e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.468435  normal  0.127341 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03900  putative NADH-flavin reductase  37.79 
 
 		 215 aa  96.3  8e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0627666 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.65 
 
 		 227 aa  95.9  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0760206  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01245  diadenosine tetraphosphate hydrolase and other HIT family hydrolase  41.04 
 
 		 144 aa  95.5  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.409214  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.1 
 
 		 219 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5087  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.15 
 
 		 222 aa  95.5  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.81673 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4805  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.1 
 
 		 219 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.638466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4424  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.1 
 
 		 219 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.62 
 
 		 219 aa  95.1  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1159  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.89 
 
 		 218 aa  94.4  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0585  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.79 
 
 		 218 aa  93.6  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>