31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5834 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5834  aminopeptidase  100 
 
 
349 aa  701    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.325368  normal  0.928661 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4455  aminopeptidase-like protein  34.46 
 
 
353 aa  154  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0536  putative zinc protease protein  34.73 
 
 
385 aa  152  8e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.421159  normal  0.628812 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0004  aminopeptidase  30.37 
 
 
340 aa  151  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0290521  normal  0.0636966 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0111  hypothetical protein  34.03 
 
 
363 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.163649  normal  0.0432694 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0093  hypothetical protein  34.83 
 
 
387 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00544178 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01150  hypothetical protein  34.89 
 
 
355 aa  148  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00750  hypothetical protein  36.34 
 
 
375 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.369332  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0108  hypothetical protein  34.66 
 
 
363 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0146  hypothetical protein  33.53 
 
 
351 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3380  putative zinc protease protein  32.72 
 
 
357 aa  140  3e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0108  hypothetical protein  33.54 
 
 
357 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000475774 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3087  putative zinc protease protein  36 
 
 
363 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.222342 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0063  hypothetical protein  35.8 
 
 
336 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.501325  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2740  putative zinc protease protein  32.34 
 
 
365 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0331505  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0093  hypothetical protein  30.5 
 
 
376 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0043  hypothetical protein  33.43 
 
 
351 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2999  putative zinc protease protein  32.06 
 
 
379 aa  134  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769735  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2858  putative zinc protease protein  31.69 
 
 
384 aa  132  6e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3150  putative zinc protease protein  33.23 
 
 
385 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3105  putative zinc protease protein  31.58 
 
 
365 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0009  aminopeptidase  26.22 
 
 
343 aa  129  9.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000000716532  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3501  putative zinc protease protein  32.01 
 
 
374 aa  119  6e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0403427  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4033  putative zinc protease protein  30.09 
 
 
369 aa  117  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.213397 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3556  putative zinc protease protein  30.89 
 
 
356 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0456  putative zinc protease protein  32.05 
 
 
381 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.428295  normal  0.446741 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0447  putative zinc protease protein  32.24 
 
 
381 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.400718  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0337  putative zinc protease protein  30.84 
 
 
384 aa  102  9e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1145  putative zinc protease protein  29.23 
 
 
442 aa  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0774  putative zinc protease protein  30.73 
 
 
399 aa  100  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0866721  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3534  putative zinc protease protein  29.75 
 
 
360 aa  95.1  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>