More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5623 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5623  WD40 domain protein beta Propeller  100 
 
 		 956 aa  1919    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.101899 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1737  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  34.3 
 
 		 1021 aa  427  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.349792  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0966  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  29.11 
 
 		 976 aa  343  1e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000198927  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2492  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  28.36 
 
 		 970 aa  339  1.9999999999999998e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2102  WD40 domain protein beta Propeller  37.35 
 
 		 1078 aa  330  6e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2193  WD40 domain protein beta Propeller  36.47 
 
 		 1077 aa  322  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2060  WD40 domain-containing protein  36.65 
 
 		 1206 aa  300  9e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.456517  normal  0.995925 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08230  WD40 domain protein beta Propeller  26.96 
 
 		 918 aa  286  1.0000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0325  WD40 domain-containing protein beta Propeller  27.77 
 
 		 901 aa  257  8e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2423  WD40 domain protein beta Propeller  28.72 
 
 		 881 aa  211  5e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1741  hypothetical protein  24.54 
 
 		 977 aa  140  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0140  WD40 domain protein beta Propeller  26.61 
 
 		 970 aa  139  3.0000000000000003e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0824  hypothetical protein  23.71 
 
 		 814 aa  109  3e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.463366  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0629  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  26.71 
 
 		 1028 aa  104  7e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1171  WD40 domain protein beta Propeller  25.47 
 
 		 947 aa  96.3  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2270  hypothetical protein  25.72 
 
 		 1010 aa  93.2  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.122656 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1910  TolB protein, putative  28.41 
 
 		 440 aa  89  4e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0016  hypothetical protein  22.31 
 
 		 979 aa  87.4  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0566  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  34.91 
 
 		 428 aa  85.5  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2405  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  25.28 
 
 		 1078 aa  84  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.666802  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0028  hypothetical protein  22.73 
 
 		 914 aa  83.6  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1914  WD40 domain protein beta Propeller  21.95 
 
 		 1060 aa  82.4  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.657093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1730  WD40 domain protein beta Propeller  40.19 
 
 		 982 aa  82.4  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.16258  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2939  translocation protein TolB  31.07 
 
 		 451 aa  81.6  0.00000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00432408  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  34.57 
 
 		 1005 aa  80.9  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  36 
 
 		 1059 aa  80.1  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0015  amidohydrolase  29.53 
 
 		 1062 aa  80.1  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000711997 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0015  amidohydrolase  29.53 
 
 		 1062 aa  80.1  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0180602 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3920  translocation protein TolB  28.37 
 
 		 430 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0501302 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6241  hypothetical protein  22.18 
 
 		 919 aa  79.7  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.950662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0759  translocation protein TolB  28.72 
 
 		 430 aa  80.1  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397862  normal  0.413932 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0016  WD40 domain-containing protein  29.53 
 
 		 445 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0011  amidohydrolase  29.53 
 
 		 1062 aa  80.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0859  WD40 domain-containing protein  28.07 
 
 		 442 aa  79  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.318178  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4536  translocation protein TolB  28.83 
 
 		 432 aa  78.6  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0009  amidohydrolase  29.02 
 
 		 1062 aa  78.6  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0898  TolB-like  31.46 
 
 		 432 aa  78.2  0.0000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336659  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0458  amidohydrolase  30.05 
 
 		 1138 aa  77.8  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.455594 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0303  translocation protein TolB  31.61 
 
 		 403 aa  77.4  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.307961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0011  amidohydrolase  29.02 
 
 		 1065 aa  77.8  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000114616  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2455  translocation protein TolB  31.43 
 
 		 430 aa  77.4  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328002  normal  0.860267 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0011  amidohydrolase  28.63 
 
 		 1062 aa  77  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000193716 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51720  translocation protein TolB  28.83 
 
 		 432 aa  77.4  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109745  hitchhiker  0.0000339249 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0017  amidohydrolase  29.53 
 
 		 1049 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  30.21 
 
 		 436 aa  76.6  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003913  TolB protein precursor  27.01 
 
 		 442 aa  76.6  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.26371  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2161  WD40 domain protein beta Propeller  28.26 
 
 		 440 aa  75.9  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000041437  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02684  translocation protein TolB  26.11 
 
 		 451 aa  75.9  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0273488  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1373  translocation protein TolB  30.46 
 
