241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5789 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  100 
 
 
444 aa  858    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  37.72 
 
 
459 aa  226  8e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3628  amine oxidase  39.47 
 
 
465 aa  225  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  36.38 
 
 
456 aa  214  1.9999999999999998e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13191  flavin-containing monoamine oxidase aofH  36.45 
 
 
454 aa  192  7e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.28865 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6401  twin-arginine translocation pathway signal  33.56 
 
 
493 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  33.78 
 
 
447 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2738  amine oxidase  33.91 
 
 
494 aa  190  5e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4501  amine oxidase  35.15 
 
 
446 aa  188  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129259  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0369  putative flavin-containing monoamine oxidase  34.44 
 
 
484 aa  187  4e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0389  amine oxidase  36.73 
 
 
449 aa  186  6e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.22597  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4000  amine oxidase (flavin-containing)  34.84 
 
 
499 aa  186  6e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.812077  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4356  amine oxidase  34.33 
 
 
493 aa  186  8e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2742  twin-arginine translocation pathway signal  35.06 
 
 
490 aa  184  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00724146  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5037  amine oxidase (flavin-containing)  34.12 
 
 
493 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5823  amine oxidase (flavin-containing)  34.12 
 
 
493 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4367  amine oxidase (flavin-containing)  34.44 
 
 
494 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5048  twin-arginine translocation pathway signal  34.71 
 
 
578 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5812  amine oxidase; FAD dependent oxidoreductase  34.44 
 
 
494 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.377478  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4331  Amine oxidase (flavin-containing)  34.47 
 
 
498 aa  179  5.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4441  Amine oxidase (flavin-containing)  34.47 
 
 
498 aa  179  5.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6833  amine oxidase  32.88 
 
 
532 aa  179  8e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.574218  normal  0.40808 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1230  amine oxidase (flavin-containing)  31.87 
 
 
457 aa  179  9e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.333981  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5578  amine oxidase (flavin-containing)  32.66 
 
 
456 aa  176  8e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0141  amine oxidase (flavin-containing)  34.68 
 
 
452 aa  174  1.9999999999999998e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  33.7 
 
 
450 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  33.7 
 
 
450 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6829  amine oxidase  33.93 
 
 
492 aa  170  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423551  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2005  amine oxidase  31.32 
 
 
492 aa  168  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  31.69 
 
 
454 aa  167  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4452  Amine oxidase (flavin-containing)  33.33 
 
 
498 aa  162  9e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.383006  normal  0.183412 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1526  amine oxidase (flavin-containing)  32.44 
 
 
439 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.028024  normal  0.955332 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  32.81 
 
 
445 aa  159  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2472  amine oxidase  29.93 
 
 
459 aa  158  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10320  monoamine oxidase  30.02 
 
 
510 aa  154  2.9999999999999998e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2065  amine oxidase  31.66 
 
 
458 aa  152  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  30.96 
 
 
463 aa  149  8e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  29.55 
 
 
462 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2278  amine oxidase  26.34 
 
 
464 aa  133  6.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.381011  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0838  Putrescine oxidase  33.77 
 
 
463 aa  132  9e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1906  amine oxidase (flavin-containing)  29.23 
 
 
487 aa  131  2.0000000000000002e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.46762  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0745  amine oxidase (flavin-containing)  27.37 
 
 
469 aa  130  3e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03291  flavin-containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00100)  27.23 
 
 
457 aa  129  1.0000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0113455 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0682  Putrescine oxidase  30.8 
 
 
512 aa  123  7e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.016891  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05890  conserved hypothetical protein  26.62 
 
 
492 aa  119  9.999999999999999e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.314478  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7453  amine oxidase  33.83 
 
 
438 aa  116  8.999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0863551  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5286  amine oxidase  25.92 
 
 
592 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.456502  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07013  oxidoreductase  26.91 
 
 
365 aa  105  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0521  hypothetical protein  27.56 
 
 
496 aa  103  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05480  hypothetical protein  27 
 
 
496 aa  99.8  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4983  amine oxidase  26.86 
 
 
619 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6047  amine oxidase  28.25 
 
 
353 aa  98.6  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.629217  normal  0.078923 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0482  amine oxidase  26.19 
 
 
565 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4856  amine oxidase  26.64 
 
 
619 aa  97.1  6e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.314626  normal  0.125904 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5032  amine oxidase  25.66 
 
 
616 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5074  amine oxidase, flavin-containing protein  25.17 
 
 
625 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  28.26 
 
 
435 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0455  amine oxidase  25.67 
 
 
624 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3414  amine oxidase, flavin-containing  22.53 
 
 
478 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000395874 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  25.88 
 
 
479 aa  92  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2029  amine oxidase, flavin-containing  22.53 
 
 
478 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0460488  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03220  flavin-containing mono amine oxidase  29.12 
 
 
491 aa  90.5  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.158318  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1928  amine oxidase, flavin-containing  22.32 
 
 
478 aa  89.7  8e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.336524  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5603  amine oxidase, flavin-containing  28.02 
 
 
492 aa  89.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1960  amine oxidase, flavin-containing  22.32 
 
 
478 aa  87  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000207748 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  29.13 
 
 
445 aa  86.3  9e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2753  amine oxidase  30.33 
 
 
352 aa  85.9  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.394653  normal  0.0187617 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  23.01 
 
 
478 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  21.56 
 
 
482 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  23.01 
 
 
478 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  21.56 
 
 
482 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  21.56 
 
 
482 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  21.56 
 
 
487 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1764  amine oxidase, flavin-containing  22.75 
 
 
478 aa  84  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.425068  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  21.35 
 
 
490 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  24.65 
 
 
445 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  21.4 
 
 
485 aa  82  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3776  amine oxidase  31.97 
 
 
352 aa  81.6  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.435082 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5079  amine oxidase  24.16 
 
 
459 aa  80.9  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.392573 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  20.97 
 
 
490 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42289  amine oxidase  24.78 
 
 
628 aa  80.1  0.00000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.317329  decreased coverage  0.00000000282984 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3508  amine oxidase  28.57 
 
 
435 aa  79.3  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  21.59 
 
 
487 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5977  amine oxidase  25.51 
 
 
350 aa  79  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  21.06 
 
 
490 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2268  amine oxidase  25.96 
 
 
431 aa  77.8  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5972  amine oxidase  25.25 
 
 
349 aa  77  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.824241  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1720  twin-arginine translocation pathway signal  23.08 
 
 
529 aa  77  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02566  conserved hypothetical protein  34.73 
 
 
510 aa  77  0.0000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.676497 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2008  amine oxidase, flavin-containing  20.81 
 
 
478 aa  76.6  0.0000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1799  amine oxidase  22.37 
 
 
482 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  21.75 
 
 
495 aa  75.9  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  21.31 
 
 
487 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1742  amine oxidase, flavin-containing  22.32 
 
 
478 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2710  twin-arginine translocation pathway signal  25 
 
 
469 aa  73.9  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1006  amine oxidase  31.2 
 
 
387 aa  73.9  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.74329  hitchhiker  0.00000000109904 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0882  flavin monoamine oxidase family protein  31.2 
 
 
387 aa  73.9  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  21 
 
 
436 aa  73.6  0.000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  21.08 
 
 
495 aa  69.3  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0846  amine oxidase  21.09 
 
 
525 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>