153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5732 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5732  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 
300 aa  587  1e-167  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.673881  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3786  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.24 
 
 
269 aa  85.1  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2528  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.51 
 
 
312 aa  79.7  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.772852  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2988  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.42 
 
 
282 aa  78.2  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.685317  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1188  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.44 
 
 
837 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3358  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.14 
 
 
298 aa  75.1  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5408  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.58 
 
 
634 aa  68.9  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.521256  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0900  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.93 
 
 
257 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2527  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25 
 
 
576 aa  68.2  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0209  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.89 
 
 
283 aa  68.2  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6275  Metal-dependent hydrolase-like protein  29.74 
 
 
617 aa  67.4  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0433121  decreased coverage  0.00812081 
 
 
-
 
NC_002936  DET0108  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  29.2 
 
 
591 aa  66.6  0.0000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0791  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.69 
 
 
808 aa  66.2  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21370  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.22 
 
 
281 aa  65.9  0.0000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2394  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.73 
 
 
243 aa  65.5  0.0000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4976  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.46 
 
 
266 aa  64.7  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000483065 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3513  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.33 
 
 
236 aa  64.7  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00703913  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_118  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  28.4 
 
 
639 aa  63.9  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4298  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.96 
 
 
259 aa  62.8  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4045  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.44 
 
 
242 aa  62.4  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0260  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.8 
 
 
639 aa  61.2  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.61014  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2113  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.25 
 
 
284 aa  59.7  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0578211  normal  0.225636 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0905  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.8 
 
 
278 aa  59.3  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965687  normal  0.246268 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2702  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30 
 
 
265 aa  59.3  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1422  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.54 
 
 
235 aa  58.9  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.329688 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0383  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.2 
 
 
266 aa  57.4  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4845  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.21 
 
 
283 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346949  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5127  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.93 
 
 
242 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.0539363 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1473  hypothetical protein  31.39 
 
 
273 aa  56.6  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.257293  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5100  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 
284 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0779207 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.24 
 
 
328 aa  55.8  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0340  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  32.39 
 
 
291 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0267  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.55 
 
 
291 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0606  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.87 
 
 
250 aa  55.1  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.374942  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4697  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.19 
 
 
328 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2380  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.5 
 
 
251 aa  55.5  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.835809 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3278  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.92 
 
 
261 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1144  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.5 
 
 
287 aa  55.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.703964  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2329  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.85 
 
 
248 aa  54.7  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000636938  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3504  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  26.22 
 
 
237 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.40759  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3007  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.07 
 
 
279 aa  52.8  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24010  metal-dependent hydrolase  27.42 
 
 
286 aa  52.4  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.078651 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3204  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.17 
 
 
259 aa  52.4  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1343  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.13 
 
 
279 aa  52.4  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591358  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2515  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.81 
 
 
256 aa  52  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.764021  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3724  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.07 
 
 
279 aa  52.4  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.236792  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24830  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.67 
 
 
276 aa  51.2  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.669671  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0051  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.1 
 
 
292 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.171004 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0048  hypothetical protein  30.45 
 
 
256 aa  51.2  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00965819  normal  0.1661 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1281  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.88 
 
 
253 aa  51.6  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2093  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.27 
 
 
284 aa  50.8  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0239  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.9 
 
 
258 aa  50.8  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.577245  normal  0.289646 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2849  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.23 
 
 
276 aa  50.4  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.942011  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2562  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  28.35 
 
 
253 aa  50.4  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0938  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  28.35 
 
 
253 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2852  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.35 
 
 
253 aa  50.1  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.350943  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2393  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.64 
 
 
277 aa  50.1  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5493  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.63 
 
 
278 aa  50.1  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306278  hitchhiker  0.00234729 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0813  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  28.35 
 
 
253 aa  50.1  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0192282  normal  0.85473 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0904  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.64 
 
 
289 aa  50.1  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  0.240953 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1052  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.52 
 
 
287 aa  50.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00191941  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5423  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.82 
 
 
242 aa  49.7  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  hitchhiker  0.0062358 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4438  exodeoxyribonuclease III  25 
 
 
263 aa  49.7  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0143  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.41 
 
 
284 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0854  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  28.35 
 
 
253 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0147  metal-dependent hydrolase  26.9 
 
 
673 aa  48.5  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2639  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28 
 
 
288 aa  48.5  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2363  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.47 
 
 
255 aa  48.5  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2758  exodeoxyribonuclease III  24.16 
 
 
276 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139698  normal  0.30939 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2325  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.85 
 
 
231 aa  48.9  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.415298 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72430  hypothetical protein  32.5 
 
 
292 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0806  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.76 
 
 
255 aa  48.9  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.636912  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0877  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.76 
 
 
255 aa  48.9  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0159  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.14 
 
 
290 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.171713  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00757  predicted DNase  27.95 
 
 
253 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5036  aminoacyl-tRNA hydrolase  28.68 
 
 
265 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0185176 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.38 
 
 
263 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42531  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6501  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.38 
 
 
263 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.126817  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0844  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  27.95 
 
 
253 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2853  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.95 
 
 
253 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00512011 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6090  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.17 
 
 
258 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18128  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00774  hypothetical protein  27.95 
 
 
253 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2424  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.12 
 
 
253 aa  47.4  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.123297  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2670  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.9 
 
 
260 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246537  normal  0.0515035 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3018  exodeoxyribonuclease III Xth  23.72 
 
 
261 aa  47  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176682  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2622  exodeoxyribonuclease III Xth  28.73 
 
 
254 aa  47.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.128111  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0445  endonuclease / exonuclease / phosphatase family protein  23.56 
 
 
251 aa  47  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.625659 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0381  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.17 
 
 
251 aa  47  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.853038  normal  0.111284 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4022  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.44 
 
 
271 aa  47  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01980  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  31.07 
 
 
286 aa  47  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.496471  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0808  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.31 
 
 
257 aa  47  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.555445  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0128  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.48 
 
 
284 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.503703  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5588  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.75 
 
 
269 aa  46.6  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15644  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0990  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.02 
 
 
255 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0145  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.48 
 
 
284 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.883526  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1637  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.77 
 
 
350 aa  46.6  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2679  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.16 
 
 
304 aa  46.6  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0607  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.35 
 
 
253 aa  46.6  0.0005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0469  hypothetical protein  28.32 
 
 
248 aa  46.2  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.744864  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3767  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.73 
 
 
252 aa  46.2  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0769557 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>