More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5530 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5530  aminotransferase class I and II  100 
 
 
397 aa  812    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3157  aminotransferase  52.45 
 
 
405 aa  400  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2832  aminotransferase class I and II  52.54 
 
 
404 aa  388  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.642914 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2315  aminotransferase  53.1 
 
 
389 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1558  aminotransferase class I and II  53.8 
 
 
389 aa  381  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1633  aminotransferase class I and II  53.1 
 
 
389 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3525  aminotransferase  39.68 
 
 
403 aa  305  1.0000000000000001e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1171  aspartate aminotransferase  34.43 
 
 
396 aa  222  7e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3354  aspartate aminotransferase  35.16 
 
 
396 aa  220  3e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2889  aspartate aminotransferase  36.51 
 
 
394 aa  216  4e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.425013 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0961  aspartate aminotransferase  34.05 
 
 
397 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.173671 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0732  aspartate aminotransferase  36.12 
 
 
397 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1046  aspartate aminotransferase  35.39 
 
 
398 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2600  aspartate aminotransferase  34.35 
 
 
397 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00026488  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2140  aspartate aminotransferase  34.62 
 
 
393 aa  211  1e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3287  aspartate aminotransferase  33.24 
 
 
397 aa  209  8e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0240122  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1888  aspartate aminotransferase  35.5 
 
 
396 aa  209  1e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000042706  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1313  aspartate aminotransferase  33.24 
 
 
397 aa  206  7e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000211162 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2027  aspartate aminotransferase  33.24 
 
 
396 aa  204  3e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277317  hitchhiker  0.0077207 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1061  aspartate aminotransferase  33.06 
 
 
398 aa  202  7e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0613658  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2311  aspartate aminotransferase  31.67 
 
 
398 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000726355  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1103  aspartate aminotransferase  34.24 
 
 
461 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0580  aspartate aminotransferase  32.13 
 
 
397 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3530  aspartate aminotransferase  31.89 
 
 
395 aa  199  6e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00117906  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3303  aspartate aminotransferase  34.46 
 
 
397 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.597513  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01850  aspartate aminotransferase  33.33 
 
 
395 aa  197  2.0000000000000003e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0081  aspartate aminotransferase  32.57 
 
 
395 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0248669  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1965  aspartate aminotransferase  31.67 
 
 
393 aa  195  1e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2089  aspartate aminotransferase  31.71 
 
 
398 aa  192  7e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.12088  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1148  aspartate aminotransferase  31.88 
 
 
395 aa  192  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000148908  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0186  aspartate aminotransferase  33.33 
 
 
393 aa  189  7e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0140573  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2093  aspartate aminotransferase  30.56 
 
 
393 aa  188  1e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0365484  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0565  aspartate aminotransferase  36.18 
 
 
398 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0562  aspartate aminotransferase  36.18 
 
 
398 aa  187  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02010  aspartate aminotransferase  31.87 
 
 
393 aa  183  5.0000000000000004e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.951604 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0108  aspartate aminotransferase  31.25 
 
 
394 aa  182  1e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.301084 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0533  aspartate aminotransferase  35.42 
 
 
400 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.865322  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0522  aspartate aminotransferase  29.14 
 
 
396 aa  177  3e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.138181  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27170  aspartate aminotransferase  32.51 
 
 
393 aa  176  6e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.842798  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1291  aminotransferase class I and II  30.7 
 
 
389 aa  139  7e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.406231  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8484  aminotransferase class I and II  31.87 
 
 
409 aa  135  9e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245208  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  28.97 
 
 
392 aa  133  6e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0617  aminotransferase  30.21 
 
 
394 aa  131  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  28.03 
 
 
389 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0994  aminotransferase  28.87 
 
 
369 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.462278 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6360  aspartate aminotransferase  29.85 
 
 
402 aa  127  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.70732  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0897  aspartate aminotransferase  27.65 
 
 
389 aa  126  8.000000000000001e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0789129  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2127  aspartate aminotransferase  28.06 
 
 
388 aa  125  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1627  aminotransferase, class I and II  30.52 
 
