More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5932 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5932  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  100 
 
 
344 aa  680    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126603  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2089  rod shape-determining protein MreB  75.22 
 
 
347 aa  524  1e-148  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1710  rod shape-determining protein MreB  75.51 
 
 
347 aa  525  1e-148  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.08427e-32 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2509  rod shape-determining protein MreB  75.51 
 
 
347 aa  525  1e-148  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000707423  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0918  rod shape-determining protein MreB  75.22 
 
 
347 aa  523  1e-147  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000183454  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2866  rod shape-determining protein MreB  74.93 
 
 
347 aa  520  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000181914  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0120  rod shape-determining protein MreB  72.59 
 
 
344 aa  515  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0131  rod shape-determining protein MreB  72.59 
 
 
344 aa  515  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0113  rod shape-determining protein MreB  72.89 
 
 
344 aa  515  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.308435  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1049  rod shape-determining protein MreB  73.39 
 
 
347 aa  511  1e-144  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000197933  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0980  rod shape-determining protein MreB  74.56 
 
 
347 aa  511  1e-144  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000066828  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0112  rod shape-determining protein MreB  72.59 
 
 
344 aa  512  1e-144  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0117  rod shape-determining protein MreB  72.94 
 
 
344 aa  514  1e-144  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142106  normal  0.1175 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0130  rod shape-determining protein MreB  72.3 
 
 
344 aa  511  1e-144  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0119  rod shape-determining protein MreB  72.3 
 
 
344 aa  511  1e-144  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2592  rod shape-determining protein MreB  70.38 
 
 
343 aa  493  9.999999999999999e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3594  rod shape-determining protein MreB  69.97 
 
 
348 aa  491  9.999999999999999e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000028278  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3356  rod shape-determining protein MreB  68.51 
 
 
346 aa  486  1e-136  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0692396  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0592  rod shape-determining protein MreB  68.9 
 
 
347 aa  477  1e-133  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122229  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2184  rod shape-determining protein MreB  68.13 
 
 
346 aa  477  1e-133  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0164  rod shape-determining protein MreB  67.54 
 
 
346 aa  471  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0996  rod shape-determining protein MreB  67.45 
 
 
346 aa  473  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0162908  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2222  rod shape-determining protein MreB  66.96 
 
 
346 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1461  rod shape-determining protein MreB  66.08 
 
 
354 aa  464  1e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.473562  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14240  rod shape-determining protein MreB  66.28 
 
 
346 aa  456  1e-127  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102365  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2548  rod shape-determining protein MreB  65.09 
 
 
343 aa  444  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1540  rod shape-determining protein MreB  66.08 
 
 
344 aa  441  1e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00158953  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2820  rod shape-determining protein MreB  67.25 
 
 
346 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0187  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  61.11 
 
 
344 aa  439  9.999999999999999e-123  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00128251  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1466  rod shape-determining protein MreB  65.87 
 
 
343 aa  440  9.999999999999999e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2479  rod shape-determining protein MreB  63.66 
 
 
346 aa  441  9.999999999999999e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173015  normal  0.21254 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3339  rod shape-determining protein MreB  63.61 
 
 
343 aa  438  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000677131  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0540  rod shape-determining protein MreB  64.41 
 
 
343 aa  440  9.999999999999999e-123  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.172145 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2562  rod shape-determining protein MreB  63.36 
 
 
348 aa  437  1e-121  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.497429  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5269  rod shape-determining protein MreB  61.26 
 
 
343 aa  435  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.558763  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1301  rod shape-determining protein MreB  63.99 
 
 
343 aa  436  1e-121  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.753188  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2192  rod shape-determining protein MreB  63.36 
 
 
347 aa  437  1e-121  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.728891  hitchhiker  0.00000188341 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0088  rod shape-determining protein MreB  61.42 
 
 
340 aa  431  1e-120  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0515  rod shape-determining protein MreB  62.54 
 
 
343 aa  432  1e-120  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0667798  hitchhiker  0.00000000455643 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0470  rod shape-determining protein MreB  63.99 
 
 
342 aa  431  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1211  rod shape-determining protein MreB  60.66 
 
 
343 aa  432  1e-120  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.984944 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1412  rod shape-determining protein MreB  65.29 
 
 
344 aa  430  1e-119  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000497097  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1465  rod shape-determining protein MreB  60.41 
 
 
345 aa  427  1e-118  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.28948  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2134  rod shape-determining protein MreB  62.35 
 
 
339 aa  425  1e-118  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000759245  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7285  rod shape-determining protein MreB  65.15 
 
 
349 aa  427  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0748  rod shape-determining protein MreB  61.98 
 
 
368 aa  426  1e-118  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.508167  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2125  rod shape-determining protein MreB  60.41 
 
 
345 aa  421  1e-117  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.55936  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0252  rod shape-determining protein MreB  62.69 
 
 
347 aa  421  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00115776  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0583  rod shape-determining protein MreB  63.66 
 
