More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6082 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_6082  glycoside hydrolase family 1  100 
 
 
436 aa  875  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0462  Beta-glucosidase  38.75 
 
 
418 aa  321  1e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.626526  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1932  glycoside hydrolase family protein  43.66 
 
 
431 aa  317  3e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.536159  hitchhiker  9.05056e-06 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2967  glycoside hydrolase family protein  43.66 
 
 
431 aa  316  6e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4014  glycoside hydrolase family protein  38.98 
 
 
443 aa  288  2e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.92245  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04820  Beta-glucosidase  32.48 
 
 
432 aa  249  8e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0266886  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1428  glycoside hydrolase family protein  31.55 
 
 
442 aa  239  9e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.574986  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0529  glycoside hydrolase family 1  34.03 
 
 
417 aa  231  2e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1578  beta-glucosidase  36.48 
 
 
450 aa  222  1e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1937  glycoside hydrolase family protein  31.86 
 
 
427 aa  218  1e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.607025  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1799  beta-galactosidase  31.33 
 
 
446 aa  218  1e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  1.88458e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1537  glycoside hydrolase family protein  32.46 
 
 
399 aa  207  4e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.37521  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1895  beta-galactosidase  32.67 
 
 
453 aa  205  1e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.785457  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4282  beta-galactosidase  36.89 
 
 
455 aa  204  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5434  beta-galactosidase  34.47 
 
 
463 aa  201  2e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.139102  normal  0.287143 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0969  beta-galactosidase  29.11 
 
 
446 aa  201  2e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00738034  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4295  Beta-glucosidase  31.52 
 
 
447 aa  201  2e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000161333 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2401  Beta-glucosidase  32.97 
 
 
452 aa  200  3e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00110187  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1882  glycosy hydrolase family protein  27.76 
 
 
427 aa  200  5e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.31737  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0952  Beta-glucosidase  28.89 
 
 
446 aa  199  6e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  3.26763e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4660  glycoside hydrolase family protein  32.74 
 
 
413 aa  199  9e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.503774  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06938  beta-glucosidase  31.63 
 
 
449 aa  197  4e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1019  Beta-glucosidase  31.36 
 
 
448 aa  196  5e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477065  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1788  beta-galactosidase  32.26 
 
 
472 aa  196  8e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.586379  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1402  Beta-glucosidase  32.6 
 
 
452 aa  196  9e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00588198  normal  0.0441628 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1675  glycoside hydrolase family protein  30.16 
 
 
513 aa  195  1e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.256832  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1722  glycoside hydrolase family protein  32.19 
 
 
934 aa  193  4e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.594892  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4005  glycoside hydrolase family protein  32.43 
 
 
437 aa  193  6e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2440  beta-galactosidase  32.39 
 
 
491 aa  193  6e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.972736  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0493  beta-galactosidase  28.79 
 
 
446 aa  193  7e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1110  glycoside hydrolase family protein  28.99 
 
 
517 aa  191  3e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0458  beta-galactosidase  28.41 
 
 
452 aa  190  6e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  7.53308e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15280  glycoside hydrolase family 1  30.11 
 
 
451 aa  188  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.25524e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1558  glycoside hydrolase family protein  28.72 
 
 
467 aa  188  2e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  3.40299e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0789  glycoside hydrolase family protein  33.86 
 
 
443 aa  187  4e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0245888  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0511  glycoside hydrolase family 1  34.25 
 
 
401 aa  186  5e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1896  beta-galactosidase  31.26 
 
 
439 aa  186  5e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.42466 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1147  beta-galactosidase  31.4 
 
 
446 aa  186  9e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.94123 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0212  Beta-glucosidase  28.51 
 
 
471 aa  185  1e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.292852  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2781  beta-galactosidase  31.95 
 
 
456 aa  186  1e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2084  Beta-glucosidase  32.12 
 
 
440 aa  185  2e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.483435  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5030  glycoside hydrolase family protein  31.92 
 
 
885 aa  183  5e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.277971  normal  0.200228 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1894  beta-galactosidase  33.12 
 
 
476 aa  183  6e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.301665 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5888  beta-galactosidase  31.96 
 
 
470 aa  183  6e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1638  Beta-glucosidase  27.52 
 
 
439 aa  183  7e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1530  Beta-glucosidase  28.74 
 
 
438 aa  182  1e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  1.11423e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1316  Beta-glucosidase  30.8 
 
 
443 aa  182  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0421  glycoside hydrolase family 1  31.87 
 
 
419 aa  181  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3706  beta-glucosidase  31.55 
 