 
393 aa  125  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.703964 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4413  hypothetical protein  33.61 
 
 
383 aa  125  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.94668 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0542  aminotransferase, class I and II  29.61 
 
 
367 aa  124  2e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0515807  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0928  aspartate aminotransferase  28.73 
 
 
392 aa  123  5e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.436477  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2542  aminotransferase, class I and II  32.39 
 
 
399 aa  123  6e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.17642 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0031  putative aminotransferase  31.77 
 
 
384 aa  123  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4435  putative aminotransferase  31.1 
 
 
384 aa  122  8e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2798  aminotransferase class I and II  30.94 
 
 
396 aa  122  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1680  aminotransferase  32.96 
 
 
391 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591573  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0583  aspartate aminotransferase  27.82 
 
 
388 aa  121  1.9999999999999998e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.404967  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1193  aminotransferase class I and II  29.66 
 
 
402 aa  120  3e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0161082  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0852  aminotransferase class I and II  30.9 
 
 
384 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4968  aminotransferase class I and II  31.43 
 
 
404 aa  120  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.121403 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3295  putative aminotransferase  34.44 
 
 
384 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4126  aromatic amino acid aminotransferase  28.95 
 
 
394 aa  120  4.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3018  aminotransferase class I and II  30.75 
 
 
383 aa  120  4.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1888  aminotransferase  26.71 
 
 
370 aa  120  6e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  26.27 
 
 
390 aa  119  9e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1121  aminotransferase class I and II  29.78 
 
 
381 aa  119  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2047  aminotransferase class I and II  29.34 
 
 
396 aa  119  9.999999999999999e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0730244  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3530  aminotransferase class I and II  28.98 
 
 
373 aa  119  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.903245  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1440  aspartate aminotransferase, putative  30.12 
 
 
399 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1192  aminotransferase class I and II  24.57 
 
 
375 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0059  aspartate aminotransferase  28.01 
 
 
376 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2121  aminotransferase  32.47 
 
 
386 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.799359  normal  0.288455 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1983  aminotransferase class I and II  29.85 
 
 
373 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0421  aspartate aminotransferase  29.45 
 
 
380 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.248364  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0568  aminotransferase  32.68 
 
 
391 aa  117  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0545  aminotransferase class I and II  29.13 
 
 
373 aa  117  3e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4149  hypothetical protein  31.57 
 
 
384 aa  117  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0014  putative aminotransferase  30.7 
 
 
384 aa  117  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5177  class I/II aminotransferase  27.27 
 
 
388 aa  117  3e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530188  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0674  L-aspartate aminotransferase  28 
 
 
392 aa  117  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0376  aminotransferase, class I and II  26.81 
 
 
373 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.276364  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3263  aminotransferase class I and II  27.14 
 
 
382 aa  117  3.9999999999999997e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1012  putative aminotransferase  28.83 
 
 
390 aa  116  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0776  hypothetical protein  30.26 
 
 
391 aa  117  5e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.623469  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1250  aspartate aminotransferase  26.63 
 
 
389 aa  116  6e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000188564  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0109  putative aminotransferase  32.34 
 
 
384 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1672  aspartate aminotransferase  28.96 
 
 
400 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0832  aspartate aminotransferase  28.06 
 
 
384 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0198108  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1134  aspartate aminotransferase  26.01 
 
 
387 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338962  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1969  putative aminotransferase  32.94 
 
 
389 aa  114  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1516  aminotransferase, class I and II  27.39 
 
 
377 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2710  aminotransferase A  29.36 
 
 
387 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0183593  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2490  putative aminotransferase  28.01 
 
 
391 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.228647  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1565  aminotransferase class I and II  27.39 
 
 
377 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0973  aminotransferase class I and II  26.11 
 
 
379 aa  115  2.0000000000000002e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  27.65 
 
 
387 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1502  aminotransferase class I and II  29.19 
 
 
388 aa  114  3e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000290558  normal  0.783372 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0106  L-aspartate aminotransferase  27.95 
 
 
392 aa  114  3e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07311  aminotransferases class-I  27.95 
 
 
392 aa  114  3e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.719619  hitchhiker  0.00557892 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>