61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5670 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5670  hypothetical protein  100 
 
 		 338 aa  648    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0729978 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0055  putative mRNA 3'-end processing factor  29.97 
 
 		 330 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0072  putative mRNA 3'-end processing factor  29.97 
 
 		 330 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0057  putative mRNA 3'-end processing factor  28.92 
 
 		 330 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.251824 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0060  putative mRNA 3'-end processing factor  29.38 
 
 		 330 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3148  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  26.88 
 
 		 1017 aa  98.6  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.331414  normal  0.459978 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1042  exonuclease  26.48 
 
 		 328 aa  72  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.251284  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02275  hypothetical protein  21.12 
 
 		 347 aa  67.4  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0150  exonuclease of the beta-lactamase fold involved in RNA processing-like protein  25.53 
 
 		 355 aa  63.5  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1883  putative mRNA 3-end processing factor  26.56 
 
 		 327 aa  62.8  0.000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.115808  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4134  hypothetical protein  27.27 
 
 		 348 aa  62  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2959  mRNA 3'-end processing factor  28.43 
 
 		 332 aa  61.6  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.624115  hitchhiker  0.0000489273 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2561  putative mRNA 3-end processing factor  23.24 
 
 		 332 aa  61.2  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3872  hypothetical protein  27.51 
 
 		 348 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.187912 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0973  putative mRNA 3-end processing factor  24.62 
 
 		 314 aa  61.2  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.289039 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1754  RNA procession exonuclease-like protein  23.2 
 
 		 351 aa  60.8  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0305  putative mRNA 3-end processing factor  27.09 
 
 		 366 aa  60.1  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1313  beta-lactamase domain-containing protein  28.15 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.143027  normal  0.259963 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0310  putative mRNA 3-end processing factor  26.76 
 
 		 366 aa  60.1  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.169646 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1043  putative mRNA 3-end processing factor  27.21 
 
 		 319 aa  60.5  0.00000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0008566 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4860  putative mRNA 3-end processing factor  26.35 
 
 		 375 aa  59.7  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3043  putative mRNA 3-end processing factor  26.67 
 
 		 346 aa  59.7  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0285628  normal  0.582199 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2196  RNA procession exonuclease-like protein  28.7 
 
 		 335 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.260801  hitchhiker  0.00381998 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2916  mRNA 3'-end processing factor  24.6 
 
 		 362 aa  56.2  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0794  putative mRNA 3-end processing factor  28.03 
 
 		 349 aa  56.2  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.682803 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3896  hypothetical protein  27.55 
 
 		 368 aa  55.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.170406  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1135  RNA procession exonuclease-like protein  28.39 
 
 		 338 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0374  putative mRNA 3-end processing factor  25.4 
 
 		 371 aa  53.5  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3978  RNA procession exonuclease-like protein  25.61 
 
 		 371 aa  53.1  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.107304  normal  0.652273 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1460  exonuclease involved in mRNA processing  26.88 
 
 		 328 aa  53.1  0.000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.562175  normal  0.133127 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3335  RNA procession exonuclease  24.39 
 
 		 383 aa  52.8  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0067  putative mRNA 3-end processing factor  30 
 
 		 357 aa  52.4  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6856  hypothetical protein  23.81 
 
 		 340 aa  52.4  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.166328 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1146  RNA procession exonuclease-like protein  28.17 
 
 		 338 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.39024 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0289  putative mRNA 3-end processing factor  28.97 
 
 		 337 aa  52.4  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.640549 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0871  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase  27.3 
 
 		 348 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0130781  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1582  RNA procession exonuclease-like protein  24.04 
 
 		 332 aa  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0552  hypothetical protein  26.5 
 
 		 347 aa  51.2  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1416  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 433 aa  51.2  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.449675  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1106  RNA processing exonuclease  27.86 
 
 		 338 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.599734 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4616  putative mRNA 3-end processing factor  27.22 
 
 		 351 aa  50.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3692  putative mRNA 3-end processing factor  25.32 
 
 		 351 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0629  putative mRNA 3-end processing factor  25.47 
 
 		 365 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.88354  decreased coverage  0.00579405 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01738  mRNA 3'-end processing factor  27.41 
 
 		 340 aa  49.7  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0750  putative mRNA 3-end processing factor  26.38 
 
 		 356 aa  49.3  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3431  putative mRNA 3-end processing factor  24.78 
 
 		 352 aa  49.3  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.194998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2665  putative mRNA 3-end processing factor  25.56 
 
 		 335 aa  49.3  0.00009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.14848 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1072  putative mRNA 3-end processing factor  23.68 
 
 		 344 aa  48.5  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0686869 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3523  RNA procession exonuclease  21.36 
 
 		 349 aa  48.1  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1212  hypothetical protein  26.25 
 
 		 344 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.766488 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0260  putative mRNA 3-end processing factor  27.25 
 
 		 344 aa  47.8  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00946134 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4306  RNA procession exonuclease-like protein  26.84 
 
 		 338 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0461  hypothetical protein  26.81 
 
 		 390 aa  47  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3560  putative mRNA 3-end processing factor  24.7 
 
 		 352 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.146642  normal  0.26456 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0480  beta-lactamase domain-containing protein  24.76 
 
 		 433 aa  47  0.0005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104405  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0621  beta-lactamase domain-containing protein  23.81 
 
 		 317 aa  47  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3236  putative mRNA 3-end processing factor  24.7 
 
 		 352 aa  45.8  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.193513 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1428  beta-lactamase domain-containing protein  24.26 
 
 		 433 aa  45.4  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.1615  normal  0.318951 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0799  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase  26.33 
 
 		 348 aa  43.5  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187593  normal  0.0112138 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1540  putative mRNA 3-end processing factor  24.21 
 
 		 345 aa  42.7  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1206  beta-lactamase domain-containing protein  24.26 
 
 		 433 aa  42.7  0.008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>