More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5556 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5556  amidophosphoribosyltransferase  100 
 
 
511 aa  1028  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.564803  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1636  amidophosphoribosyltransferase  59.48 
 
 
467 aa  571  1e-162  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1939  amidophosphoribosyltransferase  58.41 
 
 
466 aa  566  1e-160  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2329  amidophosphoribosyltransferase  57.74 
 
 
477 aa  562  1e-159  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.64237  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2702  amidophosphoribosyltransferase  58.71 
 
 
475 aa  564  1e-159  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1891  amidophosphoribosyltransferase  57.96 
 
 
477 aa  563  1e-159  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1326  amidophosphoribosyltransferase  60.26 
 
 
468 aa  564  1e-159  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2068  amidophosphoribosyltransferase  55.82 
 
 
474 aa  561  1e-158  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.286768  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1153  amidophosphoribosyltransferase  58.28 
 
 
474 aa  551  1e-155  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4354  amidophosphoribosyltransferase  60.68 
 
 
484 aa  541  1e-153  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.463043 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4361  amidophosphoribosyltransferase  58.95 
 
 
485 aa  530  1e-149  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4206  amidophosphoribosyltransferase  58.82 
 
 
485 aa  530  1e-149  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.975393  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4338  amidophosphoribosyltransferase  59.16 
 
 
485 aa  531  1e-149  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0265  amidophosphoribosyltransferase  56.32 
 
 
476 aa  529  1e-149  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2064  amidophosphoribosyltransferase  55.91 
 
 
475 aa  508  1e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1136  amidophosphoribosyltransferase  54.09 
 
 
470 aa  508  1e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1722  amidophosphoribosyltransferase  55.91 
 
 
481 aa  508  1e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.56305  normal  0.196104 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0321  amidophosphoribosyltransferase  52.99 
 
 
461 aa  505  1e-142  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4300  amidophosphoribosyltransferase  55.48 
 
 
491 aa  508  1e-142  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.182299  normal  0.0484415 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4407  amidophosphoribosyltransferase  55.7 
 
 
491 aa  507  1e-142  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.972374 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3932  amidophosphoribosyltransferase  55.48 
 
 
491 aa  508  1e-142  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.961822  normal  0.0894126 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0260  amidophosphoribosyltransferase  53.1 
 
 
470 aa  504  1e-141  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2807  amidophosphoribosyltransferase  54.1 
 
 
462 aa  499  1e-140  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2599  amidophosphoribosyltransferase  55.26 
 
 
499 aa  499  1e-140  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0391838  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2307  amidophosphoribosyltransferase  53.66 
 
 
467 aa  494  1e-138  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4621  amidophosphoribosyltransferase  52.74 
 
 
482 aa  493  1e-138  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.059877  normal  0.48412 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0578  amidophosphoribosyltransferase  52.63 
 
 
486 aa  493  1e-138  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4629  amidophosphoribosyltransferase  54.27 
 
 
500 aa  494  1e-138  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.691036  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2878  amidophosphoribosyltransferase  52.48 
 
 
517 aa  491  1e-137  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.116336 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3894  amidophosphoribosyltransferase  53.73 
 
 
491 aa  489  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.065306 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3212  amidophosphoribosyltransferase  52.11 
 
 
463 aa  490  1e-137  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.903412  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0405  amidophosphoribosyltransferase  52.77 
 
 
493 aa  489  1e-137  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0327  amidophosphoribosyltransferase  49.89 
 
 
471 aa  485  1e-136  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1541  amidophosphoribosyltransferase  51.75 
 
 
502 aa  486  1e-136  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267372  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0282  amidophosphoribosyltransferase  49.89 
 
 
471 aa  485  1e-136  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0295  amidophosphoribosyltransferase  49.89 
 
 
471 aa  485  1e-136  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.312701  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0334  amidophosphoribosyltransferase  51.29 
 
 
462 aa  488  1e-136  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.708549  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0267  amidophosphoribosyltransferase  49.89 
 
 
471 aa  485  1e-136  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0270  amidophosphoribosyltransferase  49.89 
 
 
471 aa  485  1e-136  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0274  amidophosphoribosyltransferase  50.11 
 
 
471 aa  485  1e-136  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0368  amidophosphoribosyltransferase  49.89 
 
 
471 aa  484  1e-135  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0324  amidophosphoribosyltransferase  49.89 
 
 
471 aa  484  1e-135  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4979  amidophosphoribosyltransferase  49.68 
 
 
471 aa  483  1e-135  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0983  amidophosphoribosyltransferase  52.41 
 
 
490 aa  482  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.592161  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0276  amidophosphoribosyltransferase  49.68 
 
 
471 aa  482  1e-135  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0341  amidophosphoribosyltransferase  49.68 
 
 
471 aa  482  1e-135  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1249  amidophosphoribosyltransferase  48.9 
 
 
488 aa  479  1e-134  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.917797  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1062  amidophosphoribosyltransferase  52.51 
 
 
486 aa  480  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.739126  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3487  amidophosphoribosyltransferase  53.17 
 
