267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5176 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5176  amidohydrolase  100 
 
 		 686 aa  1371    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.167618  normal  0.830849 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3211  amidohydrolase  40.96 
 
 		 680 aa  525  1e-147  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.361649  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0535  amidohydrolase family protein  36.22 
 
 		 672 aa  399  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3085  amidohydrolase family protein  35.29 
 
 		 694 aa  397  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2681  amidohydrolase  35.62 
 
 		 692 aa  369  1e-101  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.398807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2416  amidohydrolase  34.26 
 
 		 702 aa  346  6e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0066037  normal  0.0385776 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0971  amidohydrolase 3  30.78 
 
 		 666 aa  243  9e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.59323  normal  0.0406107 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2344  amidohydrolase  31.54 
 
 		 485 aa  158  3e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.684912  normal  0.818181 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  29.45 
 
 		 1005 aa  156  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3066  amidohydrolase  29.15 
 
 		 490 aa  151  4e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2556  amidohydrolase  28.14 
 
 		 483 aa  148  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2922  amidohydrolase  30.65 
 
 		 511 aa  139  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1774  amidohydrolase  30.75 
 
 		 1014 aa  139  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0234293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2410  amidohydrolase  29.48 
 
 		 438 aa  139  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0002152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1105  amidohydrolase  27.79 
 
 		 478 aa  137  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.310318 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2365  amidohydrolase  31.08 
 
 		 470 aa  136  9.999999999999999e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1790  amidohydrolase  27.42 
 
 		 440 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2881  amidohydrolase  28.2 
 
 		 819 aa  126  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1775  amidohydrolase  29.74 
 
 		 1010 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0563559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2661  amidohydrolase  27.65 
 
 		 484 aa  117  7.999999999999999e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1186  amidohydrolase  25.82 
 
 		 512 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000825037 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5049  amidohydrolase  27.23 
 
 		 1031 aa  115  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.424824  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  28.04 
 
 		 1059 aa  114  4.0000000000000004e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11210  amidohydrolase  29.82 
 
 		 456 aa  113  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.170748  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3381  amidohydrolase  25.12 
 
 		 455 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.571146 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2093  amidohydrolase  27.22 
 
 		 568 aa  108  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.351411  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0009  amidohydrolase  26.85 
 
 		 1060 aa  108  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2230  hypothetical protein  27.17 
 
 		 1042 aa  107  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.752909  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1644  amidohydrolase  27.17 
 
 		 1042 aa  107  7e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0718903  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5309  amidohydrolase  25.26 
 
 		 543 aa  107  7e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.700694  normal  0.749654 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1717  amidohydrolase  26.94 
 
 		 1040 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.654125  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1901  amidohydrolase  23.28 
 
 		 1084 aa  105  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3987  amidohydrolase  27.07 
 
 		 435 aa  105  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.589739 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0013  amidohydrolase  26.1 
 
 		 1067 aa  104  7e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0458  amidohydrolase  28.82 
 
 		 1138 aa  102  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.455594 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0010  amidohydrolase  24.56 
 
 		 1066 aa  102  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0594  amidohydrolase  28.85 
 
 		 480 aa  100  7e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251478 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0011  amidohydrolase  25.32 
 
 		 1062 aa  100  8e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0957331 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  25.75 
 
 		 426 aa  100  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0015  amidohydrolase  25.68 
 
 		 598 aa  100  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0009  amidohydrolase  25.28 
 
 		 1062 aa  99.4  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0015  amidohydrolase  25.28 
 
 		 1062 aa  99.8  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0180602 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0015  amidohydrolase  25.28 
 
 		 1062 aa  99.4  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000711997 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2801  amidohydrolase  23.11 
 
 		 585 aa  99.4  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0268  amidohydrolase  24.23 
 
 		 451 aa  98.6  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.863034  normal  0.27554 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0011  amidohydrolase  25.23 
 
 		 1062 aa  98.6  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0011  amidohydrolase  24.89 
 
 		 1062 aa  99  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000193716 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  26.05 
 
 		 430 aa  96.7  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  27.06 
 
 		 426 aa  96.7  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  26.85 
 
 		 432 aa  96.3  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0019  amidohydrolase  24.46 
 
 		 1062 aa  95.9  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000934915 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2573  amidohydrolase family protein  24.59 
 
 		 1071 aa  93.2  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186395  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2475  amidohydrolase  29.3 
 
 		 397 aa  93.2  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0618  amidohydrolase  27.2 
 
 		 496 aa  92.4  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210154 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5427  amidohydrolase  24.78 
 
 		 432 aa  91.7  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0808338 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  22.58 
 
 		 407 aa  91.7  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  26.76 
 
 		 431 aa  91.3  6e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  25.26 
 
 		 440 aa  90.9  7e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4683  amidohydrolase  23.77 
 
 		 540 aa  88.6  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.524351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  26.64 
 
 		 433 aa  88.6  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  25.59 
 
 		 455 aa  87.8  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  23.53 
 
 		 426 aa  86.7  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  23.83 
 
 		 444 aa  87  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0258  amidohydrolase  24.01 
 
 		 441 aa  85.9  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0639139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2826  amidohydrolase  28.48 
 
 		 461 aa  86.3  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00342984  normal  0.0235152 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  24.51 
 
 		 470 aa  84  0.000000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  26.05 
 
 		 438 aa  83.2  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  24.24 
 
 		 400 aa  83.6  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  23.13 
 
 		 459 aa  82.8  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  25.16 
 
 		 433 aa  83.2  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  26.87 
 
 		 423 aa  82  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  22.77 
 
 		 444 aa  81.3  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1680  amidohydrolase  23.7 
 
 		 1062 aa  80.9  0.00000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.345185  normal  0.0835555 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0420  amidohydrolase  24.03 
 
 		 418 aa  80.1  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1413  amidohydrolase  27.56 
 
 		 423 aa  79.3  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5667  amidohydrolase:amidohydrolase-like  23.25 
 
 		 529 aa  79  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4905  amidohydrolase  28.86 
 
 		 381 aa  78.6  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0270368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  24.56 
 
 		 445 aa  77.8  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  25.11 
 
 		 411 aa  77.4  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  25.42 
 
 		 413 aa  77  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  25.38 
 
 		 419 aa  76.6  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  23.98 
 
 		 437 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  26.56 
 
 		 425 aa  76.3  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  25.56 
 
 		 421 aa  75.9  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  22.71 
 
 		 426 aa  75.1  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  22.42 
 
 		 433 aa  74.7  0.000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5063  amidohydrolase  28.86 
 
 		 381 aa  73.9  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304888  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  24.52 
 
 		 413 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  24.79 
 
 		 413 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  24.34 
 
 		 422 aa  73.2  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  25.27 
 
 		 405 aa  73.6  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  23.13 
 
 		 430 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  25.42 
 
 		 412 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  25.34 
 
 		 419 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  25.42 
 
 		 416 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0331  Imidazolonepropionase  23.92 
 
 		 448 aa  73.2  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1275  amidohydrolase  21.99 
 
 		 415 aa  72.8  0.00000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4125  amidohydrolase  25.29 
 
 		 409 aa  72.4  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  25.71 
 
 		 421 aa  72.4  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  24.77 
 
 		 426 aa  71.2  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>