More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5257 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5257  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 
749 aa  1491    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5978  AAA ATPase central domain protein  46.28 
 
 
1085 aa  294  4e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1879  AAA ATPase  31.48 
 
 
787 aa  280  1e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1500  AAA ATPase central domain protein  35.03 
 
 
639 aa  270  5.9999999999999995e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1499  AAA ATPase central domain protein  29.91 
 
 
744 aa  266  8e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0972  AAA family ATPase  36.7 
 
 
743 aa  266  8.999999999999999e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4150  AAA ATPase central domain protein  29.72 
 
 
665 aa  262  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2524  AAA ATPase central domain protein  30.12 
 
 
656 aa  259  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2009  AAA ATPase central domain protein  41.54 
 
 
1193 aa  255  3e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2830  ATPase central domain-containing protein  42.2 
 
 
657 aa  253  7e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1651  ATPase central domain-containing protein  49.24 
 
 
653 aa  252  2e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0496762 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2933  AAA ATPase central domain protein  38.93 
 
 
689 aa  248  3e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1952  AAA ATPase central domain protein  41.42 
 
 
656 aa  240  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.248161 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1734  AAA ATPase central domain protein  46.69 
 
 
697 aa  237  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.168086 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1819  ATPase central domain-containing protein  40.16 
 
 
662 aa  232  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.760352  normal  0.277502 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3811  ATPase central domain-containing protein  47.1 
 
 
788 aa  229  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.308842 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0938  ATPase central domain-containing protein  38.4 
 
 
671 aa  225  2e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4356  hypothetical protein  45.7 
 
 
652 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00948823  normal  0.0832553 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1893  AAA ATPase central domain protein  45.97 
 
 
698 aa  219  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00103439  normal  0.0680609 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1943  AAA ATPase central domain protein  43.87 
 
 
619 aa  218  2.9999999999999998e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00697304  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0859  AAA ATPase  31.09 
 
 
634 aa  216  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2258  AAA ATPase central domain protein  36.18 
 
 
680 aa  214  3.9999999999999995e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.226213  hitchhiker  0.00277333 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5393  AAA ATPase central domain protein  42.11 
 
 
682 aa  214  5.999999999999999e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1049  elongation factor P  40.78 
 
 
432 aa  213  1e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0827  AAA ATPase, central region  47.35 
 
 
697 aa  209  1e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.934037  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1020  AAA ATPase central domain protein  42.35 
 
 
646 aa  207  8e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0362  ATPase central domain-containing protein  43.95 
 
 
448 aa  205  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4397  AAA ATPase central domain protein  47.2 
 
 
687 aa  205  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1669  AAA ATPase central domain protein  39.76 
 
 
450 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3136  AAA ATPase, central region  41.25 
 
 
478 aa  200  6e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2559  AAA ATPase central domain protein  38.96 
 
 
450 aa  198  3e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.585202  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0755  AAA ATPase central domain protein  38.23 
 
 
725 aa  196  1e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0659  AAA ATPase central domain protein  39.84 
 
 
442 aa  194  4e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0372478  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2559  AAA ATPase  42.64 
 
 
444 aa  192  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000494228 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4120  AAA ATPase central domain protein  37.35 
 
 
466 aa  191  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0052109  hitchhiker  0.000242019 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1864  AAA ATPase central domain protein  34.88 
 
 
678 aa  191  5e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2455  putative ATPase  42.74 
 
 
441 aa  189  1e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0571186  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3054  ATPase central domain-containing protein  43.56 
 
 
725 aa  189  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000821112 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1753  ATPase central domain-containing protein  46.51 
 
 
450 aa  189  2e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.215663  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1133  AAA ATPase, central region  46.58 
 
 
445 aa  184  7e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3934  AAA ATPase central domain protein  42.58 
 
 
450 aa  182  2.9999999999999997e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158027  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2996  AAA ATPase, central region  37.93 
 
 
478 aa  180  8e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3602  AAA ATPase, central region  40.23 
 
 
448 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.000000057004 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1822  ATPase central domain-containing protein  39.84 
 
 
622 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3168  ATPase central domain-containing protein  35.48 
 
 
434 aa  175  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0578626  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5237  AAA ATPase central domain protein  39.91 
 
 
459 aa  167  8e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.368199  hitchhiker  0.00000000902621 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4054  AAA ATPase, central region  33.93 
 
 
299 aa  133  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0357172 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1579  ATPase, AAA family protein  29.36 
 
 
570 aa  127  8.000000000000001e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0401  ATPase, AAA family protein  29.18 
 
 
570 aa  126  1e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0426  ATPase, AAA family protein  29.18 
 
 
570 aa  126  1e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1667  ATPase, AAA family protein  31.2 
 
