143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5337 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5337  regulator of chromosome condensation RCC1  100 
 
 
618 aa  1244    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5721  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  40.3 
 
 
810 aa  323  7e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0264  regulator of chromosome condensation RCC1  38.66 
 
 
792 aa  198  3e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0100345  normal  0.0222912 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0669  regulator of chromosome condensation RCC1  39.78 
 
 
776 aa  196  9e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000957147  hitchhiker  0.000042388 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0670  regulator of chromosome condensation RCC1  37.6 
 
 
778 aa  194  6e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.0000346041 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0668  regulator of chromosome condensation RCC1  37.77 
 
 
784 aa  180  9e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000606887  hitchhiker  0.00000503803 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0421  regulator of chromosome condensation, RCC1  41.16 
 
 
837 aa  167  4e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0560026 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4499  regulator of chromosome condensation, RCC1  40 
 
 
553 aa  158  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243819  hitchhiker  0.00250831 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1395  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  36.14 
 
 
941 aa  155  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0169  regulator of chromosome condensation RCC1  37.26 
 
 
1207 aa  149  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.26578 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2802  regulator of chromosome condensation RCC1  35.01 
 
 
389 aa  144  4e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_89498  predicted protein  35.66 
 
 
376 aa  141  3e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.034274  normal  0.0389123 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1101  regulator of chromosome condensation RCC1  34.19 
 
 
1187 aa  140  6e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0960  BNR repeat-containing protein  30.3 
 
 
449 aa  139  1e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0736661  normal  0.223675 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  34.23 
 
 
1919 aa  139  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1102  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  40.47 
 
 
787 aa  139  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1979  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.65 
 
 
554 aa  139  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158856  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3078  cysteine-rich repeat protein  34.88 
 
 
602 aa  137  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0983  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  34.14 
 
 
1147 aa  135  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.657675  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2687  regulator of chromosome condensation, RCC1  38.1 
 
 
821 aa  134  3e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360144 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1863  regulator of chromosome condensation RCC1  34.69 
 
 
593 aa  134  3.9999999999999996e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.59713  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1193  cell wall anchor domain-containing protein  35.48 
 
 
577 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770644  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1176  regulator of chromosome condensation, RCC1  37.13 
 
 
567 aa  131  4.0000000000000003e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.308067  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0168  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  34.92 
 
 
817 aa  131  4.0000000000000003e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.638374 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4382  regulator of chromosome condensation, RCC1  36.19 
 
 
556 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  33.9 
 
 
1848 aa  129  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1179  cell wall anchor domain-containing protein  34.58 
 
 
558 aa  127  7e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6387  hypothetical protein  33.94 
 
 
473 aa  124  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.606355  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2977  regulator of chromosome condensation RCC1  33.33 
 
 
579 aa  124  5e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483456  hitchhiker  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0956  regulator of chromosome condensation RCC1  33.33 
 
 
743 aa  123  8e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.454345  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2688  regulator of chromosome condensation, RCC1  35.27 
 
 
818 aa  123  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0258848 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1585  regulator of chromosome condensation, RCC1  37.31 
 
 
570 aa  123  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.179205  normal  0.90186 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2978  regulator of chromosome condensation, RCC1  34.15 
 
 
561 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.310394  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.81 
 
 
1679 aa  122  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4383  regulator of chromosome condensation RCC1  36.4 
 
 
546 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.843021  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1539  regulator of chromosome condensation RCC1  32.88 
 
 
569 aa  121  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781451  hitchhiker  0.00406058 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4565  hypothetical protein  34.07 
 
 
477 aa  121  3.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6709  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  33.33 
 
 
535 aa  120  7e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93763 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2682  hypothetical protein  30.72 
 
 
429 aa  119  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.180189  normal  0.57701 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1072  regulator of chromosome condensation RCC1  35.65 
 
 
553 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0600576  decreased coverage  0.000288682 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2349  cell wall anchor domain-containing protein  36.19 
 
 
551 aa  118  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.0247307 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2677  regulator of chromosome condensation RCC1  32.49 
 
 
544 aa  117  6e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0824266  normal  0.249754 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1086  cell wall anchor domain-containing protein  35.56 
 
 
566 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.628609  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2565  regulator of chromosome condensation RCC1  31.29 
 
 
363 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0283551  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0430  alpha-tubulin suppressor  34.75 
 
 
807 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2569  regulator of chromosome condensation RCC1  31.29 
 
 
363 aa  116  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00852612  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1538  regulator of chromosome condensation RCC1  36.9 
 
