More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5884 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5884  ribonuclease BN  100 
 
 		 499 aa  1008    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0638  putative ribonuclease BN  33.41 
 
 		 449 aa  218  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00048226  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2779  ribonuclease BN  31.4 
 
 		 453 aa  209  7e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00809939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0739  putative ribonuclease BN  33.85 
 
 		 434 aa  200  6e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1979  hypothetical protein  32.12 
 
 		 479 aa  192  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0594  ribonuclease BN  30.51 
 
 		 446 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000174757 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0581  ribonuclease BN  30.68 
 
 		 446 aa  183  8.000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000420999  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2460  ribonuclease BN, putative  33.09 
 
 		 397 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0732  ribonuclease BN  33.8 
 
 		 439 aa  174  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0733  ribonuclease BN  33.8 
 
 		 439 aa  174  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0824671  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3053  putative ribonuclease BN  30.37 
 
 		 451 aa  173  6.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0697  ribonuclease BN, putative  34.07 
 
 		 429 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.47498  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1636  ribonuclease BN  32.98 
 
 		 447 aa  169  1e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2776  putative ribonuclease BN  32.76 
 
 		 417 aa  168  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2655  ribonuclease BN  30.67 
 
 		 439 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1819  putative ribonuclease BN  28.06 
 
 		 442 aa  167  5e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.10172  normal  0.193645 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0764  ribonuclease BN  29.51 
 
 		 452 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03526  ribonuclease BN  31.82 
 
 		 294 aa  162  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0234008  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2112  ribonuclease BN  36.96 
 
 		 425 aa  160  4e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.181145  normal  0.117227 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3064  ribonuclease BN, putative  31.29 
 
 		 473 aa  155  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00183316  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3545  ribonuclease BN  34.87 
 
 		 285 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.109526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0704  putative ribonuclease BN  31.44 
 
 		 451 aa  154  4e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.71296  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4086  putative ribonuclease BN  29.71 
 
 		 487 aa  154  4e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143901  normal  0.331874 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2773  ribonuclease BN  33.33 
 
 		 437 aa  152  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1354  ribonuclease BN  33.73 
 
 		 436 aa  151  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.875268  normal  0.303489 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0901  tRNA-processing RNAse BN  30.41 
 
 		 433 aa  151  3e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.562692  decreased coverage  0.000000115397 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1793  ribonuclease BN  33.98 
 
 		 442 aa  151  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0942  ribonuclease BN  33.73 
 
 		 437 aa  150  4e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1862  ribonuclease BN  33.73 
 
 		 437 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.618695  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1685  tRNA-processing ribonuclease BN  33.73 
 
 		 437 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.417952  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1707  tRNA-processing ribonuclease BN  33.73 
 
 		 437 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1475  ribonuclease BN  33.73 
 
 		 437 aa  150  4e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1434  ribonuclease BN  34.52 
 
 		 442 aa  150  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0974  ribonuclease BN, putative  34.52 
 
 		 442 aa  150  6e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315544  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1456  putative ribonuclease BN  34.52 
 
 		 442 aa  150  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1377  ribonuclease BN  34.13 
 
 		 443 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763301  normal  0.704772 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4601  ribonuclease BN  34.13 
 
 		 443 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0014  putative ribonuclease BN  30.38 
 
 		 450 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4618  ribonuclease BN  32.07 
 
 		 336 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.331921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0521  putative ribonuclease BN  33.42 
 
 		 445 aa  149  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623769 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1337  putative ribonuclease BN  34.13 
 
 		 443 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500166  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1514  ribonuclease BN  31.05 
 
 		 472 aa  147  3e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.258349  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0406  ribonuclease BN  34.13 
 
 		 436 aa  148  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0756  tRNA-processing ribonuclease BN  34.13 
 
 		 436 aa  148  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.902171  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0595  ribonuclease BN  31.35 
 
 		 460 aa  146  7.0000000000000006e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2618  YihY family protein  32.94 
 
 		 437 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1575  ribonuclease BN  32.93 
 
 		 439 aa  145  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0302  ribonuclease BN  34.22 
 
 		 298 aa  145  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.223678  hitchhiker  0.000000133239 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3909  ribonuclease BN  31.29 
 
 		 340 aa  144  4e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0931  putative ribonuclease BN  29.18 
 