 
348 aa  422  1e-117  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.127618  hitchhiker  0.00000000573376 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2658  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  61.98 
 
 
350 aa  424  1e-117  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4598  rod shape-determining protein MreB  67.46 
 
 
336 aa  424  1e-117  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2110  rod shape-determining protein MreB  61.13 
 
 
342 aa  422  1e-117  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0873  rod shape-determining protein MreB  62.61 
 
 
345 aa  420  1e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0844  rod shape-determining protein MreB  62.61 
 
 
345 aa  420  1e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2563  rod shape-determining protein MreB  61.61 
 
 
340 aa  420  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.684063  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0236  rod shape-determining protein MreB  61.52 
 
 
347 aa  419  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1694  rod shape-determining protein MreB  60.53 
 
 
346 aa  419  1e-116  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1539  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  60.6 
 
 
344 aa  420  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.113087  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2398  rod shape-determining protein MreB  60.83 
 
 
342 aa  421  1e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2017  rod shape-determining protein MreB  62.03 
 
 
346 aa  420  1e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.881411  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0868  rod shape-determining protein MreB  59.82 
 
 
345 aa  421  1e-116  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0325  rod shape-determining protein MreB  60.23 
 
 
346 aa  417  9.999999999999999e-116  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.208455  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3835  rod shape-determining protein MreB  62.69 
 
 
347 aa  415  9.999999999999999e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00197853  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1397  rod shape-determining protein MreB  60.41 
 
 
345 aa  415  9.999999999999999e-116  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0303  rod shape-determining protein MreB  60.23 
 
 
346 aa  417  9.999999999999999e-116  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0398  rod shape-determining protein MreB  62.39 
 
 
347 aa  415  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0857463  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0558  rod shape-determining protein MreB  60.9 
 
 
349 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000306946  normal  0.447345 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0169  rod shape-determining protein MreB  61.38 
 
 
347 aa  414  9.999999999999999e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0465  rod shape-determining protein MreB  62.39 
 
 
347 aa  415  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000238277  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0317  rod shape-determining protein MreB  59.82 
 
 
345 aa  417  9.999999999999999e-116  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.594365  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3465  rod shape-determining protein MreB  58.56 
 
 
342 aa  417  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23353  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3754  rod shape-determining protein MreB  61.19 
 
 
349 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000701456  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03110  cell wall structural complex MreBCD, actin-like component MreB  63.22 
 
 
347 aa  412  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000155968  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0456  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  63.22 
 
 
347 aa  412  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000227973  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3440  rod shape-determining protein MreB  63.22 
 
 
347 aa  412  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  4.46785e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3637  rod shape-determining protein MreB  63.22 
 
 
347 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000940362  hitchhiker  0.00158537 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4402  rod shape-determining protein MreB  60.6 
 
 
349 aa  413  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000143177  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4351  rod shape-determining protein MreB  61.79 
 
 
338 aa  412  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00355227  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03061  hypothetical protein  63.22 
 
 
347 aa  412  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000154905  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1352  rod shape-determining protein MreB  58.82 
 
 
343 aa  412  1e-114  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.261173  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0456  rod shape-determining protein MreB  63.22 
 
 
347 aa  412  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000507844  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3734  rod shape-determining protein MreB  63.22 
 
 
347 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000617813  normal  0.0424676 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3167  rod shape-determining protein MreB  60.6 
 
 
338 aa  412  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1005  rod shape-determining protein MreB  60.78 
 
 
347 aa  412  1e-114  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7282  cell shape determining protein MreB  58.56 
 
 
343 aa  414  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.356683  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3546  rod shape-determining protein MreB  63.22 
 
 
347 aa  412  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000601391  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3566  rod shape-determining protein MreB  63.22 
 
 
347 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000307307  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3565  rod shape-determining protein MreB  63.22 
 
 
347 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000236359  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4411  rod shape-determining protein MreB  62.39 
 
 
347 aa  414  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000473686  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002383  rod shape-determining protein MreB  61.98 
 
 
347 aa  414  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000533641  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1489  rod shape-determining protein MreB  61.76 
 
 
347 aa  412  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.202566 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3734  rod shape-determining protein MreB  63.22 
 
 
347 aa  412  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000718605  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3672  rod shape-determining protein MreB  63.22 
 
 
347 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000126331  normal  0.279818 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3282  rod shape-determining protein MreB  63.22 
 
 
347 aa  412  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000051141  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0183  rod shape-determining protein MreB  61.83 
 
 
347 aa  411  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000147765  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3687  rod shape-determining protein MreB  63.22 
 
 
347 aa  412  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000064313  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3677  rod shape-determining protein MreB  62.39 
 
 
347 aa  414  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00194737  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4567  rod shape-determining protein MreB  63.22 
 
 
347 aa  412  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000238726  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03685  rod shape-determining protein MreB  61.98 
 
 
347 aa  414  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0663  rod shape-determining protein MreB  59.76 
 
 
339 aa  409  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.435022  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>