100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5247 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5247  OsmC family protein  100 
 
 
187 aa  388  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.402263 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5957  OsmC family protein  46.33 
 
 
190 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6453  OsmC family protein  49.16 
 
 
182 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16719  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6160  OsmC family protein  49.16 
 
 
182 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.76501  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3421  OsmC family protein  47.75 
 
 
184 aa  182  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320541  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4432  OsmC family protein  47.75 
 
 
184 aa  182  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.670087  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4264  hypothetical protein  45.3 
 
 
184 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3268  OsmC family protein  47.19 
 
 
184 aa  178  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4895  OsmC-like protein  47.19 
 
 
184 aa  178  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1978  OsmC family protein  46.99 
 
 
186 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6912  OsmC family protein  46.63 
 
 
184 aa  175  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6854  OsmC family protein  46.11 
 
 
186 aa  167  6e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.521419  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1026  OsmC family protein  33.52 
 
 
206 aa  123  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07015  hypothetical protein  30.51 
 
 
181 aa  122  4e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4791  OsmC family protein  35.68 
 
 
187 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.361207  normal  0.435509 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3848  OsmC family protein  29.44 
 
 
181 aa  119  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.323457  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2488  hypothetical protein  34.57 
 
 
202 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0441  OsmC family protein  35.54 
 
 
189 aa  108  6e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.488218  normal  0.432032 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4241  OsmC family protein  33.33 
 
 
202 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1865  OsmC family protein  34.51 
 
 
185 aa  98.2  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128326  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2570  OsmC family protein  29.48 
 
 
187 aa  98.6  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0586  OsmC family protein  32.07 
 
 
179 aa  97.1  1e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.128993  normal  0.0133234 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0190  OsmC family protein  30.68 
 
 
189 aa  97.1  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.155362 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2254  OsmC-like protein  33.99 
 
 
199 aa  96.3  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0977605  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0235  OsmC family protein  42.4 
 
 
147 aa  95.9  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0339  OsmC family protein  36.84 
 
 
145 aa  95.1  5e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.53983  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2325  OsmC family protein  30.82 
 
 
180 aa  92.8  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2788  hypothetical protein  29.82 
 
 
186 aa  92.4  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2354  OsmC-like protein  41.24 
 
 
170 aa  91.3  8e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.572746  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3413  OsmC family protein  36.7 
 
 
171 aa  89.7  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2488  OsmC family protein  34.56 
 
 
172 aa  85.1  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0230337  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0443  OsmC-like protein  32.88 
 
 
176 aa  85.1  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16081  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3231  OsmC family protein  28.81 
 
 
163 aa  82.4  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0969  OsmC family protein  41.05 
 
 
182 aa  82.4  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.298439 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3526  OsmC family protein  37.74 
 
 
177 aa  80.5  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7407  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0304  hypothetical protein  33.33 
 
 
190 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1892  OsmC-like protein  31.34 
 
 
148 aa  79.3  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2100  OsmC family protein  30.41 
 
 
185 aa  78.6  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0623  hypothetical protein  31.64 
 
 
176 aa  77  0.0000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0005983  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2612  OsmC family protein  36.97 
 
 
208 aa  77.4  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.43183 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5418  hypothetical protein  38.79 
 
 
180 aa  77  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2505  OsmC family protein  35.92 
 
 
147 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3485  OsmC family protein  37.5 
 
 
185 aa  75.1  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4851  OsmC-like protein  35.19 
 
 
187 aa  74.3  0.0000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.137347 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04790  OsmC family protein  40.52 
 
 
144 aa  73.6  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1644  OsmC family protein  22.91 
 
 
193 aa  73.9  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2836  OsmC family protein  33.64 
 
 
177 aa  73.2  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3793  OsmC family protein  40.66 
 
 
185 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.242728 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2212  OsmC family protein  33.33 
 
 
159 aa  72.4  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3867  OsmC family protein  38.46 
 
 
185 aa  71.6  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0319528 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1310  OsmC family protein  38.14 
 
 
183 aa  71.2  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.47097  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1151  OsmC family protein  38.14 
 
