More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5185 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5185  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 660 aa  1290    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2292  sodium/hydrogen exchanger  45.59 
 
 		 637 aa  455  1e-127  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.042334  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3229  sodium/hydrogen exchanger  37.71 
 
 		 652 aa  352  1e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2891  sodium/hydrogen exchanger  37.71 
 
 		 652 aa  350  3e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1446  sodium/hydrogen exchanger  40.63 
 
 		 641 aa  340  4e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0859  sodium/hydrogen exchanger  37.01 
 
 		 640 aa  326  1e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2740  Sodium/hydrogen exchanger  36.66 
 
 		 629 aa  325  2e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.370681 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0888  sodium/hydrogen exchanger  43.01 
 
 		 628 aa  324  3e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.043911 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0511  sodium/hydrogen exchanger  35.3 
 
 		 622 aa  314  3.9999999999999997e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0220  hypothetical protein  39.02 
 
 		 598 aa  311  2.9999999999999997e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0956  sodium/hydrogen exchanger  36.75 
 
 		 639 aa  308  3e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000727  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  36.45 
 
 		 599 aa  306  9.000000000000001e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04922  Na+/K+/H+ antiporter  35.17 
 
 		 597 aa  297  3e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2605  sodium/hydrogen exchanger  36.47 
 
 		 637 aa  294  3e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00858761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1072  sodium/hydrogen exchanger  40.46 
 
 		 601 aa  295  3e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.558941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1024  Sodium/hydrogen exchanger  40.34 
 
 		 602 aa  293  8e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30796  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1982  sodium/hydrogen exchanger  38.92 
 
 		 619 aa  293  1e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4152  sodium/hydrogen exchanger  40.08 
 
 		 608 aa  292  1e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.561792 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4254  sodium/hydrogen exchanger  39.72 
 
 		 601 aa  291  4e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1467  sodium/hydrogen exchanger  39.32 
 
 		 601 aa  289  1e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.236845 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16030  putative sodium/hydrogen antiporter  38.98 
 
 		 611 aa  286  7e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0707  sodium/hydrogen exchanger  36.54 
 
 		 651 aa  286  1.0000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0127  sodium/hydrogen exchanger  32.63 
 
 		 760 aa  285  2.0000000000000002e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.302904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2318  sodium/hydrogen exchanger  39.38 
 
 		 599 aa  285  3.0000000000000004e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0395796  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1380  putative sodium/hydrogen antiporter  38.98 
 
 		 611 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00463957  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00461  Na+/H+ antiporter  33.52 
 
 		 569 aa  279  1e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0146  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  33.92 
 
 		 763 aa  278  2e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000269507 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0156  sodium/hydrogen exchanger  33.76 
 
 		 764 aa  275  2.0000000000000002e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4478  sodium/hydrogen exchanger  37.44 
 
 		 602 aa  274  3e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1871  sodium/hydrogen exchanger family protein  37.12 
 
 		 666 aa  274  4.0000000000000004e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4262  sodium/hydrogen exchanger  40.16 
 
 		 741 aa  273  9e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.387435  normal  0.153793 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3909  Na+/H+ antiporter  33.57 
 
 		 607 aa  269  1e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1998  sodium/hydrogen exchanger  34.68 
 
 		 616 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000112153 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2147  sodium/hydrogen exchanger  35.92 
 
 		 670 aa  267  5.999999999999999e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.251145  normal  0.368531 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2537  sodium/hydrogen exchanger family protein  36.12 
 
 		 669 aa  266  8.999999999999999e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2224  sodium/hydrogen exchanger  35.99 
 
 		 673 aa  266  8.999999999999999e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00760493  normal  0.0969988 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2869  sodium/hydrogen exchanger  37.37 
 
 		 623 aa  266  8.999999999999999e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.824474  normal  0.920346 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2324  sodium/hydrogen exchanger  35.06 
 
 		 670 aa  265  3e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.339898  normal  0.580137 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1861  sodium/hydrogen exchanger  36.28 
 
 		 719 aa  263  1e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.182882  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2400  sodium/hydrogen exchanger  37.58 
 
 		 625 aa  263  1e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000130765  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0850  sodium/hydrogen exchanger  37.02 
 
 		 617 aa  262  2e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1211  Sodium/hydrogen exchanger  33.46 
 
 		 611 aa  258  2e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0280603  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0477  sodium/hydrogen exchanger  38.01 
 
 		 616 aa  257  5e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0802705  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2394  Na+/H+ antiporter  46.91 
 
 		 593 aa  257  6e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00954713  hitchhiker  0.00302602 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1363  sodium/hydrogen exchanger  32.85 
 
 		 610 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00040523  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2017  sodium/hydrogen exchanger  36.06 
 
 		 660 aa  253  9.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000155921  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2308  sodium/hydrogen exchanger  36.06 
 
 		 660 aa  252  1e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2321  sodium/hydrogen exchanger  36.06 
 
 		 660 aa  253  1e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.545125  hitchhiker  0.000203679 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2065  sodium/hydrogen exchanger  36.06 
 