 
560 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2304  alpha-tubulin suppressor  29.79 
 
 
461 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.876578  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1593  regulator of chromosome condensation RCC1  33.96 
 
 
558 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0107683  decreased coverage  0.00113997 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  30.18 
 
 
1129 aa  112  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2567  regulator of chromosome condensation, RCC1  36.2 
 
 
555 aa  111  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1792  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.98 
 
 
417 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1101  alpha-tubulin suppressor  32.6 
 
 
911 aa  110  5e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  35.29 
 
 
706 aa  110  6e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  32.59 
 
 
2082 aa  110  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1729  regulator of chromosome condensation RCC1  37.69 
 
 
681 aa  109  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.378302 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2892  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  32.15 
 
 
835 aa  108  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0799  alpha-tubulin suppressor  34.76 
 
 
461 aa  108  4e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.16068  decreased coverage  0.00221798 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4451  serine/threonine protein kinase  31.78 
 
 
745 aa  107  6e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_3182  predicted protein  31.49 
 
 
341 aa  107  6e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1045  BNR repeat-containing protein  30.77 
 
 
454 aa  107  7e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.331835  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3514  BNR repeat-containing protein  30.21 
 
 
396 aa  106  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  36.1 
 
 
469 aa  106  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4027  regulator of chromosome condensation RCC1  34.67 
 
 
638 aa  106  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2856  BNR repeat-containing protein  33.88 
 
 
447 aa  106  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5563  hypothetical protein  31.84 
 
 
485 aa  106  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1055  regulator of chromosome condensation RCC1  33.45 
 
 
717 aa  104  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3864  hypothetical protein  35.78 
 
 
477 aa  103  8e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.571243  normal  0.0690788 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4380  regulator of chromosome condensation RCC1  32.85 
 
 
554 aa  103  8e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000261598 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1715  regulator of chromosome condensation, RCC1  30.39 
 
 
563 aa  103  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4652  regulator of chromosome condensation, RCC1  32.08 
 
 
555 aa  101  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197342  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0103  hypothetical protein  27 
 
 
286 aa  99.8  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1051  regulator of chromosome condensation RCC1  32.76 
 
 
714 aa  99.4  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2043  XGLTT repeat protein  33.96 
 
 
437 aa  99.4  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1007  regulator of chromosome condensation RCC1  31.7 
 
 
443 aa  99.4  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2113  Repeat of unknown function XGLTT  33.96 
 
 
462 aa  99.4  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6425  hypothetical protein  31.47 
 
 
429 aa  97.1  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2272  putative lipoprotein  29.57 
 
 
403 aa  95.5  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1923  regulator of chromosome condensation, RCC1  31.22 
 
 
692 aa  94.7  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.611736  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2961  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  34.67 
 
 
326 aa  91.7  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.462703  normal  0.0513542 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0742  copper amine oxidase domain-containing protein  28.97 
 
 
547 aa  91.3  4e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0161  alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing proteins-like protein  31.56 
 
 
726 aa  89  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4142  regulator of chromosome condensation RCC1  27.94 
 
 
575 aa  87.8  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4469  Fibronectin type III domain protein  29.34 
 
 
624 aa  86.3  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36955  predicted protein  31.25 
 
 
418 aa  86.3  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000048809  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28035  predicted protein  30.73 
 
 
371 aa  86.3  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00114793  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1817  hypothetical protein  32.99 
 
 
486 aa  85.5  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  32.93 
 
 
1222 aa  85.5  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06370  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  29.41 
 
 
737 aa  84.3  0.000000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.688875  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49595  predicted protein  27.22 
 
 
643 aa  81.6  0.00000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.107678  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5793  hypothetical protein  28.95 
 
 
418 aa  80.9  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.593585  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5600  hypothetical protein  34.29 
 
 
287 aa  80.1  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.88475 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1358  hypothetical protein  26.52 
 
 
375 aa  77.4  0.0000000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_65479  pheromone response pathway  28.85 
 
 
499 aa  77  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.349403 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06510  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  32.59 
 
 
900 aa  76.6  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.10191  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3372  regulator of chromosome condensation RCC1  35.71 
 
 
375 aa  73.2  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.582545  normal  0.977781 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37043  predicted protein  29.6 
 
 
643 aa  73.2  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  26.25 
 
 
14609 aa  72.4  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1230  regulator of chromosome condensation  26.96 
 
 
558 aa  72.4  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.717707 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1394  immunoglobulin I-set domain-containing protein  30.13 
 
 
1126 aa  72.4  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>