180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5784 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5784  RimK domain protein ATP-grasp  100 
 
 		 486 aa  989    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1453  glutathione synthase/ribosomal protein S6 modification enzyme (glutaminyl transferase)  52.24 
 
 		 490 aa  491  9.999999999999999e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.16454 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0446  hypothetical protein  43.39 
 
 		 484 aa  443  1e-123  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0422  hypothetical protein  43.39 
 
 		 484 aa  442  1e-123  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0575  RimK domain protein ATP-grasp  43.44 
 
 		 490 aa  437  1e-121  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0103875  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1722  glutathione synthase/ribosomal protein S6 modification enzyme (glutaminyl transferase)  43.86 
 
 		 499 aa  428  1e-118  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39390  ribosomal protein S6 modification enzyme  41.09 
 
 		 495 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.836539 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3347  hypothetical protein  41.3 
 
 		 495 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2617  hypothetical protein  40.33 
 
 		 524 aa  384  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2232  RimK domain protein ATP-grasp  41.18 
 
 		 494 aa  381  1e-104  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.360505 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2956  ribosomal protein S6 modification protein-related protein  41.87 
 
 		 526 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0238931 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2716  RimK domain-containing protein ATP-grasp  41.87 
 
 		 526 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1291  RimK domain-containing protein ATP-grasp  39.59 
 
 		 483 aa  377  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.696817  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1912  hypothetical protein  39.92 
 
 		 483 aa  378  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1841  RimK domain-containing protein ATP-grasp  39.47 
 
 		 492 aa  378  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0608327 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46880  glutathione synthase  42.31 
 
 		 529 aa  375  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000272025 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1035  RimK domain-containing protein ATP-grasp  40.64 
 
 		 499 aa  369  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.494403  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2526  glutathione synthase/ribosomal protein S6 modification glutaminyl transferase  40.2 
 
 		 528 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000161005  normal  0.270973 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4039  hypothetical protein  41.5 
 
 		 515 aa  366  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0756389  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1157  glutathione synthase  39.02 
 
 		 483 aa  365  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2089  RimK domain protein ATP-grasp  39.06 
 
 		 518 aa  361  2e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2466  hypothetical protein  39.06 
 
 		 518 aa  361  2e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2915  glutathione synthase  40.53 
 
 		 486 aa  348  2e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.525295 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0776  RimK domain-containing protein ATP-grasp  41.63 
 
 		 486 aa  347  2e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121233  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4158  RimK-like ATP-grasp  40.24 
 
 		 488 aa  347  3e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.530195  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1458  RimK domain-containing protein ATP-grasp  39.88 
 
 		 502 aa  346  5e-94  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0341602  normal  0.0124544 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0957  RimK-like ATP-grasp  39.27 
 
 		 486 aa  338  9.999999999999999e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2526  hypothetical protein  40.77 
 
 		 496 aa  337  3.9999999999999995e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02216  glutathione synthase  38.77 
 
 		 495 aa  335  1e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000592479  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2764  hypothetical protein  39.14 
 
 		 489 aa  334  3e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.338805  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1892  RimK domain-containing protein ATP-grasp  40 
 
 		 502 aa  333  5e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356939 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1695  RimK domain-containing protein ATP-grasp  38.75 
 
 		 335 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.803385  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1421  RimK domain-containing protein ATP-grasp  33.93 
 
 		 316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1433  RimK domain-containing protein ATP-grasp  31.4 
 
 		 316 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.133242 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1626  RimK domain-containing protein ATP-grasp  37.45 
 
 		 290 aa  162  1e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0205048 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0475  RimK domain-containing protein ATP-grasp  30.03 
 
 		 316 aa  156  7e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.60167  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1201  RimK domain-containing protein ATP-grasp  32.88 
 
 		 255 aa  143  7e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2310  ribosomal protein S6 modification protein  26.77 
 
 		 301 aa  69.3  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5941  ribosomal protein S6 modification protein  26.69 
 
 		 301 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68660  ribosomal protein S6 modification protein  26.69 
 
 		 301 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1361  alpha-L-glutamate ligase  25.51 
 
 		 301 aa  65.5  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.934336  hitchhiker  0.0000103664 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3664  alpha-L-glutamate ligase  24.8 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124246  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2289  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  25.69 
 
 		 300 aa  63.9  0.000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05140  ribosomal protein S6 modification enzyme RimK  25.2 
 
 		 301 aa  63.9  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2032  SSU ribosomal protein S6P modification protein  25.39 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000147156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0363  SSU ribosomal protein S6P modification protein  26.67 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0262  SSU ribosomal protein S6P modification protein  25.9 
 
