More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5349 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5349  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  100 
 
 
1016 aa  2040    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.553326  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1157  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  37.27 
 
 
1007 aa  490  1e-137  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6223  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  36.17 
 
 
994 aa  436  1e-120  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1260  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  33.87 
 
 
1024 aa  371  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.822477 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2501  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  32.66 
 
 
1036 aa  367  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.120058  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5384  serine/threonine protein kinase  31.07 
 
 
1109 aa  354  4e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00425552  normal  0.786393 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6656  serine/threonine protein kinase  32.25 
 
 
979 aa  311  2.9999999999999997e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.38837  normal  0.794447 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4130  serine/threonine protein kinase  37.94 
 
 
1005 aa  310  1.0000000000000001e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0127288 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5601  serine/threonine protein kinase  30.89 
 
 
900 aa  293  1e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3233  serine/threonine protein kinase  30.3 
 
 
1290 aa  286  1.0000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.273331  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1504  serine/threonine protein kinase  30.56 
 
 
1057 aa  273  2e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000141055 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1732  serine/threonine protein kinase  31.18 
 
 
1065 aa  261  4e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.893925  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4294  serine/threonine protein kinase  46.56 
 
 
536 aa  258  6e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203828  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0547  serine/threonine protein kinase  47.9 
 
 
678 aa  241  5e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6560  serine/threonine protein kinase  33.56 
 
 
847 aa  223  9.999999999999999e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.139307  normal  0.187862 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1322  serine/threonine protein kinase  44.7 
 
 
1003 aa  210  9e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4878  serine/threonine protein kinase  38.99 
 
 
622 aa  193  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.160783  normal  0.181716 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5581  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  35.73 
 
 
1040 aa  191  8e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0263  serine/threonine protein kinase  36.71 
 
 
894 aa  169  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.925108  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6760  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  28.88 
 
 
815 aa  167  6.9999999999999995e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0362  serine/threonine protein kinase  33.22 
 
 
632 aa  167  8e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3119  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.07 
 
 
681 aa  166  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.417733  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2098  protein kinase  33.04 
 
 
620 aa  166  3e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5237  protein kinase  31.41 
 
 
583 aa  164  7e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307839  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1041  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase:PASTA  35.9 
 
 
672 aa  162  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.513032  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0087  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.93 
 
 
645 aa  162  2e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3876  serine/threonine protein kinase  34.07 
 
 
565 aa  163  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1587  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  34.66 
 
 
825 aa  163  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.36 
 
 
650 aa  163  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1033  protein kinase  34.6 
 
 
586 aa  162  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  33.8 
 
 
625 aa  162  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0088  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.93 
 
 
520 aa  162  4e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3369  serine/threonine protein kinase  34.1 
 
 
455 aa  161  5e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  32.98 
 
 
614 aa  161  5e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3086  protein kinase  38.49 
 
 
658 aa  161  5e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1337  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  37.31 
 
 
646 aa  161  6e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314134 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3182  protein kinase  34.72 
 
 
494 aa  160  8e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0356849  normal  0.234738 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6001  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.54 
 
 
607 aa  160  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1067  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.46 
 
 
653 aa  160  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2486  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.4 
 
 
715 aa  159  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  34.97 
 
 
615 aa  159  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2669  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.86 
 
 
728 aa  159  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2578  serine/threonine protein kinase  33.63 
 
 
985 aa  159  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.790371  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2536  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.47 
 
 
747 aa  158  5.0000000000000005e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2780  serine/threonine protein kinase  36.51 
 
 
642 aa  158  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440633  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1367  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  32.98 
 
 
869 aa  158  6e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4390  serine/threonine protein kinase  33.55 
 
 
938 aa  156  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139237  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1511  serine/threonine kinase protein  29.18 
 
 
641 aa  157  1e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4122  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  28.23 
 
 
1126 aa  156  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.289873  decreased coverage  0.00939921 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0995  protein kinase  34.55 
 
