272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5931 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5931  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 
296 aa  588  1e-167  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0609837  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  33.58 
 
 
274 aa  142  8e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1755  rod shape-determining protein MreC  31.64 
 
 
274 aa  136  4e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1368  rod shape-determining protein MreC  34.66 
 
 
291 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2500  rod shape-determining protein MreC  35.69 
 
 
291 aa  132  6e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  33.21 
 
 
274 aa  132  9e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1355  rod shape-determining protein MreC  35.29 
 
 
291 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  32.22 
 
 
272 aa  130  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  30.12 
 
 
274 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1452  rod shape-determining protein MreC  34.9 
 
 
291 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0926  rod shape-determining protein MreC  31.25 
 
 
273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  32.14 
 
 
277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1048  rod shape-determining protein MreC  30.34 
 
 
272 aa  127  3e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00267532  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  28.37 
 
 
281 aa  124  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3357  rod shape-determining protein MreC  33.18 
 
 
338 aa  113  5e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.368226  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2462  rod shape-determining protein MreC  33.58 
 
 
274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.416735  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  30.77 
 
 
357 aa  105  7e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0163  rod shape-determining protein MreC  34.33 
 
 
296 aa  103  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2185  rod shape-determining protein MreC  29.67 
 
 
304 aa  101  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0995  rod shape-determining protein MreC  27.95 
 
 
285 aa  100  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.30539  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1465  rod shape-determining protein MreC  29.09 
 
 
274 aa  100  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0237  rod shape-determining protein MreC  31.94 
 
 
292 aa  100  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2221  rod shape-determining protein MreC  31.82 
 
 
283 aa  98.6  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0484  rod shape-determining protein MreC  29.03 
 
 
286 aa  96.3  6e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0223264 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1462  rod shape-determining protein MreC  27.27 
 
 
359 aa  95.9  7e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.461363  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0479  rod shape-determining protein MreC  29.03 
 
 
286 aa  95.9  8e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  normal  0.489996 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2821  rod shape-determining protein MreC  34.68 
 
 
319 aa  94.7  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2239  rod shape-determining protein MreC  28.21 
 
 
317 aa  93.2  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0516  rod shape-determining protein MreC  26.94 
 
 
317 aa  93.2  5e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000408962 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  31.47 
 
 
273 aa  92.8  6e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0355  rod shape-determining protein MreC  32.14 
 
 
356 aa  92.4  9e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0325  rod shape-determining protein MreC  29.11 
 
 
369 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1302  rod shape-determining protein MreC  28.64 
 
 
283 aa  92  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.800161  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0169  rod shape-determining protein MreC  29.96 
 
 
357 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0161  rod shape-determining protein MreC  29.96 
 
 
357 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.749008  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0180  rod shape-determining protein MreC  29.96 
 
 
357 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.841992  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0365  rod shape-determining protein MreC  29.96 
 
 
357 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6462  rod shape-determining protein MreC  30.36 
 
 
355 aa  90.9  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2293  rod shape-determining protein MreC  29.96 
 
 
357 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2373  rod shape-determining protein MreC  29.96 
 
 
357 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.729262  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4399  rod shape-determining protein MreC  29.54 
 
 
369 aa  91.3  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691605  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2786  rod shape-determining protein MreC  29.96 
 
 
357 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14230  rod shape-determining protein MreC  25.36 
 
 
275 aa  90.9  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516691  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4350  rod shape-determining protein MreC  28.22 
 
 
288 aa  90.5  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.244731  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3453  rod shape-determining protein MreC  34.36 
 
 
407 aa  90.5  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.968542  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0421  rod shape-determining protein MreC  30.95 
 
 
306 aa  90.9  3e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00423645  hitchhiker  0.000135792 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0060  rod shape-determining protein MreC  31.67 
 
 
346 aa  90.1  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3191  rod shape-determining protein MreC  33.66 
 
 
254 aa  89  9e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0011283  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0052  rod shape-determining protein MreC  31.74 
 
 
336 aa  89  9e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0051  rod shape-determining protein MreC  29.11 
 
 
367 aa  88.6  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  30.26 
 
 
299 aa  88.2  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3366  rod shape-determining protein MreC  31.4 
 
 
348 aa  87.8  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0145  rod shape-determining protein MreC  29.96 
 
