152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5952 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5952  polysaccharide export protein  100 
 
 
557 aa  1099  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001787  capsular polysaccharide export system periplasmic protein KpsD  43.06 
 
 
579 aa  427  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3241  polysaccharide export protein  42.17 
 
 
587 aa  423  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03058  capsular polysaccharide transport protein, putative  41.73 
 
 
609 aa  407  1e-112  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.715854  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1307  polysaccharide export protein  45.53 
 
 
565 aa  402  1e-110  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2584  polysaccharide export protein  42.63 
 
 
605 aa  385  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  unclonable  2.40824e-05 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1826  polysaccharide export protein  40.08 
 
 
516 aa  372  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.698968  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0621  KpsD protein  41.48 
 
 
606 aa  366  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.440749 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1690  polysaccharide export protein  41.06 
 
 
558 aa  359  8e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0246  polysaccharide export protein  38.86 
 
 
537 aa  345  9e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  8.56367e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3221  polysialic acid capsule transport protein KpsD  39.43 
 
 
558 aa  344  3e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.364488  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02766  hypothetical protein  39.02 
 
 
558 aa  342  1e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  3.32683e-06  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02816  KpsD protein  39.02 
 
 
558 aa  342  1e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  4.3482e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4938  polysaccharide export protein  34.79 
 
 
603 aa  321  2e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0293  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  35.07 
 
 
552 aa  316  7e-85  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.994472  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5729  polysialic acid transport protein KpsD  37.94 
 
 
606 aa  315  2e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1779  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  36.14 
 
 
552 aa  309  1e-82  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1438  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  35.94 
 
 
552 aa  306  7e-82  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.473166  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1618  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  35.74 
 
 
552 aa  305  1e-81  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1889  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  29.1 
 
 
576 aa  160  7e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.105703  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3790  polysaccharide export protein  33.23 
 
 
803 aa  108  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0660  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  26.45 
 
 
877 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0566  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  26.45 
 
 
800 aa  107  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1959  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  26.24 
 
 
875 aa  106  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.940843  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1604  polysaccharide export protein  31.8 
 
 
952 aa  106  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2236  polysaccharide export protein  37.99 
 
 
948 aa  105  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.987184  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1515  polysaccharide export protein  33.64 
 
 
869 aa  104  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000317972  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0648  polysaccharide export protein  26.55 
 
 
779 aa  102  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2606  polysaccharide export protein  28.95 
 
 
936 aa  102  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1986  polysaccharide biosynthesis protein, putative  25.77 
 
 
877 aa  102  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0530  polysaccharide export protein  29.51 
 
 
1055 aa  100  6e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.925852 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0888  polysaccharide export protein  33.62 
 
 
940 aa  99  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.434689  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1714  polysaccharide export protein  33.18 
 
 
947 aa  97.8  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.397648  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2184  polysaccharide export protein  25.89 
 
 
833 aa  96.7  9e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.243697  hitchhiker  0.000313767 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2676  polysaccharide export protein  23.74 
 
 
849 aa  95.5  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3062  polysaccharide export protein  29.97 
 
 
834 aa  94.4  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1842  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  34.81 
 
 
781 aa  94  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.749239  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0473  polysaccharide export protein  28.52 
 
 
824 aa  90.9  5e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1399  polysaccharide export protein  26.39 
 
 
920 aa  90.5  7e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00159215  normal  0.0100644 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2732  polysaccharide export protein  30.35 
 
 
753 aa  89.7  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445544  normal  0.725394 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0794  polysaccharide export protein  27.4 
 
 
869 aa  87.8  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.020437  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3032  polysaccharide export protein  27.44 
 
 
922 aa  87.8  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190653  normal  0.0184914 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1395  polysaccharide export protein  29.3 
 
 
931 aa  87.4  6e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0391429  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3035  polysaccharide export protein  26.09 
 
 
828 aa  86.3  1e-15  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.636336  normal  0.407015 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3645  polysaccharide biosynthesis/export protein  24.9 
 
 
920 aa  86.3  1e-15  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1470  polysaccharide export protein  26.4 
 
 
828 aa  85.9  2e-15  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.270093  normal  0.749053 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1651  polysaccharide export protein  27.43 
 
 
915 aa  84.7  4e-15  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.530434  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3403  polysaccharide export protein  30.39 
 
 
977 aa  83.2  1e-14  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00684592  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3193  polysaccharide biosynthesis protein  29.02 
 
 
921 aa  82.8  1e-14  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2769  polysaccharide export protein  29.1 
 
 
846 aa  82.4  2e-14  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.594167 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2843  polysaccharide export protein  28.23 
 
 
910 aa  82  3e-14  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427616  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0277  polysaccharide export periplasmic protein  25.79 
 
 
869 aa  81.6  3e-14  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1345  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  25.27 
 