 
569 aa  125  3e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0137  AAA ATPase central domain protein  31.09 
 
 
577 aa  124  9e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1774  cysteine synthase A  30.74 
 
 
580 aa  123  9.999999999999999e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0393214  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3668  AAA ATPase central domain protein  47.58 
 
 
134 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0869  AAA ATPase family protein  33.65 
 
 
352 aa  121  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000165138  normal  0.784704 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1833  AAA ATPase  31.14 
 
 
578 aa  120  7.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.735306  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1549  ATPase, AAA family protein  29.96 
 
 
570 aa  119  9.999999999999999e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.974713  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0853  AAA ATPase  31.96 
 
 
305 aa  115  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1882  ATPase central domain-containing protein  32.35 
 
 
617 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0172  ATPase central domain-containing protein  30.6 
 
 
387 aa  110  9.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1961  putative ATPase protein  28.95 
 
 
771 aa  110  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.242778  normal  0.909939 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2115  AAA ATPase central domain protein  28.48 
 
 
773 aa  109  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00930684  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1791  AAA ATPase central domain protein  28.55 
 
 
773 aa  108  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.615211 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0150  AAA ATPase central domain protein  30.19 
 
 
775 aa  105  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.172395  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3267  ATPase central domain-containing protein  42.96 
 
 
795 aa  103  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.115516 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0165  putative ATPase protein  46.38 
 
 
772 aa  103  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0112  ATPase central domain-containing protein  30.61 
 
 
789 aa  103  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.181464 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0025  AAA ATPase central domain protein  34.39 
 
 
443 aa  102  3e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2234  AAA ATPase, central region  27.14 
 
 
766 aa  101  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218503  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0166  AAA ATPase, central region  42.66 
 
 
789 aa  99  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2275  AAA ATPase, central region  40.69 
 
 
771 aa  96.7  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0746104  hitchhiker  0.00641076 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2297  AAA ATPase, central region  34.62 
 
 
228 aa  93.6  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.754524 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1890  AAA ATPase central domain protein  29.78 
 
 
367 aa  88.6  4e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.439906  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10210  AAA+ family ATPase  32.88 
 
 
336 aa  88.2  5e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.954892  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3559  ATPase central domain-containing protein  36.36 
 
 
677 aa  88.2  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3114  ATPase central domain-containing protein  40.65 
 
 
698 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.020083  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2640  ATPase central domain-containing protein  30.57 
 
 
332 aa  87  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.288063  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4244  AAA ATPase, central region  34.01 
 
 
686 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000108013 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00294  ATPase, AAA family protein  35.25 
 
 
676 aa  85.5  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1291  ATPase central domain-containing protein  32.43 
 
 
328 aa  85.9  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262565  normal  0.0615786 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03290  ATPase, putative  25 
 
 
405 aa  84.7  0.000000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05747  hypothetical protein similar to PSMC6 subunit (Broad)  24.1 
 
 
393 aa  84.3  0.000000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.222803  normal  0.0253751 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1672  ATPase central domain-containing protein  29.57 
 
 
369 aa  83.6  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00463679  normal  0.710335 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0729  AAA ATPase, central region  35.92 
 
 
668 aa  83.2  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.562949  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1619  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.06 
 
 
737 aa  82.4  0.00000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1259  AAA ATPase central domain protein  26.11 
 
 
573 aa  81.6  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.636785  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34331  predicted protein  26.85 
 
 
400 aa  82  0.00000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.926825  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1765  ATPase central domain-containing protein  38.69 
 
 
655 aa  81.6  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.835623  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1692  putative ATPase  34.03 
 
 
322 aa  81.6  0.00000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.593174 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0536  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.06 
 
 
738 aa  81.6  0.00000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.033227 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5327  ATPase central domain-containing protein  32.2 
 
 
327 aa  81.3  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.449619  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3219  ATPase central domain-containing protein  34.29 
 
 
680 aa  81.3  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000100242 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0190  ATPase central domain-containing protein  31.33 
 
 
425 aa  81.3  0.00000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384028  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7319  ATPase central domain-containing protein  32.89 
 
 
355 aa  81.3  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.415671  normal  0.136646 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0068  AAA ATPase, central region  31.58 
 
 
613 aa  79.7  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.263545  hitchhiker  0.00768241 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4803  ATPase central domain-containing protein  30.45 
 
 
328 aa  79.7  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1971  ATPase central domain-containing protein  32.99 
 
 
390 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.68669  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.73 
 
 
718 aa  80.1  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0185  proteasome-activating nucleotidase  27.96 
 
 
405 aa  79.7  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3738  ATPase central domain-containing protein  30.89 
 
 
387 aa  79  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>