 
359 aa  88.2  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.811267  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  27.27 
 
 
286 aa  88.2  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3922  rod shape-determining protein MreC  28.63 
 
 
306 aa  87  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0223  rod shape-determining protein MreC  27.98 
 
 
307 aa  87  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3108  rod shape-determining protein MreC  31.12 
 
 
367 aa  87  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.988939  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3689  rod shape-determining protein MreC  32.32 
 
 
348 aa  87.4  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0077  rod shape-determining protein MreC  30.94 
 
 
324 aa  85.9  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0048  rod shape-determining protein MreC  28.12 
 
 
288 aa  85.5  9e-16  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  30.26 
 
 
296 aa  85.1  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1631  rod shape-determining protein MreC  25.51 
 
 
282 aa  84.7  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.017053  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2133  rod shape-determining protein MreC  25.46 
 
 
277 aa  85.1  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00195363  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0174  rod shape-determining protein MreC  27.31 
 
 
306 aa  85.1  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0669  rod shape-determining protein MreC  32.6 
 
 
316 aa  84.3  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.111553  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2022  rod shape-determining protein MreC  26.03 
 
 
311 aa  84.3  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.102546  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04261  rod shape-determining protein MreC  33.92 
 
 
448 aa  84.7  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.410208  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0588  rod shape-determining protein MreC  32.6 
 
 
316 aa  84.3  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0508667  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0101  rod shape-determining protein MreC  32.05 
 
 
300 aa  83.6  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3127  rod shape-determining protein MreC  28.86 
 
 
358 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2497  rod shape-determining protein MreC  28.86 
 
 
358 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.401568  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0575  rod shape-determining protein MreC  34.17 
 
 
334 aa  84  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000194769  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3111  rod shape-determining protein MreC  28.86 
 
 
358 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417593  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4559  rod shape-determining protein MreC  28.09 
 
 
291 aa  83.2  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2562  rod shape-determining protein MreC  25.71 
 
 
286 aa  83.2  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.028075  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1069  rod shape-determining protein MreC  31.4 
 
 
271 aa  82.8  0.000000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0874  rod shape-determining protein MreC  31.96 
 
 
302 aa  82.4  0.000000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0845  rod shape-determining protein MreC  31.96 
 
 
302 aa  82.4  0.000000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0513  rod shape-determining protein MreC  29.44 
 
 
286 aa  82.4  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0089  rod shape-determining protein MreC  25.72 
 
 
287 aa  82.4  0.000000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0234  rod shape-determining protein MreC  27.94 
 
 
305 aa  82  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.236094  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1938  rod shape-determining protein MreC  30.1 
 
 
267 aa  82  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368183  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0295  rod shape-determining protein MreC  29.35 
 
 
306 aa  82  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1258  rod shape-determining protein MreC  29.18 
 
 
292 aa  81.6  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0759528  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0284  rod shape-determining protein MreC  27.99 
 
 
326 aa  81.3  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  24.91 
 
 
285 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1739  rod shape-determining protein MreC  25.21 
 
 
281 aa  81.3  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3049  rod shape-determining protein MreC  28.63 
 
 
356 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0513  rod shape-determining protein MreC  31.02 
 
 
285 aa  81.3  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3166  rod shape-determining protein MreC  28.63 
 
 
356 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0280823  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0468  rod shape-determining protein MreC  27.95 
 
 
309 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077697  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2727  rod shape-determining protein MreC  29.68 
 
 
243 aa  81.3  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00760389  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0240  rod shape-determining protein MreC  27.94 
 
 
305 aa  81.3  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.857372 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1875  rod shape-determining protein MreC  34.42 
 
 
274 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.813624  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06080  rod shape-determining protein MreC  27.5 
 
 
315 aa  79.3  0.00000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000549301 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0574  rod shape-determining protein MreC  30.56 
 
 
285 aa  79.3  0.00000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.931469  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18101  rod shape-determining protein MreC  30.82 
 
 
249 aa  79.3  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.448096  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1640  rod shape-determining protein MreC  24.64 
 
 
288 aa  79.3  0.00000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000445773  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1628  rod shape-determining protein MreC  29.89 
 
 
276 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0184  rod shape-determining protein MreC  31.56 
 
 
286 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00341566  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>