More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5882 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5882  NUDIX hydrolase  100 
 
 
191 aa  387  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0039  NUDIX hydrolase  45.76 
 
 
183 aa  159  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0673  NUDIX hydrolase  41.11 
 
 
191 aa  114  8.999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3069  NUDIX hydrolase  35.09 
 
 
188 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  42.14 
 
 
180 aa  108  5e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1424  NUDIX hydrolase  40.44 
 
 
188 aa  100  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.884669  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1495  NUDIX hydrolase  34.53 
 
 
182 aa  97.8  8e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.403846  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0010  MutT/nudix family protein  33.88 
 
 
188 aa  94  1e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  33.85 
 
 
176 aa  92.8  3e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3586  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
186 aa  90.9  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.150118 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0055  NUDIX hydrolase  38.73 
 
 
196 aa  88.6  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1344  hypothetical protein  35.88 
 
 
265 aa  87.4  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.321071  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2771  NUDIX hydrolase  38.24 
 
 
192 aa  87  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3899  NUDIX hydrolase  33.14 
 
 
187 aa  87.4  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3513  NUDIX hydrolase  35.03 
 
 
184 aa  86.7  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.200164 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3605  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 
181 aa  86.3  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0982  NUDIX hydrolase  34.53 
 
 
177 aa  84.3  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.76015  normal  0.0931916 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2065  NUDIX family hydrolase  35.07 
 
 
176 aa  84.3  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.862102  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1779  adp-ribose pyrophosphatase  33.33 
 
 
176 aa  82.8  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
179 aa  82.4  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2834  NUDIX hydrolase  34.88 
 
 
169 aa  81.3  0.000000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1221  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 
190 aa  80.5  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1544  NUDIX hydrolase  34.35 
 
 
186 aa  79.7  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  32.33 
 
 
177 aa  79  0.00000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1677  NUDIX hydrolase  33.09 
 
 
192 aa  79  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.855535  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  34.92 
 
 
178 aa  78.6  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1062  MutT/nudix family protein  34.13 
 
 
180 aa  78.2  0.00000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.20499  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 
177 aa  78.2  0.00000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6545  NUDIX hydrolase  27.97 
 
 
188 aa  77.4  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  35.61 
 
 
177 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2794  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 
181 aa  77  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0456  MutT/nudix family protein  35.61 
 
 
176 aa  76.6  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0404799  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  32.58 
 
 
184 aa  76.6  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  33.77 
 
 
281 aa  76.3  0.0000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 
180 aa  75.9  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2046  NUDIX hydrolase  35.43 
 
 
194 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0433  NUDIX hydrolase  33.82 
 
 
176 aa  76.3  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00447599  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0285  NUDIX hydrolase  34.11 
 
 
164 aa  76.3  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0995  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 
170 aa  75.9  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.575894  normal  0.946338 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0237  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
183 aa  75.1  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.373824  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2376  NUDIX hydrolase  34.32 
 
 
215 aa  75.5  0.0000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2211  NUDIX hydrolase  32.52 
 
 
164 aa  75.5  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0268  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 
165 aa  75.1  0.0000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.880251  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4063  NUDIX hydrolase  34.29 
 
 
228 aa  75.1  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0818284  normal  0.284545 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  36.21 
 
 
182 aa  75.1  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_398  MutT/nudix, ADP-ribose pyrophosphatase  33.58 
 
 
176 aa  74.7  0.0000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.148699  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03661  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 
186 aa  74.7  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0213  NUDIX hydrolase  34.43 
 
 
178 aa  74.7  0.0000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0378357  normal  0.391369 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5000  NUDIX hydrolase  34.44 
 
 
180 aa  74.3  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1652  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 
186 aa  74.3  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.568517  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0288  NUDIX hydrolase  32.82 
 
 
187 aa  74.3  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.919876  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  33.52 
 
 
178 aa  74.3  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3199  ADP-ribose phosphorylase  37.23 
 
 
194 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000680603  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1808  NUDIX hydrolase  36.77 
 
