53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5494 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5494  peptidase M14 carboxypeptidase A  100 
 
 		 218 aa  441  1e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.136631  normal  0.114762 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1204  peptidase M14, carboxypeptidase A  36.77 
 
 		 262 aa  78.2  0.00000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.670707  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1905  murein peptide amidase A  32.11 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1751  peptidase M14, carboxypeptidase A  33.52 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1769  murein peptide amidase A  33.33 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1734  murein peptide amidase A  31.37 
 
 		 249 aa  73.6  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.461062  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1866  murein peptide amidase A  31.94 
 
 		 242 aa  72.4  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.295718 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1970  murein peptide amidase A  31.41 
 
 		 242 aa  72  0.000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.996708  normal  0.386863 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1442  murein peptide amidase A  31.41 
 
 		 262 aa  72  0.000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1558  murein peptide amidase A  31.41 
 
 		 262 aa  72  0.000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1804  murein peptide amidase A  31.41 
 
 		 242 aa  72  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000928134 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1805  murein peptide amidase A  31.41 
 
 		 242 aa  71.6  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.561164  normal  0.438296 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1470  murein peptide amidase A  31.41 
 
 		 242 aa  72  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1652  murein peptide amidase A  31.41 
 
 		 242 aa  72  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.609177  normal  0.0125995 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01314  hypothetical protein  31.41 
 
 		 262 aa  72  0.000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.107648  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01303  murein peptide amidase A  31.41 
 
 		 262 aa  72  0.000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.131141  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2320  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.41 
 
 		 262 aa  72  0.000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.250489  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1797  murein peptide amidase A  31.58 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.594625  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1797  murein peptide amidase A  31.49 
 
 		 242 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2299  murein peptide amidase A  31.41 
 
 		 242 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.771923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1536  murein peptide amidase A  30.89 
 
 		 242 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2149  murein peptide amidase A  31.35 
 
 		 237 aa  68.6  0.00000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2614  murein peptide amidase A  29.89 
 
 		 235 aa  66.6  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.964461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0129  peptidase M14, carboxypeptidase A  32.77 
 
 		 424 aa  65.9  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.846597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001003  gamma-D-Glutamyl-meso-Diaminopimelate Amidase  28.5 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0043  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.59 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2320  murein peptide amidase A  28.5 
 
 		 239 aa  64.7  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.836285  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2602  murein peptide amidase A  28 
 
 		 239 aa  63.9  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0782  hypothetical protein  34.06 
 
 		 514 aa  62.8  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.84486  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07057  murein peptide amidase A  28 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  34.91 
 
 		 821 aa  56.2  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3421  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.53 
 
 		 406 aa  51.6  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000158618  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2643  zinc carboxypeptidase-related protein  35.53 
 
 		 342 aa  49.7  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2718  zinc carboxypeptidase-related protein  35.53 
 
 		 342 aa  49.7  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.792819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2604  zinc carboxypeptidase-related protein  35.53 
 
 		 342 aa  49.3  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1742  zinc carboxypeptidase-related protein  35.53 
 
 		 342 aa  49.3  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.212306  hitchhiker  0.00119795 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3329  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.73 
 
 		 453 aa  49.3  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2664  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.38 
 
 		 365 aa  49.3  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00317155  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3979  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.79 
 
 		 500 aa  48.1  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.946753 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1975  Zinc carboxypeptidase-related protein  35.06 
 
 		 342 aa  48.1  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4756  peptidase M14, carboxypeptidase A  35.92 
 
 		 506 aa  47  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2354  zinc carboxypeptidase-related protein  34.21 
 
 		 341 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.07586  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0037  peptidase M14 carboxypeptidase A  39.18 
 
 		 432 aa  46.6  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0774  zinc carboxypeptidase-related protein  32.5 
 
 		 340 aa  46.2  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2282  zinc carboxypeptidase-related protein  34.21 
 
 		 346 aa  46.2  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.548754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2610  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.09 
 
 		 606 aa  44.7  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.163339 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1198  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.09 
 
 		 606 aa  44.7  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1797  peptidase M14, carboxypeptidase A  43.48 
 
 		 618 aa  44.7  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2472  oxoglutarate dehydrogenase (succinyl-transferring)  32.89 
 
 		 341 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.319923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4624  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.97 
 
 		 344 aa  42.7  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.144195 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0840  zinc carboxypeptidase-related protein  30.07 
 
 		 344 aa  42  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.387339  normal  0.0855585 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2489  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.34 
 
 		 1074 aa  42  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0391  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.96 
 
 		 446 aa  41.6  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>