 		 459 aa  144  5e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810596 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1519  ribonuclease BN  31.75 
 
 		 424 aa  142  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.105357 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0315  ribonuclease BN  31.78 
 
 		 323 aa  140  6e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0319  ribonuclease BN  31.78 
 
 		 323 aa  140  6e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0314  ribonuclease BN  31.78 
 
 		 323 aa  140  6e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.321317  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0320  ribonuclease BN  31.78 
 
 		 323 aa  140  6e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3708  ribonuclease BN  30.04 
 
 		 337 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.153225 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1131  tRNA-processing RNAse BN  32.26 
 
 		 447 aa  139  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0311  ribonuclease BN  30.04 
 
 		 337 aa  139  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415793 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1664  ribonuclease BN  34.01 
 
 		 443 aa  139  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0666088  hitchhiker  0.00703858 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0548  tRNA-processing RNAse BN  28.46 
 
 		 525 aa  139  2e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2938  ribonuclease BN  32.82 
 
 		 310 aa  138  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0536  ribonuclease BN, putative  28.53 
 
 		 525 aa  138  2e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.031655 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0316  ribonuclease BN  30.04 
 
 		 337 aa  139  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.293845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1994  ribonuclease BN  34.01 
 
 		 443 aa  138  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.20518  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2157  ribonuclease BN, putative  33.15 
 
 		 430 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4401  ribonuclease BN  30.04 
 
 		 295 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3448  ribonuclease BN  33.33 
 
 		 313 aa  137  4e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.016816  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3954  ribonuclease BN  33.07 
 
 		 300 aa  136  9e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0331  ribonuclease BN  31.91 
 
 		 320 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.533981  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1559  putative ribonuclease BN transmembrane protein  33.2 
 
 		 441 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0698  hypothetical protein  25.7 
 
 		 412 aa  135  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0680  hypothetical protein  25.42 
 
 		 412 aa  134  5e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1250  tRNA-processing RNAse BN  35.12 
 
 		 444 aa  134  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4878  ribonuclease BN  34.89 
 
 		 296 aa  134  5e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000922798 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51960  ribonuclease  33.06 
 
 		 411 aa  134  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000384323 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4558  ribonuclease  33.06 
 
 		 411 aa  134  5e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0609  ribonuclease BN  32.02 
 
 		 303 aa  132  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0138634  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2681  ribonuclease BN  28.83 
 
 		 561 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.267088 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2314  ribonuclease BN  33.07 
 
 		 297 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0630  putative ribonuclease BN  32.81 
 
 		 538 aa  132  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.883121 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0452  ribonuclease BN, putative  32.7 
 
 		 426 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3404  ribonuclease BN  33.47 
 
 		 303 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1422  putative ribonuclease BN transmembrane protein  31 
 
 		 416 aa  130  6e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00924301 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0693  ribonuclease BN  32.66 
 
 		 288 aa  130  7.000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4260  ribonuclease BN  35.48 
 
 		 290 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4351  ribonuclease BN  35.48 
 
 		 290 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4416  ribonuclease BN  35.48 
 
 		 290 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4238  ribonuclease BN  35.48 
 
 		 290 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.89383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4305  ribonuclease BN  35.48 
 
 		 290 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.269266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3482  ribonuclease BN  32.56 
 
 		 292 aa  129  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.384798 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1471  ribonuclease BN  28.57 
 
 		 422 aa  128  2.0000000000000002e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.610738  normal  0.604096 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3782  putative ribonuclease BN  30.48 
 
 		 417 aa  128  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.747411  normal  0.886826 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2988  tRNA-processing RNAse BN  33.05 
 
 		 405 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0115566 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36810  Ribonuclease BN-like protein  32.65 
 
 		 408 aa  125  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0732  ribonuclease BN  28.49 
 
 		 424 aa  125  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.119651  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0958  ribonuclease BN, putative  26.84 
 
 		 411 aa  124  3e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.107096 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4092  ribonuclease BN  33.87 
 
 		 290 aa  124  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2769  putative ribonuclease BN  33.72 
 
 		 404 aa  124  4e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4409  ribonuclease BN  33.83 
 
 		 290 aa  124  4e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5333  ribonuclease BN  33.83 
 
 		 290 aa  124  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.247154 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>