 		 463 aa  75.9  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0019  amidohydrolase  28.19 
 
 		 1062 aa  75.5  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000934915 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0067  tol-pal system beta propeller repeat protein TolB  31.69 
 
 		 422 aa  75.5  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.518188  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0068  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  31.69 
 
 		 422 aa  75.5  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3256  translocation protein TolB  29.95 
 
 		 463 aa  75.5  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0827  translocation protein TolB  29.95 
 
 		 463 aa  75.5  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2081  translocation protein TolB  29.95 
 
 		 433 aa  75.1  0.000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2661  translocation protein TolB  29.95 
 
 		 431 aa  75.1  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.622452  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3203  translocation protein TolB  29.95 
 
 		 430 aa  75.1  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95129  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3241  translocation protein TolB  29.95 
 
 		 430 aa  75.1  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.786429  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0011  amidohydrolase  29.07 
 
 		 1062 aa  75.1  0.000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0957331 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1949  translocation protein TolB  29.95 
 
 		 433 aa  75.1  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2092  translocation protein TolB  26.6 
 
 		 425 aa  74.7  0.000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626129  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0009  amidohydrolase  27.98 
 
 		 1060 aa  74.7  0.000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1277  translocation protein TolB  30.43 
 
 		 432 aa  74.7  0.000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154906  normal  0.476044 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0013  amidohydrolase  26.87 
 
 		 1067 aa  73.9  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0010  amidohydrolase  27.98 
 
 		 1066 aa  73.9  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  27.71 
 
 		 426 aa  73.9  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  34.02 
 
 		 432 aa  73.6  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3972  tolB protein  28.98 
 
 		 433 aa  73.6  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0956227  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1415  translocation protein TolB  28.98 
 
 		 433 aa  73.6  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00100672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01610  translocation protein TolB  26.44 
 
 		 442 aa  73.6  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0727  TolB domain-containing protein  29.76 
 
 		 437 aa  73.2  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.162759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0747  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  28.68 
 
 		 444 aa  72.4  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000257607  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1429  translocation protein TolB  27.59 
 
 		 450 aa  72.4  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000134537  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0015  amidohydrolase  27.46 
 
 		 1069 aa  72  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661642 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  36.18 
 
 		 446 aa  72  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4196  translocation protein TolB  29.55 
 
 		 423 aa  72  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  29.11 
 
 		 435 aa  71.6  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3993  translocation protein TolB  29.55 
 
 		 423 aa  71.6  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0018  amidohydrolase  27.46 
 
 		 1081 aa  71.6  0.00000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000272228 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2050  translocation protein TolB  28.03 
 
 		 429 aa  71.6  0.00000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1222  translocation protein TolB  29.55 
 
 		 433 aa  71.2  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1251  translocation protein TolB  29.55 
 
 		 423 aa  71.2  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0936092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  29.35 
 
 		 427 aa  70.9  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1394  translocation protein TolB  26.36 
 
 		 442 aa  70.9  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000203609  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4427  translocation protein TolB  47.89 
 
 		 441 aa  70.9  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  33.53 
 
 		 434 aa  70.9  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2717  translocation protein TolB  31.68 
 
 		 450 aa  69.7  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.599754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  28.06 
 
 		 407 aa  69.7  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0028  amidohydrolase  26.94 
 
 		 1062 aa  70.5  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.847177  hitchhiker  0.00656795 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1527  translocation protein TolB  26.34 
 
 		 441 aa  69.3  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000832022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1462  translocation protein TolB  24.07 
 
 		 442 aa  69.3  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000134108  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0262  translocation protein TolB  27.66 
 
 		 434 aa  68.9  0.0000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000248265  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1785  translocation protein TolB  26.88 
 
 		 442 aa  68.6  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000978843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4402  translocation protein TolB  27.84 
 
 		 414 aa  68.6  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2538  translocation protein TolB  26.88 
 
 		 442 aa  68.6  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000186682  hitchhiker  0.0000162747 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1746  translocation protein TolB  26.88 
 
 		 442 aa  68.9  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000149314  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1742  translocation protein TolB  26.88 
 
 		 442 aa  68.6  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000714613  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3512  translocation protein TolB  29.38 
 
 		 450 aa  68.6  0.0000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6881  translocation protein TolB  28.75 
 
 		 462 aa  68.2  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  34.52 
 
 		 434 aa  68.2  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>