 
193 aa  73.9  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.801107  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03101  NUDIX hydrolase  30.71 
 
 
187 aa  74.3  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2047  hypothetical protein  35.77 
 
 
205 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440129  normal  0.12393 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3558  NUDIX hydrolase  31.72 
 
 
173 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  31.61 
 
 
179 aa  73.2  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2011  NUDIX hydrolase  32.03 
 
 
192 aa  73.2  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252009  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001880  ADP compounds hydrolase NudE  35.07 
 
 
189 aa  73.2  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5410  NUDIX hydrolase  40 
 
 
208 aa  72.8  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03091  NUDIX hydrolase  32.82 
 
 
187 aa  72.8  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0558584  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3624  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 
173 aa  72.4  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1757  NUDIX hydrolase  33.13 
 
 
189 aa  72.4  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335075  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03191  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 
186 aa  72.4  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.798424  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0157  NUDIX hydrolase  40.32 
 
 
180 aa  72  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0179624  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1927  NUDIX hydrolase  43.1 
 
 
184 aa  72  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00211801  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0048  NUDIX hydrolase  33.09 
 
 
173 aa  72  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.642128 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00613  ADP-ribose diphosphatase NudE  35.71 
 
 
188 aa  71.2  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3354  mutT/nudix family protein  40.86 
 
 
173 aa  71.2  0.000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2199  NUDIX hydrolase  33.58 
 
 
203 aa  71.2  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  33.33 
 
 
185 aa  70.5  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2429  NUDIX hydrolase  33.93 
 
 
182 aa  70.5  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0417103 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0076  NUDIX hydrolase  32 
 
 
184 aa  70.5  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.655363 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2835  NUDIX hydrolase  47.73 
 
 
210 aa  70.9  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0310181  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1024  NUDIX hydrolase  34.56 
 
 
180 aa  70.9  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00585419  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3282  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
211 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1222  NUDIX hydrolase  35.17 
 
 
166 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.524014  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2512  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
172 aa  69.7  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335914  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0942  NUDIX hydrolase  34.46 
 
 
211 aa  70.1  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151372  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2958  NUDIX hydrolase  35.38 
 
 
209 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.682992  normal  0.58041 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1716  NUDIX hydrolase  28.24 
 
 
171 aa  70.1  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0743315 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03121  NUDIX hydrolase  28.89 
 
 
189 aa  70.1  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2672  NUDIX hydrolase  32.88 
 
 
184 aa  70.1  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.687973  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0185  hypothetical protein  34.65 
 
 
335 aa  69.7  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.533354  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0976  NUDIX hydrolase  34.27 
 
 
204 aa  69.3  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.82021  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4146  NUDIX hydrolase  32.87 
 
 
180 aa  69.3  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1358  NUDIX hydrolase  35.04 
 
 
194 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573417  hitchhiker  0.00856079 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0119  ADP-ribose diphosphatase NudE  36.61 
 
 
185 aa  69.3  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00596251  normal  0.391787 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25181  NUDIX hydrolase  31.94 
 
 
189 aa  69.7  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11715  hypothetical protein  30.77 
 
 
207 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.191182 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0724  NUDIX hydrolase  29.84 
 
 
169 aa  68.9  0.00000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.983328  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  29.57 
 
 
183 aa  68.9  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1466  NUDIX hydrolase  31.75 
 
 
183 aa  68.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0176  NUDIX hydrolase  32.64 
 
 
173 aa  68.6  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0982781  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03971  ADP-ribose diphosphatase NudE  33.86 
 
 
187 aa  68.6  0.00000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.222226  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1876  NUDIX hydrolase  33.58 
 
 
203 aa  68.6  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.765348  normal  0.48572 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0252  ADP-ribose diphosphatase NudE  35.29 
 
 
190 aa  68.6  0.00000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0705  MutT/nudix family protein  30.16 
 
 
185 aa  68.2  0.00000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2826  pyrophosphohydrolase related protein  29.65 
 
 
192 aa  68.2  0.00000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>