 
183 aa  71.2  0.000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.824502  normal  0.359642 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4668  OsmC family protein  34.96 
 
 
183 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.35857  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2175  OsmC-like protein  33.87 
 
 
185 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.416909  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0039  OsmC-like protein  28.33 
 
 
179 aa  70.1  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6241  OsmC family protein  23.68 
 
 
182 aa  65.5  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0196837  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13840  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  29.91 
 
 
145 aa  64.7  0.0000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1348  OsmC family protein  32 
 
 
151 aa  62.8  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1670  OsmC family protein  30.21 
 
 
156 aa  61.6  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0539264  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1058  OsmC family protein  30.09 
 
 
200 aa  59.3  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.333829 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2794  OsmC family protein  28.69 
 
 
142 aa  56.6  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1075  OsmC family protein  26.77 
 
 
142 aa  53.9  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1071  OsmC family protein  26.77 
 
 
142 aa  53.9  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000601559  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1143  OsmC family protein  26.77 
 
 
142 aa  53.9  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000523467  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1270  hypothetical protein  24.79 
 
 
144 aa  52.4  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00225413  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1904  OsmC family protein  23.76 
 
 
193 aa  50.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.576095  unclonable  0.00000937306 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1477  OsmC family protein  24.65 
 
 
137 aa  50.8  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1727  hypothetical protein  33.61 
 
 
138 aa  49.7  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0897  OsmC family protein  25 
 
 
145 aa  49.7  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.669017  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3495  hypothetical protein  25.41 
 
 
142 aa  49.3  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0206  OsmC family protein  28.3 
 
 
174 aa  48.9  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.338673  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3865  OsmC family protein  33.9 
 
 
175 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.745195  normal  0.175914 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3007  OsmC family protein  27.59 
 
 
146 aa  46.6  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1072  OsmC family protein  25.24 
 
 
135 aa  46.2  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.107078  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1919  OsmC family protein  27.2 
 
 
131 aa  45.1  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.148561  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0218  hypothetical protein  33.87 
 
 
74 aa  44.7  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.354041 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0921  OsmC family protein  39.62 
 
 
136 aa  45.1  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.418667  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0049  OsmC family protein  29.76 
 
 
406 aa  44.3  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2142  OsmC family protein  27.52 
 
 
129 aa  44.3  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1923  OsmC-like protein  40.38 
 
 
127 aa  44.3  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2031  OsmC family protein  25.44 
 
 
138 aa  43.1  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.650355  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0377  OsmC family protein  31.08 
 
 
169 aa  43.9  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1148  OsmC family protein  31.08 
 
 
169 aa  43.5  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1673  OsmC-like protein  33.96 
 
 
409 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0982  OsmC family protein  37.74 
 
 
127 aa  43.5  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2189  OsmC family protein  31.08 
 
 
169 aa  43.5  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0335227  normal  0.683604 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0862  OsmC family protein  19.89 
 
 
173 aa  43.1  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.219925  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48750  hypothetical protein  26.05 
 
 
135 aa  43.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000274485 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1127  OsmC family protein  28.38 
 
 
168 aa  42  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.938023 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0042  OsmC family protein  26.67 
 
 
142 aa  42  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6577  OsmC family protein  25.55 
 
 
176 aa  41.6  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0684  OsmC-like protein  31.11 
 
 
167 aa  42  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.503679  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0330  OsmC family protein  29.73 
 
 
169 aa  42  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.514624  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1255  OsmC-like protein  25.55 
 
 
176 aa  41.6  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.340631  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6182  OsmC family protein  25.55 
 
 
176 aa  41.6  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.360981 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0407  OsmC family protein  31.08 
 
 
169 aa  41.6  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0496053  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1957  OsmC family protein  23.26 
 
 
201 aa  41.6  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.226046 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0335  OsmC family protein  24.16 
 
 
127 aa  41.2  0.009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.252391  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1368  OsmC family protein  27.37 
 
 
130 aa  40.8  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0210899 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1301  OsmC family protein  28.42 
 
 
130 aa  40.8  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0499071 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>