 
568 aa  81.3  4e-14  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000291611 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2543  polysaccharide export protein  29.53 
 
 
919 aa  80.5  7e-14  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.941823  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2893  polysaccharide export protein  27.98 
 
 
912 aa  80.5  8e-14  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.325033  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2264  ClpX, ATPase regulatory subunit  27.8 
 
 
827 aa  79.7  1e-13  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000642696  decreased coverage  0.000131264 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0353  polysaccharide export protein  25.83 
 
 
830 aa  79.3  2e-13  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.949664  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00687  hypothetical protein  25.97 
 
 
897 aa  78.6  3e-13  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0763  polysaccharide export protein  26.44 
 
 
852 aa  76.6  1e-12  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00148481  normal  0.528442 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2671  polysaccharide export protein  28.49 
 
 
919 aa  76.6  1e-12  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2568  Soluble ligand binding domain protein  30.05 
 
 
812 aa  75.9  2e-12  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171347  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3949  polysaccharide export protein  27.47 
 
 
823 aa  69.7  1e-10  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.256427 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1576  ClpX, ATPase regulatory subunit  31.08 
 
 
833 aa  68.9  2e-10  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  3.3468e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2903  polysaccharide export protein  25.8 
 
 
828 aa  68.6  3e-10  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0690654  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0599  polysaccharide export protein  22.63 
 
 
580 aa  67.4  6e-10  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  5.41966e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4937  polysaccharide export protein  29.17 
 
 
800 aa  65.1  3e-09  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00100729  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1078  polysaccharide export protein  29.12 
 
 
830 aa  65.1  3e-09  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1375  polysaccharide export protein  27.39 
 
 
837 aa  65.1  3e-09  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193694  decreased coverage  2.8911e-06 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1315  polysaccharide export protein  27.39 
 
 
837 aa  65.1  4e-09  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0893778 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1382  polysaccharide export protein  27.39 
 
 
837 aa  65.1  4e-09  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02231  hypothetical protein  29.61 
 
 
700 aa  62.8  2e-08  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4605  polysaccharide export protein  25.49 
 
 
791 aa  60.5  7e-08  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.321524  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003530  polysaccharide export periplasmic protein  30.37 
 
 
700 aa  59.3  2e-07  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4037  polysaccharide export protein  31.48 
 
 
235 aa  58.5  3e-07  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1414  polysaccharide export protein  30.43 
 
 
234 aa  58.5  3e-07  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.639365 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  28.75 
 
 
205 aa  58.5  3e-07  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0598  polysaccharide export protein  25.17 
 
 
478 aa  57.8  6e-07  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000477703  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4708  polysaccharide export protein  29.27 
 
 
219 aa  57.4  7e-07  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655126  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2464  polysaccharide export protein  31.06 
 
 
235 aa  57.4  7e-07  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.719315  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5038  polysaccharide export protein  26.07 
 
 
358 aa  57.4  7e-07  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2506  polysaccharide export protein  29.52 
 
 
196 aa  56.6  1e-06  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2696  polysaccharide export protein  30.72 
 
 
196 aa  56.2  1e-06  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.975578 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1061  polysaccharide export protein  30.11 
 
 
478 aa  57  1e-06  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0167243  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0310  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.65 
 
 
703 aa  54.7  4e-06  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0783  capsule polysaccharide export protein, putative  30.12 
 
 
195 aa  54.7  4e-06  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0776  putative capsule polysaccharide export protein  30.12 
 
 
196 aa  54.7  4e-06  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5609  polysaccharide export protein  33.03 
 
 
419 aa  54.3  6e-06  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7871  hypothetical protein  29.21 
 
 
238 aa  53.9  7e-06  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2513  polysaccharide export protein  32.56 
 
 
454 aa  53.9  8e-06  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3022  polysaccharide export protein  30.11 
 
 
451 aa  53.9  8e-06  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  30.11 
 
 
264 aa  53.9  8e-06  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3593  polysaccharide export protein  32.56 
 
 
384 aa  53.5  9e-06  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1487  polysaccharide export protein  31.25 
 
 
193 aa  53.5  9e-06  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0270462  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1482  polysaccharide export protein  31.21 
 
 
270 aa  52.4  2e-05  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.242862  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4816  polysaccharide export protein  31.34 
 
 
253 aa  52.4  2e-05  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.769943 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1538  GumB protein  31.93 
 
 
249 aa  52.8  2e-05  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5320  polysaccharide export protein  29.45 
 
 
213 aa  50.8  6e-05  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.884665  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1712  polysaccharide export protein  29.11 
 
 
386 aa  50.8  7e-05  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69321  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0309  polysaccharide export protein  26.94 
 
 
195 aa  50.4  8e-05  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313034  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1344  polysaccharide export protein  30.28 
 
 
425 aa  50.4  9e-05  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00232143 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>