16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5862 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5862  hypothetical protein  100 
 
 		 438 aa  815    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310924  normal  0.906322 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1601  hypothetical protein  20.34 
 
 		 213 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0132494  hitchhiker  0.000697535 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02790  hypothetical protein  30.7 
 
 		 349 aa  54.3  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.874218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1475  hypothetical protein  19.34 
 
 		 220 aa  52  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.658618  normal  0.0659937 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1410  hypothetical protein  19.44 
 
 		 246 aa  51.2  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00489439 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0065  hypothetical protein  41.88 
 
 		 1024 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2422  hypothetical protein  23.14 
 
 		 211 aa  49.7  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.14602 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  21.35 
 
 		 3409 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1463  hypothetical protein  23.89 
 
 		 195 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000105006 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0083  putative CheA signal transduction histidine kinase  38.04 
 
 		 1067 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.148961  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3085  hypothetical protein  23.33 
 
 		 192 aa  48.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2457  hypothetical protein  25.41 
 
 		 154 aa  47  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2165  hypothetical protein  23.01 
 
 		 143 aa  46.2  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.324549  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26100  predicted protein  28.67 
 
 		 1646 aa  45.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.490738  normal  0.061037 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0071  putative CheA signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 		 1089 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.114156  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0739  YSIRK Gram-positive signal peptide  25.98 
 
 		 2035 aa  43.9  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>