 
586 aa  156  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396652  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0115  serine/threonine protein kinase  36.21 
 
 
585 aa  155  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0109927  normal  0.0245304 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0037  serine/threonine protein kinase  31.77 
 
 
750 aa  155  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1554  serine/threonine protein kinase  35.03 
 
 
710 aa  155  5e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.93 
 
 
598 aa  155  5e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  33.45 
 
 
612 aa  154  5.9999999999999996e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  35.43 
 
 
776 aa  154  5.9999999999999996e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2716  serine/threonine protein kinase  34.04 
 
 
919 aa  154  7e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.26 
 
 
668 aa  154  8e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1555  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.37 
 
 
707 aa  154  8e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.556964 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4458  serine/threonine protein kinase  33.91 
 
 
573 aa  153  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.776532  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  32.88 
 
 
863 aa  154  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3543  serine/threonine protein kinase  35.24 
 
 
537 aa  152  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0435506  normal  0.170453 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3472  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.97 
 
 
916 aa  153  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00045069  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2537  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.96 
 
 
850 aa  152  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4042  Serine/threonine protein kinase-related protein  32.62 
 
 
528 aa  153  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0574  serine/threonine protein kinase  29.77 
 
 
703 aa  152  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2219  serine/threonine protein kinase  35.23 
 
 
862 aa  152  4e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.318627  normal  0.271916 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1700  Serine/threonine protein kinase  34.92 
 
 
425 aa  151  5e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4392  serine/threonine protein kinase  35.25 
 
 
891 aa  151  5e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0782  serine/threonine protein kinase  35.99 
 
 
604 aa  151  6e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0797  protein kinase  35.99 
 
 
604 aa  151  6e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0854575 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0135  serine/threonine protein kinase  33.44 
 
 
562 aa  151  7e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.340026 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0778  protein kinase  35.99 
 
 
604 aa  151  7e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0022  serine/threonine protein kinase  37.65 
 
 
567 aa  151  7e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0878271  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.79 
 
 
627 aa  150  9e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4391  serine/threonine protein kinase  36.9 
 
 
915 aa  150  9e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  34.86 
 
 
618 aa  150  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  35.79 
 
 
673 aa  150  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4118  serine/threonine protein kinase  37.06 
 
 
888 aa  149  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.116559  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5246  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.14 
 
 
613 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.438769  hitchhiker  0.0079464 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1392  serine/threonine kinase protein  32.75 
 
 
623 aa  149  2.0000000000000003e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1535  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.49 
 
 
627 aa  149  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4693  protein kinase  33.91 
 
 
574 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2534  serine/threonine protein kinase  34.27 
 
 
530 aa  149  3e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.928543  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4508  serine/threonine protein kinase  40.08 
 
 
403 aa  149  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.465197  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0770  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  36.69 
 
 
757 aa  148  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.424396 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0991  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.53 
 
 
551 aa  148  5e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  36.21 
 
 
646 aa  148  6e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2026  protein kinase  35.07 
 
 
561 aa  148  6e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.399882  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1052  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.22 
 
 
798 aa  148  7.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2514  protein kinase  31.94 
 
 
656 aa  147  8.000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0149457  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.44 
 
 
1598 aa  147  9e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.96 
 
 
579 aa  147  9e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0026  Serine/threonine protein kinase-related protein  31.37 
 
 
445 aa  147  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.397929  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1455  serine/threonine protein kinase  35.16 
 
 
821 aa  147  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2082  serine/threonine protein kinase  29.57 
 
 
625 aa  147  1e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2753  Serine/threonine protein kinase-related protein  32.65 
 
 
517 aa  146  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2641  serine/threonine protein kinase  36.6 
 
 
382 aa  146  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.433048  normal  0.643401 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4117  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.42 
 
 
769 aa  146  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.555121  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1169  protein kinase  28.85 
 
 
634 aa  146  2e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000304799  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>