131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5721 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5721  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  100 
 
 
810 aa  1616    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5337  regulator of chromosome condensation RCC1  40.3 
 
 
618 aa  323  9.999999999999999e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0264  regulator of chromosome condensation RCC1  40.06 
 
 
792 aa  211  6e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0100345  normal  0.0222912 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0670  regulator of chromosome condensation RCC1  40.47 
 
 
778 aa  208  3e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.0000346041 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0668  regulator of chromosome condensation RCC1  39.53 
 
 
784 aa  206  2e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000606887  hitchhiker  0.00000503803 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0669  regulator of chromosome condensation RCC1  37.77 
 
 
776 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000957147  hitchhiker  0.000042388 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0421  regulator of chromosome condensation, RCC1  37.15 
 
 
837 aa  192  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0560026 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4499  regulator of chromosome condensation, RCC1  39.76 
 
 
553 aa  167  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243819  hitchhiker  0.00250831 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0960  BNR repeat-containing protein  36.25 
 
 
449 aa  164  9e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0736661  normal  0.223675 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_89498  predicted protein  38.05 
 
 
376 aa  159  2e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.034274  normal  0.0389123 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2688  regulator of chromosome condensation, RCC1  36.92 
 
 
818 aa  158  3e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0258848 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2687  regulator of chromosome condensation, RCC1  35.71 
 
 
821 aa  156  1e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360144 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1101  alpha-tubulin suppressor  32 
 
 
911 aa  143  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  32.5 
 
 
1679 aa  138  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2802  regulator of chromosome condensation RCC1  33.15 
 
 
389 aa  138  4e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1055  regulator of chromosome condensation RCC1  34.69 
 
 
717 aa  138  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1101  regulator of chromosome condensation RCC1  30.32 
 
 
1187 aa  137  7.000000000000001e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0956  regulator of chromosome condensation RCC1  32.14 
 
 
743 aa  137  7.000000000000001e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.454345  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2304  alpha-tubulin suppressor  30.35 
 
 
461 aa  136  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.876578  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1979  regulator of chromosome condensation, RCC1  34.65 
 
 
554 aa  134  6.999999999999999e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158856  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1051  regulator of chromosome condensation RCC1  29.96 
 
 
714 aa  134  9e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0799  alpha-tubulin suppressor  32.9 
 
 
461 aa  133  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.16068  decreased coverage  0.00221798 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  28.36 
 
 
1919 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6709  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  29.14 
 
 
535 aa  131  5.0000000000000004e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93763 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1395  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  33.05 
 
 
941 aa  130  8.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0169  regulator of chromosome condensation RCC1  31.61 
 
 
1207 aa  130  9.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.26578 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1179  cell wall anchor domain-containing protein  32.85 
 
 
558 aa  129  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2569  regulator of chromosome condensation RCC1  31.48 
 
 
363 aa  128  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00852612  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2565  regulator of chromosome condensation RCC1  31.48 
 
 
363 aa  128  4.0000000000000003e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0283551  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0168  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  30.18 
 
 
817 aa  128  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.638374 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  31.43 
 
 
1848 aa  127  6e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0430  alpha-tubulin suppressor  32.33 
 
 
807 aa  127  7e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2892  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  30.65 
 
 
835 aa  125  4e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  30.69 
 
 
2082 aa  124  5e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  28.03 
 
 
469 aa  124  7e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2677  regulator of chromosome condensation RCC1  32.75 
 
 
544 aa  123  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0824266  normal  0.249754 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2113  Repeat of unknown function XGLTT  28.16 
 
 
462 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1176  regulator of chromosome condensation, RCC1  34.41 
 
 
567 aa  122  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.308067  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0742  copper amine oxidase domain-containing protein  29.28 
 
 
547 aa  122  3e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1863  regulator of chromosome condensation RCC1  31.7 
 
 
593 aa  120  7e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.59713  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1102  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  29.38 
 
 
787 aa  120  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2978  regulator of chromosome condensation, RCC1  34.7 
 
 
561 aa  120  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.310394  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3078  cysteine-rich repeat protein  33.96 
 
 
602 aa  119  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  32.31 
 
 
1129 aa  118  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.53 
 
 
706 aa  117  6e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2349  cell wall anchor domain-containing protein  34.63 
 
 
551 aa  117  6.9999999999999995e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.0247307 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0983  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  31.48 
 
 
1147 aa  117  6.9999999999999995e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.657675  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1045  BNR repeat-containing protein  32.78 
 
 
454 aa  116  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.331835  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4451  serine/threonine protein kinase  31.27 
 
 
745 aa  116  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1538  regulator of chromosome condensation RCC1  35.03 
 