 		 301 aa  62  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345619 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6087  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  24.91 
 
 		 302 aa  62  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0619  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  26.32 
 
 		 302 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.875829  normal  0.913535 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2779  alpha-L-glutamate ligase  26.18 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000513891  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2388  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  25.7 
 
 		 300 aa  61.6  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2398  S6 modification enzyme RimK  25.97 
 
 		 307 aa  61.2  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0604  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  25.88 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1240  SSU ribosomal protein S6P modification protein  24.8 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272934  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1549  S6 modification enzyme RimK  24.5 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3666  alpha-L-glutamate ligase  25.43 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000125802  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00716  ribosomal protein S6 modification protein  24.9 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0273  alpha-L-glutamate ligase  25.9 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4964  alpha-L-glutamate ligase  25.9 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000940925 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3095  RimK domain-containing protein ATP-grasp  28.65 
 
 		 264 aa  60.5  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.293473  normal  0.139536 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1137  lysine biosynthesis enzyme LysX  26.78 
 
 		 283 aa  60.1  0.00000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0237722  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0248  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  25.9 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0180089 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0263  alpha-L-glutamate ligase  25.9 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.553998 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2270  ribosomal protein S6 modification protein  24.29 
 
 		 299 aa  59.7  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06734  glutathione synthase  23.6 
 
 		 286 aa  59.7  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1745  SSU ribosomal protein S6P modification protein  24.29 
 
 		 299 aa  59.7  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000225359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1825  SSU ribosomal protein S6P modification protein  24.29 
 
 		 299 aa  59.7  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000123784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2274  SSU ribosomal protein S6P modification protein  24.29 
 
 		 299 aa  59.7  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000086692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2828  alpha-L-glutamate ligases, ribosomal protein S6 modification protein of RimK family protein  26.18 
 
 		 302 aa  59.3  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0234  ribosomal protein S6 modification protein  25.7 
 
 		 301 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000825  ribosomal protein S6 glutaminyl transferase  23.6 
 
 		 301 aa  58.9  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000778733  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2143  alpha-L-glutamate ligase  23.89 
 
 		 301 aa  58.9  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000119851  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3661  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  25.44 
 
 		 301 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2369  RimK domain protein ATP-grasp  25.57 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.438886 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2496  alpha-L-glutamate ligase  24.35 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000126065  normal  0.0109329 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1105  S6 modification enzyme RimK  26.15 
 
 		 262 aa  58.2  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.352091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1967  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  24.35 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000256532  hitchhiker  0.00043621 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2418  alpha-L-glutamate ligases, RimK family protein  26.02 
 
 		 298 aa  58.2  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1299  ribosomal protein S6 modification protein  23.61 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.186898  normal  0.0117357 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2391  alpha-L-glutamate ligase  24.35 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000134298  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2380  alpha-L-glutamate ligase  24.35 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000191941  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5981  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  25.94 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1690  ribosomal protein S6 modification protein  24.8 
 
 		 303 aa  57.4  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1643  alpha-L-glutamate ligase  26.91 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0124301 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3327  alpha-L-glutamate ligase  25.66 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2266  SSU ribosomal protein S6P modification protein  25.2 
 
 		 305 aa  57  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0449  S6 modification enzyme RimK  24.54 
 
 		 301 aa  57  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0686  SSU ribosomal protein S6P modification protein  23.69 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000000259145  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0173  S6 modification enzyme RimK  25.51 
 
 		 301 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1276  SSU ribosomal protein S6P modification protein  24.9 
 
 		 310 aa  56.2  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0244  alpha-L-glutamate ligase  22.53 
 
 		 302 aa  56.2  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.12128  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1956  ribosomal protein S6 modification protein  24.4 
 
 		 303 aa  56.2  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52107  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0291  lysine biosynthesis enzyme LysX  26.67 
 
 		 302 aa  56.2  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.42871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0259  lysine biosynthesis enzyme LysX  26.12 
 
 		 283 aa  55.8  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.661273 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0444  lysine biosynthesis enzyme LysX  28.1 
 
 		 272 aa  55.1  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0001654  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1766  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  22.4 
 
 		 301 aa  55.1  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.918853 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0168  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  26.83 
 
 		 283 aa  55.1  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000151287  normal  0.111818 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1212  alpha-L-glutamate ligases, RimK family protein  24.9 
 
 		 301 aa  54.7  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0387338  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0545  alpha-L-glutamate ligase  25.22 
 
 		 301 aa  54.7  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2061  S6 modification enzyme RimK  23.55 
 
 		 301 aa  54.3  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000579629  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>