More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5204 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5204  ABC transporter related protein  100 
 
 
270 aa  541  1e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.213509  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1175  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  55.46 
 
 
375 aa  290  3e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0297  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  55.88 
 
 
375 aa  288  5.0000000000000004e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1033  ABC transporter related protein  58.82 
 
 
322 aa  285  7e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.117975 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2313  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  56.3 
 
 
315 aa  285  8e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.499344  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2804  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  56.72 
 
 
379 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000395219  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1201  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  52.94 
 
 
370 aa  281  8.000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2262  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  55.46 
 
 
315 aa  281  9e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2389  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  56.3 
 
 
315 aa  279  3e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.301455  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4151  ABC transporter related protein  57.56 
 
 
389 aa  280  3e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2125  glycine betaine/L-proline ABC transporter ATP-binding protein  55.04 
 
 
315 aa  279  4e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2063  glycine betaine ABC transporter, ATP-binding protein  55.04 
 
 
315 aa  279  4e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.832322  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2059  glycine betaine ABC transporter, ATP-binding protein  55.04 
 
 
315 aa  279  4e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2279  glycine betaine/L-proline ABC transporter ATP-binding protein  55.04 
 
 
315 aa  279  4e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.987599  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2718  ABC transporter related  56.73 
 
 
263 aa  279  4e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3063  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  55.04 
 
 
315 aa  279  4e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2305  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  55.04 
 
 
315 aa  279  4e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.264442 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2252  ABC transporter related  55.91 
 
 
257 aa  278  8e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.411417  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2339  ABC transporter, ATPase subunit  56.22 
 
 
263 aa  278  9e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.749366 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2099  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  51.89 
 
 
321 aa  277  2e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158223  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2981  ABC transporter related  54.62 
 
 
317 aa  276  3e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5139  ABC transporter related  56.72 
 
 
317 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.192374  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0452  ABC transporter related  56.2 
 
 
344 aa  276  3e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1688  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  56.72 
 
 
376 aa  276  4e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.315313  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0172  ABC transporter related  54.68 
 
 
310 aa  275  5e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.319596 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3224  ABC transporter related  56.72 
 
 
317 aa  275  5e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5143  ABC transporter related  56.72 
 
 
317 aa  275  5e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.310364  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1922  glycine betaine transport ATP-binding protein  53.33 
 
 
252 aa  275  6e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0268  quaternary amine ABC transporter ATP-binding protein  53.33 
 
 
252 aa  275  6e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3511  ABC transporter related  56.72 
 
 
312 aa  275  7e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5061  ABC transporter related  56.3 
 
 
312 aa  275  8e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0497  ABC proline/glycine betaine transporter, ATPase subunit  56.3 
 
 
312 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.975936  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4537  ABC transporter related  56.3 
 
 
312 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.67365  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18440  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  52.94 
 
 
377 aa  273  2.0000000000000002e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00065366  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3243  ABC transporter related  54.26 
 
 
267 aa  272  3e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.211149  normal  0.876591 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1993  amine ABC transporter, ATP-binding protein  53.7 
 
 
312 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.780492  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1974  amine ABC transporter, ATP-binding protein  53.7 
 
 
312 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1140  ABC transporter, ATP-binding protein  53.7 
 
 
312 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0408912  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2132  ABC transporter, ATP-binding protein  53.7 
 
 
312 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.314823  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0920  amine ABC transporter, ATP-binding protein  53.7 
 
 
312 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0239  amine ABC transporter, ATP-binding protein  53.7 
 
 
312 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.46205  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1580  amine ABC transporter, ATP-binding protein  53.7 
 
 
312 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1276  ABC transporter related  53.85 
 
 
321 aa  271  7e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2380  ABC transporter, ATP-binding protein  54.07 
 
 
312 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.850605  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4291  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  58.4 
 
 
351 aa  271  8.000000000000001e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.603453 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2475  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  52.1 
 
 
408 aa  271  1e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00846223  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3336  ABC transporter related  56.73 
 
 
264 aa  270  1e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.314642  normal  0.191945 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2523  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  52.1 
 
 
408 aa  271  1e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0108992  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4756  ABC transporter related protein  53.78 
 
 
328 aa  271  1e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2051  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  55.46 
 
 
370 aa  268  5.9999999999999995e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1154  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  54.62 
 
 
318 aa  268  8e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0119  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  51.26 
 
 
369 aa  267  1e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2913  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  52.92 
 