 
503 aa  481  1e-134  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.746658  normal  0.621078 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1102  amidophosphoribosyltransferase  50.54 
 
 
466 aa  480  1e-134  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0404  amidophosphoribosyltransferase  51.4 
 
 
488 aa  478  1e-133  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305555  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1117  amidophosphoribosyltransferase  52.39 
 
 
487 aa  476  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.981489  normal  0.353735 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2400  amidophosphoribosyltransferase  52.85 
 
 
514 aa  476  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.453817  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2454  amidophosphoribosyltransferase  52.17 
 
 
487 aa  474  1e-132  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1707  amidophosphoribosyltransferase  51.63 
 
 
497 aa  473  1e-132  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0317953  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1871  amidophosphoribosyltransferase  49.22 
 
 
451 aa  469  1e-131  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.10696  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0007  amidophosphoribosyltransferase  51.11 
 
 
487 aa  471  1e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30048  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22120  amidophosphoribosyltransferase  49.15 
 
 
480 aa  467  1e-130  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.357347  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2132  amidophosphoribosyltransferase  51.52 
 
 
508 aa  466  1e-130  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.864953  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2997  amidophosphoribosyltransferase  51.06 
 
 
514 aa  466  1e-130  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.807987  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2365  amidophosphoribosyltransferase  49.78 
 
 
474 aa  464  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3501  amidophosphoribosyltransferase  51.3 
 
 
509 aa  464  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3939  amidophosphoribosyltransferase  52.06 
 
 
499 aa  463  1e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1632  amidophosphoribosyltransferase  50.77 
 
 
469 aa  463  1e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2047  amidophosphoribosyltransferase  53.64 
 
 
465 aa  462  1e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.330153 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1778  hypothetical protein  48.47 
 
 
475 aa  459  1e-128  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  9.29805e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2502  amidophosphoribosyltransferase  51.1 
 
 
500 aa  459  1e-128  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1763  amidophosphoribosyltransferase  50.54 
 
 
496 aa  457  1e-127  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.644721  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1032  amidophosphoribosyltransferase  48.9 
 
 
495 aa  456  1e-127  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1042  amidophosphoribosyltransferase  49.57 
 
 
496 aa  457  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.236184  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2282  amidophosphoribosyltransferase  52.17 
 
 
503 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.235461  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2311  amidophosphoribosyltransferase  51.75 
 
 
501 aa  454  1e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.672659  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0560  amidophosphoribosyltransferase  49.78 
 
 
496 aa  453  1e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.605887  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4217  amidophosphoribosyltransferase  49.78 
 
 
494 aa  452  1e-126  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1448  amidophosphoribosyltransferase  47.4 
 
 
474 aa  455  1e-126  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2184  amidophosphoribosyltransferase  45.85 
 
 
487 aa  453  1e-126  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4178  amidophosphoribosyltransferase  49.78 
 
 
494 aa  452  1e-126  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0731  amidophosphoribosyltransferase  47.19 
 
 
478 aa  455  1e-126  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0122  amidophosphoribosyltransferase  48.34 
 
 
467 aa  451  1e-125  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1499  amidophosphoribosyltransferase  48.68 
 
 
529 aa  449  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.338535  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0727  amidophosphoribosyltransferase  50.22 
 
 
496 aa  451  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1152  amidophosphoribosyltransferase  47.25 
 
 
494 aa  449  1e-125  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0413  amidophosphoribosyltransferase  51.75 
 
 
491 aa  451  1e-125  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.577853 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4318  amidophosphoribosyltransferase  48.03 
 
 
496 aa  450  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1130  amidophosphoribosyltransferase  47.25 
 
 
494 aa  449  1e-125  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34090  amidophosphoribosyltransferase  48.8 
 
 
515 aa  448  1e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.163094 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2352  amidophosphoribosyltransferase  47.75 
 
 
513 aa  446  1e-124  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.10246  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0398  amidophosphoribosyltransferase  50.22 
 
 
480 aa  447  1e-124  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0026  amidophosphoribosyltransferase  46.75 
 
 
484 aa  446  1e-124  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0878  glutamine phosphoribosylpyrophosphate amidotransferase  48.46 
 
 
503 aa  447  1e-124  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.141495  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2109  amidophosphoribosyltransferase  46.75 
 
 
475 aa  446  1e-124  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3699  amidophosphoribosyltransferase  47.84 
 
 
493 aa  447  1e-124  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.549743  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1187  amidophosphoribosyltransferase  48.28 
 
 
496 aa  446  1e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.44974 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3787  amidophosphoribosyltransferase  51.1 
 
 
510 aa  443  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2452  amidophosphoribosyltransferase  50.32 
 
 
514 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.729356 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8991  amidophosphoribosyltransferase  49.89 
 
 
478 aa  441  1e-122  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1196  amidophosphoribosyltransferase  46.62 
 
 
472 aa  439  1e-122  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3089  amidophosphoribosyltransferase  48.37 
 
 
515 aa  439  1e-122  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1618  amidophosphoribosyltransferase  46.58 
 
 
506 aa  441  1e-122  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0051  amidophosphoribosyltransferase  46.75 
 
 
479 aa  439  1e-122  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>