 
560 aa  115  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3514  BNR repeat-containing protein  29.81 
 
 
396 aa  115  4.0000000000000004e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1729  regulator of chromosome condensation RCC1  40.54 
 
 
681 aa  114  9e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.378302 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4027  regulator of chromosome condensation RCC1  33.12 
 
 
638 aa  114  9e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0161  alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing proteins-like protein  28.73 
 
 
726 aa  113  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1193  cell wall anchor domain-containing protein  31.38 
 
 
577 aa  114  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770644  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1792  regulator of chromosome condensation, RCC1  30.17 
 
 
417 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1539  regulator of chromosome condensation RCC1  35.66 
 
 
569 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781451  hitchhiker  0.00406058 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1715  regulator of chromosome condensation, RCC1  30.99 
 
 
563 aa  111  5e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1072  regulator of chromosome condensation RCC1  34.22 
 
 
553 aa  111  6e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0600576  decreased coverage  0.000288682 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2567  regulator of chromosome condensation, RCC1  31.61 
 
 
555 aa  110  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4565  hypothetical protein  30.54 
 
 
477 aa  109  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2043  XGLTT repeat protein  31.69 
 
 
437 aa  109  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2977  regulator of chromosome condensation RCC1  35.12 
 
 
579 aa  109  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483456  hitchhiker  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4383  regulator of chromosome condensation RCC1  34.74 
 
 
546 aa  108  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.843021  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4142  regulator of chromosome condensation RCC1  29.71 
 
 
575 aa  108  5e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2272  putative lipoprotein  31.41 
 
 
403 aa  108  6e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1585  regulator of chromosome condensation, RCC1  34.12 
 
 
570 aa  107  6e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.179205  normal  0.90186 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1923  regulator of chromosome condensation, RCC1  34.01 
 
 
692 aa  105  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.611736  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4382  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.33 
 
 
556 aa  105  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2856  BNR repeat-containing protein  30.58 
 
 
447 aa  104  7e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4652  regulator of chromosome condensation, RCC1  30.37 
 
 
555 aa  103  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197342  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4380  regulator of chromosome condensation RCC1  31.1 
 
 
554 aa  101  6e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000261598 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1817  hypothetical protein  28.78 
 
 
486 aa  100  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3864  hypothetical protein  38.07 
 
 
477 aa  100  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.571243  normal  0.0690788 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1007  regulator of chromosome condensation RCC1  30.32 
 
 
443 aa  97.1  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1394  immunoglobulin I-set domain-containing protein  29.78 
 
 
1126 aa  96.7  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6387  hypothetical protein  36.41 
 
 
473 aa  95.9  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.606355  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1086  cell wall anchor domain-containing protein  32.8 
 
 
566 aa  95.5  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.628609  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1593  regulator of chromosome condensation RCC1  31.99 
 
 
558 aa  93.6  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0107683  decreased coverage  0.00113997 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1010  immunoglobulin-like  27.16 
 
 
597 aa  91.7  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06370  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  26.94 
 
 
737 aa  90.5  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.688875  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2961  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  34.83 
 
 
326 aa  89.7  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.462703  normal  0.0513542 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5563  hypothetical protein  31.53 
 
 
485 aa  90.1  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06510  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  28.53 
 
 
900 aa  88.6  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.10191  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_3182  predicted protein  28.57 
 
 
341 aa  88.2  5e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28587  predicted protein  29.02 
 
 
332 aa  83.2  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  29.89 
 
 
1222 aa  81.3  0.00000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2682  hypothetical protein  27.96 
 
 
429 aa  79.3  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.180189  normal  0.57701 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1358  hypothetical protein  23.23 
 
 
375 aa  78.2  0.0000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5600  hypothetical protein  33.9 
 
 
287 aa  76.6  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.88475 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_2338  predicted protein  30.45 
 
 
399 aa  75.9  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.244715  decreased coverage  0.000248727 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3372  regulator of chromosome condensation RCC1  34.78 
 
 
375 aa  73.9  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.582545  normal  0.977781 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0016  regulator of chromosome condensation, RCC1  40.17 
 
 
209 aa  73.2  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0650172 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6425  hypothetical protein  31.84 
 
 
429 aa  73.2  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49595  predicted protein  29.23 
 
 
643 aa  72.4  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.107678  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3566  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  24.86 
 
 
728 aa  72.4  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000426417  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36955  predicted protein  27.49 
 
 
418 aa  72  0.00000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000048809  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  27.87 
 
 
14609 aa  69.7  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_45032  predicted protein  25.7 
 
 
1312 aa  69.7  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39304  predicted protein  27.95 
 
 
394 aa  69.7  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.635663  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>