 
371 aa  267  1e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.362905 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37600  ABC-type proline/glycine betaine transport system, ATPase component  56.07 
 
 
353 aa  266  2e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2105  ABC transporter related  53.78 
 
 
263 aa  265  5e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.617159  normal  0.69001 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0802  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  52.28 
 
 
398 aa  265  5e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0745  ABC transporter related  50.59 
 
 
325 aa  265  8e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0762  ABC transporter related  50.59 
 
 
325 aa  265  8e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.128148  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2358  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.84 
 
 
395 aa  264  1e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1635  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  54.39 
 
 
397 aa  264  1e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.839045 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4726  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  57.14 
 
 
364 aa  263  2e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.631244  hitchhiker  0.000147167 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1622  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  54.39 
 
 
398 aa  262  4e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0297  ABC transporter related  56.25 
 
 
312 aa  262  4e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4639  ABC transporter related  50.93 
 
 
312 aa  262  4e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.493735  normal  0.263146 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2493  glycine betaine/L-proline transport ATP-binding subunit  51.45 
 
 
388 aa  262  4.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.957361  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3109  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  55.46 
 
 
389 aa  262  4.999999999999999e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1602  choline transport ATP-binding protein opuBA  51.04 
 
 
382 aa  262  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.844336  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1681  choline transport ATP-binding protein opuBA  51.04 
 
 
382 aa  262  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.413883  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1593  choline transport ATP-binding protein opuBA  51.04 
 
 
382 aa  262  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.108629 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1848  choline transport ATP-binding protein opuBA  51.04 
 
 
382 aa  261  6e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.607667  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1661  choline transport ATP-binding protein OpuBA  51.04 
 
 
382 aa  261  6e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.853927  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3117  ABC transporter related  52.77 
 
 
312 aa  261  1e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0287879  normal  0.0491103 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5180  glycine betaine/L-proline ABC transporter ATPase subunit  53.78 
 
 
392 aa  261  1e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.860702 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1921  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  50.62 
 
 
382 aa  261  1e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2668  ABC transporter related  56.3 
 
 
346 aa  260  2e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.194568  normal  0.0593639 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0351  ABC transporter related  51.05 
 
 
324 aa  259  2e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0304446  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2031  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.1 
 
 
418 aa  259  3e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.015462  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2945  ABC transporter related  51.71 
 
 
354 aa  259  3e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00675888  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1081  ABC transporter related protein  54.96 
 
 
323 aa  259  3e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.136277  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4310  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  50.42 
 
 
385 aa  259  4e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.944105  normal  0.26992 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5105  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  50.83 
 
 
371 aa  259  4e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.116998 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1620  ABC transporter related  54.2 
 
 
317 aa  258  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.290952  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2352  glycine betaine/carnitine/choline transport ATP-binding protein opuCA  53.78 
 
 
315 aa  258  7e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2401  glycine betaine/carnitine/choline transport ATP-binding protein opuCA  53.78 
 
 
315 aa  258  8e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.584641  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1555  ABC transporter related protein  51.82 
 
 
445 aa  258  8e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2397  glycine betaine/carnitine/choline transport ATP-binding protein opuCA  53.78 
 
 
315 aa  258  8e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2308  glycine betaine/carnitine/choline transport ATP-binding protein opuCA  53.78 
 
 
315 aa  258  8e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2509  glycine betaine/carnitine/choline transport ATP-binding protein opuCA  53.78 
 
 
315 aa  258  8e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.280806  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0868  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  50 
 
 
385 aa  258  9e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.429182  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0898  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  50 
 
 
385 aa  258  9e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.706016  normal  0.516388 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15740  ABC-type proline/glycine betaine transport system, ATPase component  55.04 
 
 
335 aa  257  1e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0478  ABC transporter related  50.77 
 
 
333 aa  257  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201964  hitchhiker  0.00297277 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2728  ABC transporter related  54.2 
 
 
316 aa  257  1e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2557  ABC transporter related  54.39 
 
 
362 aa  256  2e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000431635 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0577  ABC transporter related  53.14 
 
 
334 aa  256  2e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00000339076  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0912  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  49.58 
 
 
385 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.195496 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2992  ABC glycine betaine/L-proline transporter, ATPase subunit  49.79 
 
 
400 aa  256  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0985  ABC transporter related  53.14 
 
 
321 aa  256  3e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.997708  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1069  ABC transporter related  50.79 
 
 
259 aa  256  3e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0686791  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0622  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  53.31 
 
 
394 aa  256  4e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>