 
443 aa  181  3e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0408  glycoside hydrolase family protein  29.55 
 
 
489 aa  180  5e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0125143  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1394  Beta-glucosidase  29.44 
 
 
444 aa  179  6e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.534606  normal  0.0533857 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1102  Beta-glucosidase  31.61 
 
 
448 aa  179  7e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2958  Beta-glucosidase  30.53 
 
 
463 aa  179  8e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3701  beta-galactosidase  31.96 
 
 
457 aa  179  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2422  Beta-glucosidase  29.41 
 
 
474 aa  179  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  2.77167e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5652  glycoside hydrolase family protein  30.89 
 
 
471 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5207  glycoside hydrolase family protein  30.89 
 
 
471 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.226411  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3523  Beta-glucosidase  27.65 
 
 
465 aa  178  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.233162  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1082  beta-galactosidase  31.6 
 
 
447 aa  178  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.655373  normal  0.120438 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2840  beta-galactosidase  32.29 
 
 
500 aa  178  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.574509  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3961  Beta-glucosidase  31.99 
 
 
487 aa  178  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000589535  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1481  beta-galactosidase  32.65 
 
 
467 aa  177  3e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0402  beta-galactosidase  29.69 
 
 
494 aa  177  3e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3254  glycoside hydrolase family protein  30.96 
 
 
447 aa  177  5e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2184  beta-galactosidase  35.22 
 
 
471 aa  176  9e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000108551  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4587  Beta-glucosidase  31.86 
 
 
465 aa  174  2e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.349984  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0288  beta-galactosidase  32.1 
 
 
444 aa  175  2e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  5.31793e-05  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0188  beta-galactosidase  30.36 
 
 
472 aa  174  3e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6572  Beta-glucosidase  33.03 
 
 
458 aa  174  4e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0265684  normal  0.0290842 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2607  Beta-glucosidase  30.34 
 
 
443 aa  173  4e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.776876  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4221  Beta-glucosidase  27.86 
 
 
467 aa  173  5e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0294315  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3403  beta-galactosidase  31.88 
 
 
457 aa  173  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.968269  normal  0.135443 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5280  glycoside hydrolase family protein  32.65 
 
 
411 aa  173  5e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0160415 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2526  glycoside hydrolase family 1  33.8 
 
 
388 aa  172  9e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1349  beta-galactosidase  32.81 
 
 
453 aa  172  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135254  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03797  beta-glucosidase  28.86 
 
 
452 aa  171  2e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1754  beta-galactosidase  30 
 
 
485 aa  171  2e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0528393 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02700  beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  30.84 
 
 
407 aa  171  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.630068  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0133  beta-galactosidase  30.45 
 
 
478 aa  171  2e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1840  Beta-glucosidase  30.39 
 
 
458 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.185877  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7167  Beta-glucosidase  31.63 
 
 
459 aa  171  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0225404 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2862  Beta-glucosidase  33.86 
 
 
443 aa  170  4e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.753347  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0390  Beta-glucosidase  31.77 
 
 
467 aa  170  4e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3614  Beta-glucosidase  32.3 
 
 
448 aa  170  5e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10170  broad-specificity cellobiase  31.33 
 
 
479 aa  170  5e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1183  Beta-glucosidase  29.63 
 
 
451 aa  170  5e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0012185  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2765  Beta-glucosidase  29.98 
 
 
470 aa  170  5e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4320  beta-galactosidase  31.9 
 
 
460 aa  169  8e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.952407 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1789  6-phospho-beta-galactosidase  29.02 
 
 
470 aa  169  8e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1733  beta-galactosidase  32.91 
 
 
482 aa  169  9e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.174879  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2259  6-phospho-beta-galactosidase  29.44 
 
 
470 aa  169  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2220  6-phospho-beta-galactosidase  29.44 
 
 
470 aa  169  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D39  6-phospho-beta-galactosidase  30.82 
 
 
468 aa  167  2e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1879  beta-galactosidase  30.38 
 
 
488 aa  167  2e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.251034  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1895  beta-galactosidase  31.01 
 
 
454 aa  168  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3627  Beta-glucosidase  31.58 
 
 
458 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.904469  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3459  6-phospho-beta-galactosidase  28.88 
 
 
468 aa  167  3e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  8.64556e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3827  beta-glucosidase  29.98 
 
 
457 aa  167  4e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100149  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1216  beta-glucosidase  29.2 
 
 
451 aa  167  4e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282879  normal  0.209165 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0521  Beta-glucosidase  33.26 
 
 
453 aa  167  4e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>