 		 660 aa  253  1e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000562767  hitchhiker  0.000963897 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2109  sodium/hydrogen exchanger  36.91 
 
 		 643 aa  250  6e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.235083  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03225  Na(+):H(+) antiporter, CPA1 family protein  35.02 
 
 		 625 aa  248  4e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1732  sodium/hydrogen exchanger  37.84 
 
 		 702 aa  244  3e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0521  Sodium/hydrogen exchanger  33.17 
 
 		 604 aa  244  3.9999999999999997e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4286  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.11 
 
 		 596 aa  242  1e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0381852  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0424  sodium/hydrogen exchanger  39.2 
 
 		 852 aa  242  2e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4667  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.92 
 
 		 596 aa  241  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4275  Na+/H+ exchanger (Na+/H+ antiporter)  30.73 
 
 		 596 aa  241  4e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4781  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.73 
 
 		 596 aa  241  4e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4654  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.73 
 
 		 596 aa  241  4e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4369  sodium/hydrogen exchanger  30.53 
 
 		 596 aa  240  5e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4436  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.73 
 
 		 596 aa  239  1e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00005477  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0868  Na(+):H(+) antiporter  33.47 
 
 		 606 aa  232  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3265  hypothetical protein  29.14 
 
 		 612 aa  231  3e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.769883  normal  0.438481 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3335  sodium/hydrogen exchanger  38.48 
 
 		 620 aa  228  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.263671  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0759  sodium/hydrogen exchanger  39.8 
 
 		 584 aa  213  7.999999999999999e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135673  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0472  CPA1 family Na+/H+ antiporter  39.35 
 
 		 399 aa  212  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0494569  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3722  TrkA-N domain protein  33.13 
 
 		 617 aa  211  4e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207998  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1720  CPA1 family Na+/H+ antiporter  44.6 
 
 		 414 aa  210  8e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06781  putative Na+/H+ antiporter, CPA1 family  38.63 
 
 		 421 aa  209  9e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05361  CPA1 family Na+/H+ antiporter  37.2 
 
 		 399 aa  206  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0112  TrkA-N domain protein  32.53 
 
 		 617 aa  200  7.999999999999999e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2077  Na+/H+ antiporter, putative  27.98 
 
 		 595 aa  199  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05281  CPA1 family Na+/H+ antiporter  41.48 
 
 		 414 aa  199  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0626531  normal  0.0646135 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05271  CPA1 family Na+/H+ antiporter  39.03 
 
 		 401 aa  198  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0377759  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1805  CPA1 family Na+/H+ antiporter  41.48 
 
 		 414 aa  198  3e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.781588  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04971  CPA1 family Na+/H+ antiporter  39.32 
 
 		 401 aa  198  3e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0042  sodium/hydrogen exchanger  32.52 
 
 		 607 aa  195  2e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126585  normal  0.101979 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04731  CPA1 family Na+/H+ antiporter  40.92 
 
 		 402 aa  194  3e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.281963  normal  0.831051 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  32.45 
 
 		 630 aa  193  7e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19170  NhaP-type Na+(K+)/H+ antiporter  27.8 
 
 		 640 aa  182  2e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.490991  normal  0.0684118 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4282  sodium/hydrogen exchanger  32.8 
 
 		 609 aa  181  4e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0640  CPA1 family Na+/H+ antiporter  42.53 
 
 		 421 aa  173  1e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1318  TrkA-N domain protein  32.65 
 
 		 628 aa  171  4e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  29.83 
 
 		 626 aa  160  6e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3821  sodium/hydrogen exchanger  38.42 
 
 		 407 aa  147  4.0000000000000006e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1079  potassium/proton antiporter  33.53 
 
 		 610 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3728  sodium/hydrogen exchanger  30 
 
 		 496 aa  113  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1590  potassium/proton antiporter  24.28 
 
 		 498 aa  111  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.609323  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3191  potassium/proton antiporter  27.71 
 
 		 580 aa  108  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.943195  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0657  potassium/proton antiporter  26.99 
 
 		 597 aa  108  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0833853 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0021  sodium/hydrogen exchanger  28.21 
 
 		 484 aa  103  8e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0846  transporter-associated region:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  29.14 
 
 		 588 aa  103  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3438  potassium/proton antiporter  31.27 
 
 		 616 aa  101  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0827  sodium/hydrogen exchanger  28.47 
 
 		 605 aa  100  9e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0583075 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0122  sodium/hydrogen exchanger  27.37 
 
 		 570 aa  99  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2276  potassium/proton antiporter  27.74 
 
 		 581 aa  99  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0543146  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0500  sodium/hydrogen exchanger  30.36 
 
 		 608 aa  98.2  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0245914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002210  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  26.22 
 
 		 581 aa  96.7  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.90325  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0762  potassium/proton antiporter  25.44 
 
 		 576 aa  95.5  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7379  potassium/proton antiporter  28.24 
 
 		 597 aa  95.5  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>